BCL9

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
BCL9
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2GL7, 2VP7, 2VPB, 2VPD, 2VPE, 2VPG, 3SL9

Identifikatori
AliasiBCL9
Vanjski ID-jeviOMIM: 602597 MGI: 1924828 HomoloGene: 3191 GeneCards: BCL9
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 1 (čovjek)
Hrom.Hromosom 1 (čovjek)[1]
Hromosom 1 (čovjek)
Genomska lokacija za BCL9
Genomska lokacija za BCL9
Bend1q21.2Početak147,541,501 bp[1]
Kraj147,626,216 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 3 (miš)
Hrom.Hromosom 3 (miš)[2]
Hromosom 3 (miš)
Genomska lokacija za BCL9
Genomska lokacija za BCL9
Bend3|3 F2.1Početak97,110,978 bp[2]
Kraj97,205,233 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija beta-catenin binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
GO:0001105 transcription coactivator activity
Ćelijska komponenta citoplazma
cis-Golgi network
Golđijev aparat
jedro
nukleoplazma
beta-catenin-TCF complex
Biološki proces skeletal muscle cell differentiation
canonical Wnt signaling pathway
Wnt-signalni put
somatic stem cell population maintenance
myotube differentiation involved in skeletal muscle regeneration
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway
beta-catenin-TCF complex assembly
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_004326

NM_029933

RefSeq (bjelančevina)

NP_004317

NP_084209

Lokacija (UCSC)Chr 1: 147.54 – 147.63 MbChr 3: 97.11 – 97.21 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

B-ćelijski protein CLL/limfoma 9 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom BCL9 sa hromosoma 1.[5][6]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 1.426 aminokiselina, a molekulska 149.290 težina Da.[7]

1020304050
MHSSNPKVRSSPSGNTQSSPKSKQEVMVRPPTVMSPSGNPQLDSKFSNQG
KQGGSASQSQPSPCDSKSGGHTPKALPGPGGSMGLKNGAGNGAKGKGKRE
RSISADSFDQRDPGTPNDDSDIKECNSADHIKSQDSQHTPHSMTPSNATA
PRSSTPSHGQTTATEPTPAQKTPAKVVYVFSTEMANKAAEAVLKGQVETI
VSFHIQNISNNKTERSTAPLNTQISALRNDPKPLPQQPPAPANQDQNSSQ
NTRLQPTPPIPAPAPKPAAPPRPLDRESPGVENKLIPSVGSPASSTPLPP
DGTGPNSTPNNRAVTPVSQGSNSSSADPKAPPPPPVSSGEPPTLGENPDG
LSQEQLEHRERSLQTLRDIQRMLFPDEKEFTGAQSGGPQQNPGVLDGPQK
KPEGPIQAMMAQSQSLGKGPGPRTDVGAPFGPQGHRDVPFSPDEMVPPSM
NSQSGTIGPDHLDHMTPEQIAWLKLQQEFYEEKRRKQEQVVVQQCSLQDM
MVHQHGPRGVVRGPPPPYQMTPSEGWAPGGTEPFSDGINMPHSLPPRGMA
PHPNMPGSQMRLPGFAGMINSEMEGPNVPNPASRPGLSGVSWPDDVPKIP
DGRNFPPGQGIFSGPGRGERFPNPQGLSEEMFQQQLAEKQLGLPPGMAME
GIRPSMEMNRMIPGSQRHMEPGNNPIFPRIPVEGPLSPSRGDFPKGIPPQ
MGPGRELEFGMVPSGMKGDVNLNVNMGSNSQMIPQKMREAGAGPEEMLKL
RPGGSDMLPAQQKMVPLPFGEHPQQEYGMGPRPFLPMSQGPGSNSGLRNL
REPIGPDQRTNSRLSHMPPLPLNPSSNPTSLNTAPPVQRGLGRKPLDISV
AGSQVHSPGINPLKSPTMHQVQSPMLGSPSGNLKSPQTPSQLAGMLAGPA
AAASIKSPPVLGSAAASPVHLKSPSLPAPSPGWTSSPKPPLQSPGIPPNH
KAPLTMASPAMLGNVESGGPPPPTASQPASVNIPGSLPSSTPYTMPPEPT
LSQNPLSIMMSRMSKFAMPSSTPLYHDAIKTVASSDDDSPPARSPNLPSM
NNMPGMGINTQNPRISGPNPVVPMPTLSPMGMTQPLSHSNQMPSPNAVGP
NIPPHGVPMGPGLMSHNPIMGHGSQEPPMVPQGRMGFPQGFPPVQSPPQQ
VPFPHNGPSGGQGSFPGGMGFPGEGPLGRPSNLPQSSADAALCKPGGPGG
PDSFTVLGNSMPSVFTDPDLQEVIRPGATGIPEFDLSRIIPSEKPSQTLQ
YFPRGEVPGRKQPQGPGPGFSHMQGMMGEQAPRMGLALPGMGGPGPVGTP
DIPLGTAPSMPGHNPMRPPAFLQQGMMGPHHRMMSPAQSTMPGQPTLMSN
PAAAVGMIPGKDRGPAGLYTHPGPVGSPGMMMSMQGMMGPQQNIMIPPQM
RPRGMAADVGMGGFSQGPGNPGNMMF

