Idi na sadržaj

C1GALT1

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
C1GALT1
Identifikatori
AliasiC1GALT1
Vanjski ID-jeviOMIM: 610555 MGI: 2151071 HomoloGene: 10599 GeneCards: C1GALT1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 7 (čovjek)
Hrom.Hromosom 7 (čovjek)[1]
Hromosom 7 (čovjek)
Genomska lokacija za C1GALT1
Genomska lokacija za C1GALT1
Bend7p22.1-p21.3Početak7,156,934 bp[1]
Kraj7,248,616 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 6 (miš)
Hrom.Hromosom 6 (miš)[2]
Hromosom 6 (miš)
Genomska lokacija za C1GALT1
Genomska lokacija za C1GALT1
Bend6|6 A1Početak7,844,842 bp[2]
Kraj7,875,687 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija glycosyltransferase activity
aktivnost sa transferazom
glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase activity
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje iona metala
Ćelijska komponenta integral component of membrane
Golđijeva membrana
membrana
Biološki proces multicellular organism development
GO:0033578, GO:0033577, GO:0033575, GO:0033576 protein glycosylation
Ćelijska diferencijacija
O-glycan processing, core 1
Angiogeneza
intestinal epithelial cell development
Nefrogeneza
O-glycan processing
protein O-linked glycosylation
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_020156

NM_052993

RefSeq (bjelančevina)

NP_064541

NP_443719

Lokacija (UCSC)Chr 7: 7.16 – 7.25 MbChr 6: 7.84 – 7.88 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš
Jezgrena 1 sintaza, glikoprotein-N-acetilgalaktozamin
3-beta-galaktoziltransferaza, 1
Identifikatori
SimbolC1GALT1
NCBI gen56913
HGNC24337
OMIM610555
RefSeqNM_020156
UniProtQ9NS00
Ostali podaci
EC broj2.4.1.122
LokusHrom. 7 p21.3{{{lokus_dopunski_podaci}}}
Pretraga za
StruktureSwiss-model
DomeneInterPro

Jezgrena 1 sintaza, glikoprotein-N-acetilgalaktozamin 3-beta-galaktoziltransferaza 1, znana i kao C1GALT1, ie enzim koji je kod ljudi kodiran genom C1GALT1.[5][6]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]
1020304050
MASKSWLNFLTFLCGSAIGFLLCSQLFSILLGEKVDTQPNVLHNDPHARH
SDDNGQNHLEGQMNFNADSSQHKDENTDIAENLYQKVRILCWVMTGPQNL
EKKAKHVKATWAQRCNKVLFMSSEENKDFPAVGLKTKEGRDQLYWKTIKA
FQYVHEHYLEDADWFLKADDDTYVILDNLRWLLSKYDPEEPIYFGRRFKP
YVKQGYMSGGAGYVLSKEALKRFVDAFKTDKCTHSSSIEDLALGRCMEIM
NVEAGDSRDTIGKETFHPFVPEHHLIKGYLPRTFWYWNYNYYPPVEGPGC
CSDLAVSFHYVDSTTMYELEYLVYHLRPYGYLYRYQPTLPERILKEISQA
NKNEDTKVKLGNP
Simboli

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Obična jezgarna 1 O-glikanska struktura Gal-beta-1-3GalNAc-R je prekursor mnogih struktura O-glikana proširenog mucinskog tipa na površini životinjskih ćelija i izlučenih glikoproteina. Jezgro 1 se sintetizira prenošenjem Gal iz UDP - Gal u GalNAc-alfa-1-R, pomoću jezgra 1 beta-3-galaktoziltransferaze (C1GALT1).[6]

C1GALT1 povezan je sa T-Tn sistemom antigena.[7]

Klinički značaj

[uredi | uredi izvor]

Postoje neki dokazi da mutacije u genu C1GALT1 mogu biti povezane sa bolestima bubrega.[8]

Također pogledajte

[uredi | uredi izvor]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000106392 - Ensembl, maj 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000042460 - Ensembl, maj 2017
  3. "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. Amado M, Almeida R, Schwientek T, Clausen H (decembar 1999). "Identification and characterization of large galactosyltransferase gene families: galactosyltransferases for all functions". Biochim. Biophys. Acta. 1473 (1): 35–53. doi:10.1016/S0304-4165(99)00168-3. PMID 10580128.
  6. 1 2 Ju T, Brewer K, D'Souza A, Cummings RD, Canfield WM (januar 2002). "Cloning and expression of human core 1 beta1,3-galactosyltransferase". J. Biol. Chem. 277 (1): 178–86. doi:10.1074/jbc.M109060200. PMID 11677243.
  7. "BGMUT Blood Group Antigen Gene Mutation Database". Pristupljeno 16. 7. 2011.
  8. Alexander WS, Viney EM, Zhang JG, et al. (oktobar 2006). "Thrombocytopenia and kidney disease in mice with a mutation in the C1galt1 gene". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103 (44): 16442–7. doi:10.1073/pnas.0607872103. PMC 1637601. PMID 17062753.

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]