BinCARD

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
BinCARD
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

4DWN, 4FH0

Identifikatori
AliasiCARD19
Vanjski ID-jeviOMIM: 617726 MGI: 1915730 HomoloGene: 12269 GeneCards: CARD19
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 9 (čovjek)
Hrom.Hromosom 9 (čovjek)[1]
Hromosom 9 (čovjek)
Genomska lokacija za BinCARD
Genomska lokacija za BinCARD
Bend9q22.31Početak93,096,217 bp[1]
Kraj93,113,283 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 13 (miš)
Hrom.Hromosom 13 (miš)[2]
Hromosom 13 (miš)
Genomska lokacija za BinCARD
Genomska lokacija za BinCARD
Bend13|13 A5Početak49,356,426 bp[2]
Kraj49,369,513 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija• CARD domain binding
• GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta• endoplasmic reticulum membrane
• citosol
• jedro
• membrana
• integral component of membrane
• mitochondrial membranes
• Endoplazmatski retikulum
• mitohondrija
Biološki proces• negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez

84270

68480

Ensembl

ENSG00000165233

ENSMUSG00000037960

UniProt

Q96LW7

Q9D1I2

RefSeq (mRNK)

NM_032310
NM_001318010
NM_001318011

NM_026738

RefSeq (bjelančevina)

NP_001304939
NP_001304940
NP_115686

NP_081014

Lokacija (UCSC)Chr 9: 93.1 – 93.11 MbChr 13: 49.36 – 49.37 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Bcl10 interaktivni protein CARD, znan i kao BinCARD, jest protein koji je kod ljudi kodiran genom C9orf89 sa hromosoma 9.[5][6] BinCARD je član superporodice proteina ćelijske smrti koji sadrže kaspazmi domen (CARD).[7] Ovi proteini reguliraju apoptozu imunski odgovor, inhibirajući Bcl10, čime impliciraju učešće u bolestima na bazi disfunkcije Bcl10.[7][8]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 228 aminokiselina, а molekulska težina 25.589 Da.[9]

1020304050
MTDQTYCDRLVQDTPFLTGHGRLSEQQVDRIILQLNRYYPQILTNKEAEK
FRNPKASLRVRLCDLLSHLQRSGERDCQEFYRALYIHAQPLHSRLPSRHA
LRKFHITNHACLVLARGGHPSLPLMAWMSSMTTQVCCSPGLASPLASAPP
QRPPSGPEGRVWQAQAVQMLVSVSHFLPLPPSLSHGSFHTAWGILYVHSC
PSFSNLIPRGSLHVCVDSNLVPTAAWRS

Struktura[uredi | uredi izvor]

BinCARD, kao protein koji sadrži CARD, član je natporodice smrtnog domena koja dijeli snop od šest spirala.[7] Kod ljudi, protein ima dvije alternativno prerađene izoforme: BinCARD-1 i BinCARD-2. Obje izoforme dijele identične sekvence do ostatka 101, koji uključuje CARD domen i egzone 1 do 3. Duža izoforma, BinCARD-1, ima produženi egzon 3, dok kraća BinCARD-2 ima dodatni transmembranski domen.[7] Konzervirani CARD domen, u svom izvornom obliku, ima tri cisteina: Cys7, Cys77 i Cys63, od kojih Cys7 i Cys77 tvore disulfidnu vezu, a Cys63 postaje cistein-sulfenska kiselina kada se oksidira.[7][8]

Funkcija[uredi | uredi izvor]

BinCARD protein je član natporodice smrtnog domena, koja je poznata po regulaciji apoptoza i imunskom odgovoru.[7] BinCARD je negativni regulator koji se veže za Bcl10 i na taj način blokira fosforilaciju, učinkovito inhibirajući Bcl10 da aktivira jedarni faktor-κB (NF-κB).[7][8] Konkretno, izoforma BinCARD-1 sadrži prošireni C-terminal koji veže Bcl10, iako se uglavnom lokalizira u jedru.[7][8] Druga izoforma, BinCARD-2, je obilnije eksprimirana i lokalizira se i u endoplazmatskom retikulumu i u mitohondrijama. Očekuje se da ova izoforma doprinosi apoptozi, putem redoks procesa, jer se njena tri modificirana cisteina mogu oksidirati reaktivnim vrstama kisika (ROS) da stimuliraju urođeni imunski odgovor.[8]

Klinički značaj[uredi | uredi izvor]

Mutacije u BinCARD i ostalim proteinima sa proteins domenimaCARD vezane su za Bcl10-srodne bolesti, uključujući limfom limfoidnog tkiva povezanog sa sluznicom.[8] Pokazano je da Bcl10 inducira apoptozu i aktivira NF-kappaB. Zabilježeno je da ovaj protein stupa u interakciju s drugim proteinima koji sadrže CARD domen, uključujući CARD9, 10, 11 i 14, za koje se smatra da funkcioniraju kao uzvodni regulatori u signalizaciji NF-kappaB. U skladu s tim, protein BinCARD ima ključnu ulogu u regulaciji apoptoznih funkcija.