Funkcija[uredi | uredi izvor]

BCL9, zajedno sa svojim paralognim genom BCL9L (slično BCL9 ili BCL9.2), opsežno je proučavan zbog njihove uloge kofaktora transkripcije beta-katenina, osnovnih za transkripciju Wnt-signalizacija|Wnt-ciljnih gena]].[8]

Nedavni rad, koristeći miša (Mus musculus) i zebricu (Danio rerio) kao modelne organizme, identifikovao je drevnu ulogu BCL9 i BCL9L kao ključnih faktora potrebnih za razvoj srca.[9] Ovaj rad naglašava tkivno specifičnu prirodu mehanizma djelovanja Wnt/β-katenina i implicira promjene u BCL9 i BCL9L kod ljudskih urođenih srčanih mahana.

Pokazalo se da BCL9 i BCL9L učestvuju u drugim tkivno-specifičnim molekulskim mehanizmima, pokazujući da je njihova uloga u Wnt signalnoj kaskadi samo jedan aspekt njihovog načina djelovanja.[10]

Klinički značaj[uredi | uredi izvor]

B-ćelijskom akutnom limfoblastnom leukemijom. Može biti meta translokacije kod maligniteta B-ćelija s abnormalnostima 1q21. Prekomjerna ekspresija BCL9 može biti od patogenog značaja kod maligniteta B-ćelija.[6]

BCL9 i BCL9L su potencijalne kliničke mete za ljudske karcinome; naprimjer, promjene ekspresije gena koje oni promoviraju povezane su sa lošim ishodom kod kolorektumskog karcinoma.[11]

Poput BCL2, BCL3, BCL5, BCL6, BCL7A i BCL10, ima klinički značaj kod limfoma.

Uobičajene varijacije gena BCL9, koji se nalazi u distalnom području, daju rizik od shizofrenije i mogu biti povezane s bipolarnim poremećajem i velikim depresivnim poremećajem.[12]

BCL9, zajedno sa paralognim proteinom BCL9l i PYGO2, također ima citoplazmatske funkcije tokom razvoja zuba i posebno je važan za formiranje gleđi. Miševi kojima nedostaju i Pygo1 i Pygo2 ili oba Bcl9 i Bcl9l razvijaju zube, proces koji zahtijeva regulaciju transkripcije Wnt/β-katenina, ali caklina je strukturno neorganizirana i sadrži manje gvožđa od zuba kontrolnih miševa. Bcl9, Bcl9l i Pygo2 su prisutni u citoplazmi ameloblasta, ćelija koje luče proteine cakline, a nalaze se u tim ćelijama sa amelogeninom, glavnom komponentom cakline, kodirane genom AMELX, koji je već impliciran kao uzročni faktor amelogenesis imperfecta kod ljudi. Bcl9 stupa u interakciju s amelogeninom i proteinima uključenim u egzocitozu i vezikulski promet, što sugerira da ovi proteini funkcioniraju u prometu ili izlučivanju proteina cakline. Stoga, Bcl9, Bcl9l i Pygo2 imaju citoplazmatske funkcije različite od njihove uloge kofaktora transkripcije nizvodno od Wnt signalizacije.[13] Ovo novo otkriće moglo bi poboljšati razumijevanje liječenja karijesa kod ljudi.[14]

