CDC42BPB
CDC42 vezujuća protein-kinaza beta je protein koji je kod ljudi kodiran genom CDC42BPB.[5]
Analizom hibridnog zračenja i fluerescentnom hibridizacijom in situ, Moncrieff et al. (1999) lociralui su gen CDC42BPB u hromosomskoj regiji 14q32.3.[6]
Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]
Dužina polipeptidnog lanca je 1.711 aminokiselina, a molekulska težina 194.315 Da.[7].
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MSAKVRLKKL | EQLLLDGPWR | NESALSVETL | LDVLVCLYTE | CSHSALRRDK | ||||
| YVAEFLEWAK | PFTQLVKEMQ | LHREDFEIIK | VIGRGAFGEV | AVVKMKNTER | ||||
| IYAMKILNKW | EMLKRAETAC | FREERDVLVN | GDCQWITALH | YAFQDENHLY | ||||
| LVMDYYVGGD | LLTLLSKFED | KLPEDMARFY | IGEMVLAIDS | IHQLHYVHRD | ||||
| IKPDNVLLDV | NGHIRLADFG | SCLKMNDDGT | VQSSVAVGTP | DYISPEILQA | ||||
| MEDGMGKYGP | ECDWWSLGVC | MYEMLYGETP | FYAESLVETY | GKIMNHEERF | ||||
| QFPSHVTDVS | EEAKDLIQRL | ICSRERRLGQ | NGIEDFKKHA | FFEGLNWENI | ||||
| RNLEAPYIPD | VSSPSDTSNF | DVDDDVLRNT | EILPPGSHTG | FSGLHLPFIG | ||||
| FTFTTESCFS | DRGSLKSIMQ | SNTLTKDEDV | QRDLEHSLQM | EAYERRIRRL | ||||
| EQEKLELSRK | LQESTQTVQS | LHGSSRALSN | SNRDKEIKKL | NEEIERLKNK | ||||
| IADSNRLERQ | LEDTVALRQE | REDSTQRLRG | LEKQHRVVRQ | EKEELHKQLV | ||||
| EASERLKSQA | KELKDAHQQR | KLALQEFSEL | NERMAELRAQ | KQKVSRQLRD | ||||
| KEEEMEVATQ | KVDAMRQEMR | RAEKLRKELE | AQLDDAVAEA | SKERKLREHS | ||||
| ENFCKQMESE | LEALKVKQGG | RGAGATLEHQ | QEISKIKSEL | EKKVLFYEEE | ||||
| LVRREASHVL | EVKNVKKEVH | DSESHQLALQ | KEILMLKDKL | EKSKRERHNE | ||||
| MEEAVGTIKD | KYERERAMLF | DENKKLTAEN | EKLCSFVDKL | TAQNRQLEDE | ||||
| LQDLAAKKES | VAHWEAQIAE | IIQWVSDEKD | ARGYLQALAS | KMTEELEALR | ||||
| SSSLGSRTLD | PLWKVRRSQK | LDMSARLELQ | SALEAEIRAK | QLVQEELRKV | ||||
| KDANLTLESK | LKDSEAKNRE | LLEEMEILKK | KMEEKFRADT | GLKLPDFQDS | ||||
| IFEYFNTAPL | AHDLTFRTSS | ASEQETQAPK | PEASPSMSVA | ASEQQEDMAR | ||||
| PPQRPSAVPL | PTTQALALAG | PKPKAHQFSI | KSFSSPTQCS | HCTSLMVGLI | ||||
| RQGYACEVCS | FACHVSCKDG | APQVCPIPPE | QSKRPLGVDV | QRGIGTAYKG | ||||
| HVKVPKPTGV | KKGWQRAYAV | VCDCKLFLYD | LPEGKSTQPG | VIASQVLDLR | ||||
| DDEFSVSSVL | ASDVIHATRR | DIPCIFRVTA | SLLGAPSKTS | SLLILTENEN | ||||
| EKRKWVGILE | GLQSILHKNR | LRNQVVHVPL | EAYDSSLPLI | KAILTAAIVD | ||||
| ADRIAVGLEE | GLYVIEVTRD | VIVRAADCKK | VHQIELAPRE | KIVILLCGRN | ||||
