Asun

Asun
Identifikatori
Aliasi	INTS13
Vanjski ID-jevi	OMIM: 615079 MGI: 1918427 HomoloGene: 10043 GeneCards: INTS13
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 12 (čovjek)
Kraj	26,938,326 bp
Lokacija gena (miš)
Hrom.	Hromosom 6 (miš)
Kraj	146,577,835 bp
Obrazac RNK ekspresije
	Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine;
Ćelijska komponenta	• citoplazma; • nukleoplazma; • jedro;
Biološki proces	• centrosome localization; • regulation of fertilization; • flagellated sperm motility; • GO:0043148 mitotic spindle organization; • ćelijski ciklus; • protein localization to nuclear envelope; • regulation of mitotic cell cycle; • Ćelijska dioba; • snRNA transcription by RNA polymerase II;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	55726
	71177
	ENSG00000064102
	ENSMUSG00000040250
	Q9NVM9
	Q8QZV7
	NM_018164
	NM_138757
	NP_060634
	NP_620096; NP_001349035; NP_001349036; NP_001349037
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek	Pogledaj/uredi – miš

Razdvojni proteinski homolog (Asun), znan i kao homologni regulator Mat89Bb ćelijskog ciklusa je protein koji je kod ljudi kodiran genom Asun.^[5]^[6]

Analizom genomskih sekvenci, Bourdon et al. (2002) mapirali su gen ASUN na hromosomu 12, sekvenca p12-p11. Utvrdili su da ASUN gen sadrži 17 egzona i da ima oko 32,8 kb.^[7] Koristeći kombinovanu uporednu genomsku hibridizaciju i ekspresijsku analizu sekvence EST, za identifikaciju gena u regiji hromosoma 12 pojačanog u seminomima i u ćelijskoj liniji karcinoma jajnika u poređenju sa normalnim tkivom, Bourdon et al. (2002) identificirali su ASUN, koji su označili kao GCT1. RT-PCR analiza otkrila je ekspresiju ASUN-a u svih 16 pregledanih normalnih ljudskih tkiva. Ekspresija ASUN-a bila je povišena u većini seminoma u usporedbi s normalnim sjemenicima. Pretražujući baze podataka, Anderson et al. (2009) identificirali su ASUN-ske ortologe u Drosophila i C. elegans. Kod vinskih mušica, činilo se da je ekspresija Asuna specifična za zametnu liniju.^[8]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 706 aminokiselina, a molekulska težina 80.225 Da.^[9].

10	20	30	40	50
MKIFSESHKT	VFVVDHCPYM	AESCRQHVEF	DMLVKNRTQG	IIPLAPISKS
LWTCSVESSM	EYCRIMYDIF	PFKKLVNFIV	SDSGAHVLNS	WTQEDQNLQE
LMAALAAVGP	PNPRADPECC	SILHGLVAAV	ETLCKITEYQ	HEARTLLMEN
AERVGNRGRI	ICITNAKSDS	HVRMLEDCVQ	ETIHEHNKLA	ANSDHLMQIQ
KCELVLIHTY	PVGEDSLVSD	RSKKELSPVL	TSEVHSVRAG	RHLATKLNIL
VQQHFDLAST	TITNIPMKEE	QHANTSANYD	VELLHHKDAH	VDFLKSGDSH
LGGGSREGSF	KETITLKWCT	PRTNNIELHY	CTGAYRISPV	DVNSRPSSCL
TNFLLNGRSV	LLEQPRKSGS	KVISHMLSSH	GGEIFLHVLS	SSRSILEDPP
SISEGCGGRV	TDYRITDFGE	FMRENRLTPF	LDPRYKIDGS	LEVPLERAKD
QLEKHTRYWP	MIISQTTIFN	MQAVVPLASV	IVKESLTEED	VLNCQKTIYN
LVDMERKNDP	LPISTVGTRG	KGPKRDEQYR	IMWNELETLV	RAHINNSEKH
QRVLECLMAC	RSKPPEEEER	KKRGRKREDK	EDKSEKAVKD	YEQEKSWQDS
ERLKGILERG	KEELAEAEII	KDSPDSPEPP	NKKPLVEMDE	TPQVEKSKGP
VSLLSLWSNR	INTANSRKHQ	EFAGRLNSVN	NRAELYQHLK	EENGMETTEN
GKASRQ

C: Cistein

D: Asparaginska kiselina

E: Glutaminska kiselina

F: Fenilalanin

G: Glicin

H: Histidin

I: Izoleucin

K: Lizin

L: Leucin

M: Metionin

N: Asparagin

P: Prolin

Q: Glutamin

R: Arginin

S: Serin

T: Treonin

V: Valin

W: Triptofan

Y: Tirozin

Funkcija gena[uredi | uredi izvor]

Lee et al. (2005) otkrili su da je degradacija Mat89bb poremetila brzo odvijanje prelaza S faza–M faza karakteristično za rane embrione Drosophila i Xenopus. U HeLa ćelijama, poremetila je kasniju fazu mitoze i rezultiralo višejedrnim ćelijama.^[10]

Jodoin et al. (2012) otkrili su da je razgradnja ASUN-a u ćelijskim linijama ljudi smanjila perijedarnu lokalizaciju dineina, što je bitno za pravilno vezivanje centrosoma na jedarnu ovojnicu pri G2/M. Posljedično, dovela je do mitotskih defekata, uključujući odvajanje jedro-centrosom, abnormalna vretena i višejedrne ćelije. Također rezultirala je pogrešnom lokalizacijom dineinskog adaptera LIS1 (PAFAH1B1). Analiza koimunoprecipitacije pokazala je da je ASUN direktno stupio u interakciju s LIS1, ali ne i s dineinom, te posredovao perijedarno obogaćivanje LIS1 na G2/M.^[11]