Zbog svojih važnih bioloških i fizioloških funkcija, apoptoza je ključna u mnogim kliničkim sastojcima. Tokom normalnih embrionskih procesa ili tokom ozljede ćelijaa (kao što je ishemijsko-reperfuzijska ozljeda prilikom srčanih napada i moždanih udara) ili tokom razvoja i procesa u karcinome, apoptozna ćelija prolazi strukturne promjene, uključujući skupljanje ćelija, miješanje plazmamembrana, jedarnu kondenzaciju i fragmentaciju DNK i jedro. Nakon toga slijedi fragmentacija u apoptozna tijela, koja se brzo uklanjaju fagociti, čime se sprječava upalna reakcija.[10] To je način ćelijske smrti definiran karakterističnim morfološkim, biohemijskim i molekulnim promjenama. Prvo je opisan kao "nekroza skupljanja", a zatim je ovaj termin zamijenjen apoptozom kako bi se naglasila njegova uloga suprotna mitozi u kinetici tkiva. U kasnijim fazama apoptoze, cijela ćelija postaje fragmentirana, tvoreći niz apoptoznih tijela vezanih plazmamembranom, koja sadrže jedarne i ili citoplazmatske elemente. Ultrastrukturni izgled nekroza je prilično različit, a glavne karakteristike su mitohondrijsko oticanje, razgradnja plazmamembrane i ćelijski raspad. Apoptoza se javlja u mnogim fiziološkim i patološkim procesima. On ima važnu ulogu tokom embrionskog razvoja kao programirana ćelijska smrt i prati razne normalne involucijske procese u kojima služi kao mehanizam za uklanjanje "neželjenih" ćelija.

BinCARD navodno potiskuje aktivaciju NF-kappa B, induciranu BCL10, time smanjujući količine fosforiliranog Bcl10. Nakon toga, mutacije u ostatku Leu17 ili Leu65, koji je visoko konzerviran u CARD-u, ukida inhibitorne učinke BinCARD-a na aktivaciju NF-kappa B i fosforilaciju Bcl10 izazvanu Bcl10. Nadalje, ekspresija BinCARD inhibirala fosforilaciju Bcl10, induciranu aktivacijskim signalom T-ćelija. Ovi rezultati sugeriraju da BinCARD stupa u interakciju s Bcl10, kako bi inhibirao Bcl10 posredovanu aktivaciju NF-kappe B i potisnuo fosforilaciju Bcl10.[8] U skladu s tim, ti procesi reguliraju apoptozu tokom kliničkih procesa, kao što su kancerski i ishemijsko-reperfuzijske ozljede.

Interakcije[uredi | uredi izvor]

Pokazalo se da BinCARD ima interakcije sa:

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000165233 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000037960 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ UniProt: Q96LW7
  6. ^ "Entrez Gene: chromosome 9 open reading frame 89".
  7. ^ a b c d e f g h Chen KE, Richards AA, Caradoc-Davies TT, Vajjhala PR, Robin G, Lua LH, Hill JM, Schroder K, Sweet MJ, Kellie S, Kobe B, Martin J (maj 2013). "The structure of the caspase recruitment domain of BinCARD reveals that all three cysteines can be oxidized" (PDF). Acta Crystallographica Section D. 69 (Pt 5): 774–84. doi:10.1107/S0907444913001558. hdl:10072/171950. PMID 23633586.
  8. ^ a b c d e f g h Woo HN, Hong GS, Jun JI, Cho DH, Choi HW, Lee HJ, Chung CW, Kim IK, Jo DG, Pyo JO, Bertin J, Jung YK (Dec 2004). "Inhibition of Bcl10-mediated activation of NF-kappa B by BinCARD, a Bcl10-interacting CARD protein". FEBS Letters. 578 (3): 239–44. doi:10.1016/j.febslet.2004.10.094. PMID 15637807. S2CID 84325562.
  9. ^ "UniProt, Q96LW7". Pristupljeno 6. 9. 2021.
  10. ^ Kerr JF, Wyllie AH, Currie AR (Aug 1972). "Apoptosis: a basic biological phenomenon with wide-ranging implications in tissue kinetics". British Journal of Cancer. 26 (4): 239–57. doi:10.1038/bjc.1972.33. PMC 2008650. PMID 4561027.

Vanjski linkovi[uredi | uredi izvor]

Portal iconPortal Biologija
Preuzeto iz "https://bs.wikipedia.org/w/index.php?title=BinCARD&oldid=3511428"