Šablon:LORECSListIntro

Enzim: Prihvaćeno ime molekule, u skladu sa međunarodno prihvaćenom nomenklaturom^[1]^[2] i bibliografskim referencama. (Za dalje čitanje: pogledati sekciju "Nomenklatura" u članku "Restrikcijski enzim".)
PDB kod: Kod korišten da identificira strukturu proteina u PDB, koja je baza podataka proteinskih struktura. 3D atomska struktura proteina donosi visoko vrijedne informacije za razumijevanjee intimate detalla njihovog mehanizma akcije.^[3]^[4]
Izvor: Organizam koji prirodno proizvodi enzim.
Sekvenca prepoznavanja: Sekvenca gdje enzim prepoznaje segment DNK za koji se specifično veže.
Rez:Mjesto djelovanja restrikcijskog enzima i DNK produkta siječenja. Sekvenca prepoznavanja i mjesto reza se obično poklapaju, ali ponekad mjesto reza može biti desetak nukleotida dalje od mjesta prepoznavanja.^[5]^[6]
Izoshizomeri i neoshizomeri: Izoshizomer jeste enzim koji prepoznaje istu sekvencu kao sljedeću. Neoshizomer je specijalni tip izoshizomera koji prepoznaje istu sekvencu kao drugu, ali reže na drugačiji način. Za svaki enzim je naznačen maksimalni broj od 8-10 najčešćih izoshizomera, ali ih može biti i više. Neoshizomeri su prikazani boldirano u zelenoj boji fonta (tj. BamHI). Kad je prikazano "None on date", znači da tamo, u bazama podataka nisu zabilježeni izoshizomeri o tom podatku sa jasno definiranim mjestom rezanja. Izoshizomeri su označeni bijelim fontom na sivoj podlozi i korespondiraju sa enzimima koji nisu na prikazanim spiskovima:

EcoR70I

Dokumentacija šablona

[napravi]

^ Smith HO, Nathans D (decembar 1973). "Letter: A suggested nomenclature for bacterial host modification and restriction systems and their enzymes". J. Mol. Biol. 81 (3): 419–23. doi:10.1016/0022-2836(73)90152-6. PMID 4588280.
^ Roberts RJ, Belfort M, Bestor T, Bhagwat AS, Bickle TA, Bitinaite J, Blumenthal RM, Degtyarev SKh, Dryden DT, Dybvig K, Firman K, Gromova ES, Gumport RI, Halford SE, Hattman S, Heitman J, Hornby DP, Janulaitis A, Jeltsch A, Josephsen J, Kiss A, Klaenhammer TR, Kobayashi I, Kong H, Krüger DH, Lacks S, Marinus MG, Miyahara M, Morgan RD, Murray NE, Nagaraja V, Piekarowicz A, Pingoud A, Raleigh E, Rao DN, Reich N, Repin VE, Selker EU, Shaw PC, Stein DC, Stoddard BL, Szybalski W, Trautner TA, Van Etten JL, Vitor JM, Wilson GG, Xu SY (april 2003). "A nomenclature for restriction enzymes, DNA methyltransferases, homing endonucleases and their genes". Nucleic Acids Res. 31 (7): 1805–12. doi:10.1093/nar/gkg274. PMC 152790. PMID 12654995.CS1 održavanje: više imena: authors list (link)
^ Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko, Lubert Stryer; Web content by Neil D. Clarke (2002). "3. Protein Structure and Function". Biochemistry. San Francisco: W. H. Freeman. ISBN 0-7167-4684-0. Upotreblja se zastarjeli parametar |chapterurl= (pomoć)CS1 održavanje: više imena: authors list (link)
^ Anfinsen C.B. (1973). "Principles that Govern the Folding of Protein Chains". Science. 181 (4096): 223–30. doi:10.1126/science.181.4096.223. PMID 4124164.
^ Kessler C, Manta V (august 1990). "Specificity of restriction endonucleases and DNA modification methyltransferases a review (Edition 3)". Gene. 92 (1–2): 1–248. doi:10.1016/0378-1119(90)90486-B. PMID 2172084.
^ Pingoud A, Jeltsch A (septembar 2001). "Structure and function of type II restriction endonucleases". Nucleic Acids Res. 29 (18): 3705–27. doi:10.1093/nar/29.18.3705. PMC 55916. PMID 11557805.

[pmid4588280-1] Smith HO, Nathans D (decembar 1973). "Letter: A suggested nomenclature for bacterial host modification and restriction systems and their enzymes". J. Mol. Biol. 81 (3): 419–23. doi:10.1016/0022-2836(73)90152-6. PMID 4588280.

[pmid12654995-2] Roberts RJ, Belfort M, Bestor T, Bhagwat AS, Bickle TA, Bitinaite J, Blumenthal RM, Degtyarev SKh, Dryden DT, Dybvig K, Firman K, Gromova ES, Gumport RI, Halford SE, Hattman S, Heitman J, Hornby DP, Janulaitis A, Jeltsch A, Josephsen J, Kiss A, Klaenhammer TR, Kobayashi I, Kong H, Krüger DH, Lacks S, Marinus MG, Miyahara M, Morgan RD, Murray NE, Nagaraja V, Piekarowicz A, Pingoud A, Raleigh E, Rao DN, Reich N, Repin VE, Selker EU, Shaw PC, Stein DC, Stoddard BL, Szybalski W, Trautner TA, Van Etten JL, Vitor JM, Wilson GG, Xu SY (april 2003). "A nomenclature for restriction enzymes, DNA methyltransferases, homing endonucleases and their genes". Nucleic Acids Res. 31 (7): 1805–12. doi:10.1093/nar/gkg274. PMC 152790. PMID 12654995.CS1 održavanje: više imena: authors list (link)

[3] Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko, Lubert Stryer; Web content by Neil D. Clarke (2002). "3. Protein Structure and Function". Biochemistry. San Francisco: W. H. Freeman. ISBN 0-7167-4684-0. Upotreblja se zastarjeli parametar |chapterurl= (pomoć)CS1 održavanje: više imena: authors list (link)

[4] Anfinsen C.B. (1973). "Principles that Govern the Folding of Protein Chains". Science. 181 (4096): 223–30. doi:10.1126/science.181.4096.223. PMID 4124164.

[pmid2172084-5] Kessler C, Manta V (august 1990). "Specificity of restriction endonucleases and DNA modification methyltransferases a review (Edition 3)". Gene. 92 (1–2): 1–248. doi:10.1016/0378-1119(90)90486-B. PMID 2172084.

[pmid11557805-6] Pingoud A, Jeltsch A (septembar 2001). "Structure and function of type II restriction endonucleases". Nucleic Acids Res. 29 (18): 3705–27. doi:10.1093/nar/29.18.3705. PMC 55916. PMID 11557805.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]