| HHVHLYPWSS | LDGAEGSFDI | KLPETKGCQL | MATATLKRNS | GTCLFVAVKR | ||||
| LILCYEIQRT | KPFHRKFNEI | VAPGSVQCLA | VLRDRLCVGY | PSGFCLLSIQ | ||||
| GDGQPLNLVN | PNDPSLAFLS | QQSFDALCAV | ELESEEYLLC | FSHMGLYVDP | ||||
| QGRRARAQEL | MWPAAPVACS | CSPTHVTVYS | EYGVDVFDVR | TMEWVQTIGL | ||||
| RRIRPLNSEG | TLNLLNCEPP | RLIYFKSKFS | GAVLNVPDTS | DNSKKQMLRT | ||||
| RSKRRFVFKV | PEEERLQQRR | EMLRDPELRS | KMISNPTNFN | HVAHMGPGDG | ||||
| MQVLMDLPLS | AVPPSQEERP | GPAPTNLARQ | PPSRNKPYIS | WPSSGGSEPS | ||||
| VTVPLRSMSD | PDQDFDKEPD | SDSTKHSTPS | NSSNPSGPPS | PNSPHRSQLP | ||||
| LEGLEQPACD | T |
Cloning :Simboli
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
Kloniranje i ekspresija[uredi | uredi izvor]
Koristeći CDC42 kao sondu u skriningu za ekspresiju biblioteke cDNK ljudskog mozga, Leung et al. (1998) dobili su djelimičnu cDNK za CDC42BPB, koju su označili kao MRCK-beta. Dobili su cDNK pune dužine koja kodira Mrck-beta i srodni protein Mrck-alfa (CDC42BPA) iz biblioteke cDNK pacova. Izvedeni pacovski proteini Mrck-alfa i Mrck-beta sadrže 1.732, odnosno 1.702 aminokiseline. Obje imaju N-terminalni kinazni domen, nakon čega slijedi centralna upredena zavojnica , regija bogata cisteinom, domen homologije plekstrina (PLEK; PH) i C-terminalna p21 GTPaza-vezujući domen. Northern blot analizom otkrivena je ekspresija Mrck-beta u svim ispitivanim tkivima pacova, s najvećom ekspresijom u bubrezima i plućima. Ekspresija MRCK-alfa i MRCK-beta takođe je otkrivena i u HeLa ćelijama.
RT-PCR analizom, gornjepomenuti Moncrieff et al. (1999) klonirali su ljudski CDC42BPB pune dužine iz iRNK ljudskog fetusnog mozga. Izvedeni protein sadrži 1.711 aminokiselina. Dijeli 90% aminokiselinskog identiteta i konzerviranost strukture pacovskog domena Cdc42bpb. Northern blot analiza otkrila je glavni transkript od 7 kb u svim ispitivanim ljudskim tkivima, s najvećom ekspresijom u srcu, mozgu i posteljici.
Funkcija[uredi | uredi izvor]
Ovaj gen kodira člana porodice serin/treonin protein- kinaza. Kodirani protein sadrži Cdc42/ Rac-vezujući p21 vezujući domen nalik na domen PAK-kinaza. Kinazni domen ovog proteina najuže je povezan sa domenom miotonusne distrofije kinaznog ROK-a. Studije sličnog gena kod pacova sugerirale su da ova kinaza može djelovati kao efektor nizvodnog procesa Cdc42 u eorganizaciji citoskeleta.
