CKAP4
Citoskeletno pridruženi protein 4 je protein genkoji je kod ljudi kodirran genom CKAP4.[5][6]
CKAP4 također historijski poznat kao CLIMP-63 (membranski protein 63 koji povezuje citoskelet) ili samo p63 (tokom 1990-ih) je obilan tip II transmembranskih proteina koji pretežno prebiva u endoplazmatskom retikulumu (ER) eukariotskih ćelija i kodiran kod viših kičmenjaka genom CKAP4.[7][8][9][10][11]
Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]
Dužina polipeptidnog lanca je 602 aminokiseline, a molekulska težina 66.022 Da.[12].
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MPSAKQRGSK | GGHGAASPSE | KGAHPSGGAD | DVAKKPPPAP | QQPPPPPAPH | ||||
| PQQHPQQHPQ | NQAHGKGGHR | GGGGGGGKSS | SSSSASAAAA | AAAASSSASC | ||||
| SRRLGRALNF | LFYLALVAAA | AFSGWCVHHV | LEEVQQVRRS | HQDFSRQREE | ||||
| LGQGLQGVEQ | KVQSLQATFG | TFESILRSSQ | HKQDLTEKAV | KQGESEVSRI | ||||
| SEVLQKLQNE | ILKDLSDGIH | VVKDARERDF | TSLENTVEER | LTELTKSIND | ||||
| NIAIFTEVQK | RSQKEINDMK | AKVASLEESE | GNKQDLKALK | EAVKEIQTSA | ||||
| KSREWDMEAL | RSTLQTMESD | IYTEVRELVS | LKQEQQAFKE | AADTERLALQ | ||||
| ALTEKLLRSE | ESVSRLPEEI | RRLEEELRQL | KSDSHGPKED | GGFRHSEAFE | ||||
| ALQQKSQGLD | SRLQHVEDGV | LSMQVASARQ | TESLESLLSK | SQEHEQRLAA | ||||
| LQGRLEGLGS | SEADQDGLAS | TVRSLGETQL | VLYGDVEELK | RSVGELPSTV | ||||
| ESLQKVQEQV | HTLLSQDQAQ | AARLPPQDFL | DRLSSLDNLK | ASVSQVEADL | ||||
| KMLRTAVDSL | VAYSVKIETN | ENNLESAKGL | LDDLRNDLDR | LFVKVEKIHE | ||||
| KV |
- Simboli
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
Lokalizacija, molekulske funkcije i regulacija[uredi | uredi izvor]
Ćelijska distribucija CLIMP-63 je procenjivana (i ponovo procenjivana) nekoliko puta u posljednje dva desetljeća. Protein uključuje citosolni segment, sastavljen od pozitivno nabijenih aminokiselina (2-23) koji bi mogao djelovati kao prevladavajući motiv za savijanje proteina i lokalizaciju ER.[13][14] CLIMP-63 bio je jedan od prvootkrivenih proteina za oblikovanja ER-a[15] i najpoznatiji učesnik u generiranju održsvnja listovs ER-a.[16] Smatra se da se to događa nakon dimerizacije lumenskih upredenozavojničkih domena CLIMP-63 u cis (dva CLIMP-63 proteina istog ER membranskog sloja) i/ili trans položaju (između dva različita sloja ER membrane, preko lumena ER). Multimerizacija bi dodatno mogla ograničiti širenje CLIMP-63 iz ER-listova.[17]
Pokazalo se i da CLIMP-63 veže mikrotubule, preko kroz citoplazmatskog poremećenog repa, što bi moglo pomoći u pričvršćivanju ER-listova za citoskelet. Ovo je regulirano fosforilacijom najmanje tri serinska ostatka citosolnog repa CLIMP-63 (S3, S17 i S19), jer fosforilacija ometa kapacitet vezanja mikrotubula CLIMP-63.[18]
Osim toga, CLIMP-63 može proći još jednu posttranslacijsku modifikaciju, S-palmitoilaciju na cisteinu 100 svog citoplazmatskog domena. Do sada je samo palmitoil-aciltransferaza ZDHHC2 identificirana kao potencijalni regulator palmitoilacije CLIMP-63, ali kako se ZDHHC2 uglavnom nalazi na plazmamembrani, potrebna su dodatna istraživanja.[19][20] Posljedice S-palmitoilacije tek treba istražiti, ali bi mogle imatiati ulogu u ćelijskom ciklusu, jer je prijavljeno da se tokom mitoze palmitoilacija CLIMP-63 snažno povećava.
Konačno, različite grupe pokazale su da CLIMP-63 služi kao receptor na ćelijskoj površini, za različite vanćelijske ligande, posebno za surfaktant-protein A (SP-A) u plućnim alveolama,Greška kod citiranja: Nedostaje oznaka za zatvaranje </ref> nakon <ref>
Reference[uredi | uredi izvor]
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000136026 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000046841 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Schweizer A, Rohrer J, Jenö P, DeMaio A, Buchman TG, Hauri HP (mart 1993). "A reversibly palmitoylated resident protein (p63) of an ER-Golgi intermediate compartment is related to a circulatory shock resuscitation protein". Journal of Cell Science. 104 (3): 685–94. PMID 8314870.