Životinjski model[uredi | uredi izvor]

Anderson et al. (2009) otkrili su da je nokautiranje Asuna u Drosophila uzrokovalo defekt u spermatogenezi, sa zaustavljanjem spermatocita tokom profaze mejoze I i defektima u sprezi jedro-centrosom. Spermatociti koji su prebrodili zadržavanje pokazali su nedostatke u sastavu mejotskog vretena, segregaciji hromosoma i citokinezi. U Asun mutantnim spermatocitima i spermatidama, kompleksi dinein-dinaktin, koji posreduju u interakcijama jedro-centrosom/bazno tijelo, nisu se uspjeli lokalizirati na površini jedra.

Jodoin et al. (2012) otkrili su da je ekspresija Asun-a zametne linije miša spasila neplodnost i pogrešnu lokalizaciju dineina u mutantnim Asun drozofilama.

Reference[uredi | uredi izvor]

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000064102 - Ensembl, maj 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000040250 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Bourdon V, Naef F, Rao PH, Reuter V, Mok SC, Bosl GJ, Koul S, Murty VV, Kucherlapati RS, Chaganti RS (Nov 2002). "Genomic and expression analysis of the 12p11-p12 amplicon using EST arrays identifies two novel amplified and overexpressed genes". Cancer Res. 62 (21): 6218–23. PMID 12414650.
^ "Entrez Gene: C12orf11 chromosome 12 open reading frame 11".
^ Bourdon, V., Naef, F., Rao, P. H., Reuter, V., Mok, S. C., Bosl, G. J., Koul, S., Murty, V. V. V. S., Kucherlapati, R. S., Chaganti, R. S. K. Genomic and expression analysis of the 12p11-p12 amplicon using EST arrays identifies two novel amplified and overexpressed genes. Cancer Res. 62: 6218-6223, 2002. PubMed: 12414650
^ Anderson, M. A., Jodoin, J. N., Lee, E., Hales, K. G., Hays, T. S., Lee, L. A. Asunder is a critical regulator of dynein-dynactin localization during Drosophila spermatogenesis. Molec. Biol. Cell 20: 2709-2721, 2009. PubMed: 19357193
^ "UniProt, Q9NVM9". Pristupljeno 7. 8. 2021.
^ Lee, L. A., Lee, E., Anderson, M. A., Vardy, L., Tahinci, E., Ali, S. M., Kashevsky, H., Benasutti, M., Kirschner, M. W., Orr-Weaver, T. L. Drosophila genome-scale screen for PAN GU kinase substrates identifies Mat89Bb as a cell cycle regulator. Dev. Cell 8: 435-442, 2005. PubMed: 15737938
^ Jodoin, J. N., Shboul, M., Sitaram, P., Zein-Sabatto, H. Human Asunder promotes dynein recruitment and centrosomal tethering to the nucleus at mitotic entry. Molec. Biol. Cell 23: 4713-4724, 2012. PubMed: 23097494

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]

Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). "Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery". Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10.1101/gr.6.9.791. PMID 8889548.
Lee SY, Obata Y, Yoshida M, et al. (2003). "Immunomic analysis of human sarcoma". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100 (5): 2651–6. doi:10.1073/pnas.0437972100. PMC 151395. PMID 12601173.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). "Diversification of transcriptional modulation: Large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes". Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). "Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks". Cell. 127 (3): 635–48. doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000064102 - Ensembl, maj 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000040250 - Ensembl, maj 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid12414650-5] Bourdon V, Naef F, Rao PH, Reuter V, Mok SC, Bosl GJ, Koul S, Murty VV, Kucherlapati RS, Chaganti RS (Nov 2002). "Genomic and expression analysis of the 12p11-p12 amplicon using EST arrays identifies two novel amplified and overexpressed genes". Cancer Res. 62 (21): 6218–23. PMID 12414650.

[entrez-6] "Entrez Gene: C12orf11 chromosome 12 open reading frame 11".

[7] Bourdon, V., Naef, F., Rao, P. H., Reuter, V., Mok, S. C., Bosl, G. J., Koul, S., Murty, V. V. V. S., Kucherlapati, R. S., Chaganti, R. S. K. Genomic and expression analysis of the 12p11-p12 amplicon using EST arrays identifies two novel amplified and overexpressed genes. Cancer Res. 62: 6218-6223, 2002. PubMed: 12414650

[8] Anderson, M. A., Jodoin, J. N., Lee, E., Hales, K. G., Hays, T. S., Lee, L. A. Asunder is a critical regulator of dynein-dynactin localization during Drosophila spermatogenesis. Molec. Biol. Cell 20: 2709-2721, 2009. PubMed: 19357193

[UniProt-9] "UniProt, Q9NVM9". Pristupljeno 7. 8. 2021.

[10] Lee, L. A., Lee, E., Anderson, M. A., Vardy, L., Tahinci, E., Ali, S. M., Kashevsky, H., Benasutti, M., Kirschner, M. W., Orr-Weaver, T. L. Drosophila genome-scale screen for PAN GU kinase substrates identifies Mat89Bb as a cell cycle regulator. Dev. Cell 8: 435-442, 2005. PubMed: 15737938

[11] Jodoin, J. N., Shboul, M., Sitaram, P., Zein-Sabatto, H. Human Asunder promotes dynein recruitment and centrosomal tethering to the nucleus at mitotic entry. Molec. Biol. Cell 23: 4713-4724, 2012. PubMed: 23097494

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]