Srodni genetički poremećaji[uredi | uredi izvor]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000116128 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038256 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Willis TG, Zalcberg IR, Coignet LJ, Wlodarska I, Stul M, Jadayel DM, Bastard C, Treleaven JG, Catovsky D, Silva ML, Dyer MJ (Mar 1998). "Molecular cloning of translocation t(1;14)(q21;q32) defines a novel gene (BCL9) at chromosome 1q21". Blood. 91 (6): 1873–81. doi:10.1182/blood.V91.6.1873. PMID 9490669.
  6. ^ a b "Entrez Gene: BCL9 B-cell CLL/lymphoma 9".
  7. ^ "UniProt, O00512" (jezik: en.). Pristupljeno 8. 12. 2021.CS1 održavanje: nepoznati jezik (link)
  8. ^ Mosimann C, Hausmann G, Basler K (Apr 2009). "Beta-catenin hits chromatin: regulation of Wnt target gene activation". Nature Reviews. Molecular Cell Biology. 10 (4): 276–86. doi:10.1038/nrm2654. PMID 19305417. S2CID 7602580.
  9. ^ Cantù, Claudio; Felker, Anastasia; Zimmerli, Dario; Prummel, Karin; Cabello, Elena; Chiavacci, Elena; Mendez-Acevedo, Kevin; Kirchgeorg, Lucia; Sibylle, Burger; Ripoll, Jorge; Valenta, Tomas; Hausmann, George; Vilain, Nathalie; Aguet, Michel; Burger, Alexa; Panáková, Daniela; Basler, Konrad; Mosimann, Christian (1. 11. 2018). "Mutations in Bcl9 and Pygo genes cause congenital heart defects by tissue-specific perturbation of Wnt/β-catenin signaling". Genes & Development. 32 (21–22): 1443–1458. doi:10.1101/gad.315531.118. PMC 6217730. PMID 30366904.
  10. ^ Cantù C, Zimmerli D, Hausmann G, Valenta T, Moor A, Aguet M, Basler K (Sep 2014). "Pax6-dependent, but β-catenin-independent, function of Bcl9 proteins in mouse lens development". Genes & Development. 28 (17): 1879–84. doi:10.1101/gad.246140.114. PMC 4197948. PMID 25184676.
  11. ^ Moor AE, Anderle P, Cantù C, Rodriguez P, Wiedemann N, Baruthio F, Deka J, André S, Valenta T (1. 12. 2015). "BCL9/9L-β-catenin Signaling is Associated With Poor Outcome in Colorectal Cancer". EBioMedicine. 2 (12): 1932–1943. doi:10.1016/j.ebiom.2015.10.030. PMC 4703711. PMID 26844272.
  12. ^ Li J, Zhou G, Ji W, Feng G, Zhao Q, Liu J, Li T, Li Y, Chen P, Zeng Z, Wang T, Hu Z, Zheng L, Wang Y, Shen Y, He L, Shi Y (2011). "Common variants in the BCL9 gene conferring risk of schizophrenia". Archives of General Psychiatry. 68 (3): 232–40. doi:10.1001/archgenpsychiatry.2011.1. PMID 21383261.
  13. ^ Cantù C, Pagella P, Shajiei TD, Zimmerli D, Valenta T, Hausmann G, Basler K, Mitsiadis TA (7. 2. 2017). "A cytoplasmic role of Wnt/β-catenin transcriptional cofactors Bcl9, Bcl9l, and Pygopus in tooth enamel formation". Sci. Signal. 10 (465): eaah4598. doi:10.1126/scisignal.aah4598. ISSN 1945-0877. PMID 28174279. S2CID 6845295.
  14. ^ "Mutated genes lead to tooth enamel defects that increase risk of caries". News-Medical.net. 7. 2. 2017. Pristupljeno 8. 2. 2017.

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi[uredi | uredi izvor]