- ^ "Entrez Gene: CKAP4 cytoskeleton-associated protein 4".
- ^ "Gene: CKAP4 (ENSG00000136026) - Summary - Homo sapiens - Ensembl genome browser 89". may2017.archive.ensembl.org (jezik: engleski). Pristupljeno 26. 3. 2018.
- ^ "Gene: Ckap4 (ENSMUSG00000046841) - Summary - Mus musculus - Ensembl genome browser 89". may2017.archive.ensembl.org (jezik: engleski). Pristupljeno 26. 3. 2018.
- ^ pubmeddev. "PubMed Links for Gene (Select 10970) - PubMed - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 26. 3. 2018.
- ^ pubmeddev. "PubMed Links for Gene (Select 216197) - PubMed - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 26. 3. 2018.
- ^ "CKAP4 cytoskeleton associated protein 4 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 26. 3. 2018.
- ^ "UniProt, Q07065". Pristupljeno 8. 8. 2021.
- ^ Schweizer A, Rohrer J, Hauri HP, Kornfeld S (juli 1994). "Retention of p63 in an ER-Golgi intermediate compartment depends on the presence of all three of its domains and on its ability to form oligomers". The Journal of Cell Biology. 126 (1): 25–39. doi:10.1083/jcb.126.1.25. PMC 2120087. PMID 8027183.
- ^ Schweizer A, Rohrer J, Slot JW, Geuze HJ, Kornfeld S (juni 1995). "Reassessment of the subcellular localization of p63". Journal of Cell Science. 108 (6): 2477–85. PMID 7673362.
- ^ Klopfenstein DR, Klumperman J, Lustig A, Kammerer RA, Oorschot V, Hauri HP (juni 2001). "Subdomain-specific localization of CLIMP-63 (p63) in the endoplasmic reticulum is mediated by its luminal alpha-helical segment". The Journal of Cell Biology. 153 (6): 1287–300. doi:10.1083/jcb.153.6.1287. PMC 2192027. PMID 11402071.
- ^ Shibata Y, Shemesh T, Prinz WA, Palazzo AF, Kozlov MM, Rapoport TA (novembar 2010). "Mechanisms determining the morphology of the peripheral ER". Cell. 143 (5): 774–88. doi:10.1016/j.cell.2010.11.007. PMC 3008339. PMID 21111237.
- ^ Nikonov AV, Hauri HP, Lauring B, Kreibich G (juli 2007). "Climp-63-mediated binding of microtubules to the ER affects the lateral mobility of translocon complexes". Journal of Cell Science. 120 (13): 2248–58. doi:10.1242/jcs.008979. PMID 17567679.
- ^ Vedrenne C, Klopfenstein DR, Hauri HP (april 2005). "Phosphorylation controls CLIMP-63-mediated anchoring of the endoplasmic reticulum to microtubules". Molecular Biology of the Cell. 16 (4): 1928–37. doi:10.1091/mbc.E04-07-0554. PMC 1073672. PMID 15703217.
- ^ Zhang J, Planey SL, Ceballos C, Stevens SM, Keay SK, Zacharias DA (juli 2008). "Identification of CKAP4/p63 as a major substrate of the palmitoyl acyltransferase DHHC2, a putative tumor suppressor, using a novel proteomics method". Molecular & Cellular Proteomics. 7 (7): 1378–88. doi:10.1074/mcp.M800069-MCP200. PMC 2493380. PMID 18296695.
- ^ Sandoz PA, van der Goot FG (april 2015). "How many lives does CLIMP-63 have?". Biochemical Society Transactions. 43 (2): 222–8. doi:10.1042/BST20140272. PMC 4627503. PMID 25849921.
Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]
- Sandoz PA, van der Goot FG (2015). "How many lives does CLIMP-63 have?". Biochemical Society Transactions. 43 (2): 222–228. doi:10.1042/BST20140272. PMC 4627503. PMID 25849921.
- Tuffy KM, Planey SB (2012). "Cytoskeleton-Associated Protein 4: Functions Beyond the Endoplasmic Reticulum in Physiology and Disease". ISRN Cell Biology. 2012: 1–11. doi:10.5402/2012/142313.
- Bates SR (2009). "P63 (CKAP4) as an SP-A receptor: implications for surfactant turnover". Cellular Physiology and Biochemistry. 25 (1): 41–54. doi:10.1159/000272062. PMC 3025887. PMID 20054143.
Vanjski linkovi[uredi | uredi izvor]
- Lokacija ljudskog genoma CKAP4 i stranica sa detaljima o genu CKAP4 u UCSC Genome Browseru.