Ng et al. (2004) pokazali su da izolirani motiv inhibicije kinaze MRCK-gama (CDC42BPG) veže kinazne domene MRCK-alfa i MRCK-beta i inhibira njihovo katalitsko djelovanje.[8]
Analizom imunoprecipitacije, Tan et al. (2008) otkrili su da je Lrap35a (LURAP1) u interakciji s Mrck-alfa i Mrck-beta te sa citoskeletnim miozinom Myo18a u ekstraktima pscovskog mozga. Sličan kompleks MRCK, LRAP35A i MYO18A identificiran je u ljudskim ćelijskim linijama. Studije nokdauna i prekomerne ekspresije otkrile su da je MRCK kompleks odgovoran za sastavljanje lamelnih snopova aktomiozina i subjedarne mreže aktomiozina. LRAP35A je funkcionirao kao protein-adapter koji se neovisno vezao za MYO18A i MRCK. Vezivanje LRAP35A na motiv inhibicije kinaze MRCK aktivira MRCK za fosforilaciju MYO18A. Kompleks MRCK kretao se u skladu s retrogradnim protokom snopova aktomiozina i bio je potreban za protruziju i migraciju ćelija.[9]
Koristeći 2-hibridnu analizu kvasca, Huo et sl. (2011) otkrili su da se MRCK-beta veže za C-terminalni ZU5 domen ZO1 (TJP1). Interakcija je vjerovatno prouzrokovala konformacijsku promjenu u ZU5 domenu. Kotransfekcija MRCK-beta i ZO1 dovela je do istaknute kolokalizacije dva proteina na prednjoj ivici ćelija COS-7. Analiza mutacije pokazala je da je ZU5 domen ZO1 potreban za ciljanje MRCK-beta na vodeću ivicu. Formiranje kompleksa ZO1-MRCK-beta zahtijevalo je nanošenje MRCK-beta CDC42. Prekid ZO1 / MRCK-beta kompleksa inhibirao je MRCK-beta-posredovanu migraciju ćelija.[10][11]
Reference[uredi | uredi izvor]
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000198752 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021279 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Entrez Gene: CDC42 binding protein kinase beta". Pristupljeno 31. 5. 2017.
- ^ Moncrieff, C. L., Bailey, M. E. S., Morrison, N., Johnson, K. J. Cloning and chromosomal localization of human Cdc42-binding protein kinase-beta. Genomics 57: 297-300, 1999. PubMed: 10198171
- ^ "UniProt, Q9Y5S2". Pristupljeno 22. 7. 2021.
- ^ Ng, Y., Tan, I., Lim, L., Leung, T. Expression of the human myotonic dystrophy kinase-related Cdc42-binding kinase gamma is regulated by promoter DNA methylation and Sp1 binding. J. Biol. Chem. 279: 34156-34164, 2004. PubMed: 15194684
- ^ Tan, I., Yong, J., Dong, J. M., Lim, L., Leung, T. A tripartite complex containing MRCK modulates lamellar actomyosin retrograde flow. Cell 135: 123-136, 2008. PubMed: 18854160
- ^ Huo, L., Wen, W., Wang, R., Kam, C., Xia, J., Feng, W., Zhang, M. Cdc42-dependent formation of the ZO-1/MRCK-beta complex at the leading edge controls cell migration. EMBO J. 30: 665-678, 2011. PubMed: 21240187
- ^ Leung, T., Chen, X.-Q., Tan, I., Manser, E., Lim, L. Myotonic dystrophy kinase-related Cdc42-binding kinase acts as a Cdc42 effector in promoting cytoskeletal reorganization. Molec. Cell. Biol. 18: 130-140, 1998. PubMed: 9418861
Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]
- Choi SH, Czifra G, Kedei N, Lewin NE, Lazar J, Pu Y, Marquez VE, Blumberg PM (2008). "Characterization of the interaction of phorbol esters with the C1 domain of MRCK (myotonic dystrophy kinase-related Cdc42 binding kinase) alpha/beta". J. Biol. Chem. 283 (16): 10543–9. doi:10.1074/jbc.M707463200. PMC 2447637. PMID 18263588.
- Kim YJ, Kim NY, Lee MK, Choi HJ, Baek HJ, Nam CH (2010). "Overexpression and unique rearrangement of VH2 transcripts in immunoglobulin variable heavy chain genes in ankylosing spondylitis patients". Exp. Mol. Med. 42 (5): 319–26. doi:10.3858/emm.2010.42.5.030. PMC 2877252. PMID 20177145.
- Rose JE, Behm FM, Drgon T, Johnson C, Uhl GR (2010). "Personalized smoking cessation: interactions between nicotine dose, dependence and quit-success genotype score". Mol. Med. 16 (7–8): 247–53. doi:10.2119/molmed.2009.00159. PMC 2896464. PMID 20379614.
- Huo L, Wen W, Wang R, Kam C, Xia J, Feng W, Zhang M (2011). "Cdc42-dependent formation of the ZO-1/MRCKβ complex at the leading edge controls cell migration". EMBO J. 30 (4): 665–78. doi:10.1038/emboj.2010.353. PMC 3041950. PMID 21240187.