DCTPP1

DCTPP1
Dostupne strukture
PDB	Pretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova
	2A3Q, 2OIE, 2OIG, 2Q4P
Identifikatori
Aliasi	DCTPP1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 615840 MGI: 1913672 HomoloGene: 11329 GeneCards: DCTPP1
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 16 (čovjek)
Kraj	30,430,030 bp
Lokacija gena (miš)
Hrom.	Hromosom 7 (miš)
Kraj	126,859,881 bp
Obrazac RNK ekspresije
	Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• nucleotide binding; • GO:0097382 Pirofosfataza; • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine; • hydrolase activity; • magnesium ion binding; • vezivanje iona metala; • vezivanje identičnih proteina; • pyrimidine deoxyribonucleotide binding; • dCTP diphosphatase activity; • nucleoside-triphosphate diphosphatase activity;
Ćelijska komponenta	• citoplazma; • citosol; • jedro; • mitohondrija;
Biološki proces	• protein homotetramerization; • dCTP catabolic process; • nucleoside triphosphate catabolic process; • DNA protection; • dTTP catabolic process;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	79077
	66422
	ENSG00000179958
	ENSMUSG00000042462
	Q9H773
	Q9QY93
	NM_024096
	NM_023203
	NP_077001
	NP_075692
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek	Pogledaj/uredi – miš

dCTP-pirofosfataza 1 je enzim koji je kod ljudi kodiran genom DCTPP1.^[5]^[6]

DCTPP1 pripada porodici pirofosfataza koje smanjuju ćelijkni bazen deoksiribonukleozid-trifosfata (dNTP) tako što ih razgrađuju u svoje dNMP oblike. Ovi enzimi također ciljaju nekanonske NTP i genotoksične NTP, poput oksidiranih analoga dCTP.

Hartz (2014) mapirala je gen DCTPP1 na kratkom (p) kraku hromosoma 16, regija p11.2, na osnovu poravnanja sekvence DCTPP1 (GenBank BC001344) sa genomskom sekvencom (GRCh37)

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 170 aminokiselina, a molekulska težina 18.681 Da ^[7].

10	20	30	40	50
MSVAGGEIRG	DTGGEDTAAP	GRFSFSPEPT	LEDIRRLHAE	FAAERDWEQF
HQPRNLLLAL	VGEVGELAEL	FQWKTDGEPG	PQGWSPRERA	ALQEELSDVL
IYLVALAARC	RVDLPLAVLS	KMDINRRRYP	AHLARSSSRK	YTELPHGAIS
EDQAVGPADI	PCDSTGQTST

Kloniranje i ekspresija[uredi | uredi izvor]

Requena et al. (2014) klonirali su ljudski DCTPP1, koji kodira protein sa tipslom domenom MazG pirofosfohidrolaze i katalitski ostatak, glu63, za koji se predviđa da veže Mg (2+). Imunofluorescentna konfokalna mikroskopija otkrila je DCTPP1 u citosolu, jedru i mitohondrijama ljudskih ćelijskih linija, sa specifičnom distribucijom ćelijskog tipa među njima.

Funkcija gena[uredi | uredi izvor]

Upotrebom prečišćenog proteina označenog epitopom, eksprimiranog u E. coli, Requena et al. (2014) otkrili su da je rekombinantni ljudski DCTPP1 pokazao aktivnost pirofosfohidrolaze prema navodnom supstratu, dCTP, formirajući dCMP i oslobađajući anorganski pirofosfat (PPi). DCTPP1 je imao slabiju aktivnost protiv dTTP-a i dATP-a, ali nije imao aktivnosti protiv dGTP-a. DCTPP1 je takođe hidrolizirao nekoliko fiziološki relevantnih dCTP derivata modificiranih baza, uključujući halogenirane i oksidirane oblike. PPi i dCDP inhibirali su hidrolizu dCTP pomoću DCTPP1. Mutacija predviđenog mjesta vezanja Mg (2 +), glu63, na glicin je ukinula aktivnost DCTPP1. Nokdaun DCTPP1 u ljudskim ćelijskim linijama putem male interferirajuće RNK nije imao efekta na proliferaciju ćelija, ali je uzrokovao povećani unutarćelijski dCTP i povećanu osetljivost ćelija na genotoksične analoge dCTP-a, u poređenju sa kontrolama. Dodavanje deoksicitidina, koji putem pretvaranja može preći u dCTP, povećao je ekspresiju DCTPP1 u normalnim ljudskim fibroblastima i HeLa ćelijama. U sinhroniziranim HeLa ćelijama, ekspresija DCTPP1 povećala se tokom mitoza, što sugerira da DCTPP1 doprinosi eliminaciji viška dCTP nakon sinteze DNK.^[8]

Također pogledajte[uredi | uredi izvor]

Dezoksicitidin-trifosfat (dCTP)]]
Transaktivacija

Reference[uredi | uredi izvor]

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000179958 - Ensembl, maj 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000042462 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Moroz OV, Murzin AG, Makarova KS, Koonin EV, Wilson KS, Galperin MY (Mar 2005). "Dimeric dUTPases, HisE, and MazG belong to a new superfamily of all-alpha NTP pyrophosphohydrolases with potential "house-cleaning" functions". J Mol Biol. 347 (2): 243–55. doi:10.1016/j.jmb.2005.01.030. PMID 15740738.
^ "Entrez Gene: XTP3TPA XTP3-transactivated protein A".
^ "UniProt, Q9H773". Pristupljeno 4. 7. 2021.
^ Requena, C. E., Perez-Moreno, G., Ruiz-Perez, L. M., Vidal, A. E., Gonzalez-Pacanowska, D. The NTP pyrophosphatase DCTPP1 contributes to the homoeostasis and cleansing of the dNTP pool in human cells. Biochem. J. 459: 171-180, 2014. PubMed: 24467396

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]

Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). "A human protein-protein interaction network: a resource for annotating the proteome". Cell. 122 (6): 957–68. doi:10.1016/j.cell.2005.08.029. PMID 16169070.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Vanjski linkovi[uredi | uredi izvor]

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000179958 - Ensembl, maj 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000042462 - Ensembl, maj 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid15740738-5] Moroz OV, Murzin AG, Makarova KS, Koonin EV, Wilson KS, Galperin MY (Mar 2005). "Dimeric dUTPases, HisE, and MazG belong to a new superfamily of all-alpha NTP pyrophosphohydrolases with potential "house-cleaning" functions". J Mol Biol. 347 (2): 243–55. doi:10.1016/j.jmb.2005.01.030. PMID 15740738.

[entrez-6] "Entrez Gene: XTP3TPA XTP3-transactivated protein A".

[UniProt-7] "UniProt, Q9H773". Pristupljeno 4. 7. 2021.

[8] Requena, C. E., Perez-Moreno, G., Ruiz-Perez, L. M., Vidal, A. E., Gonzalez-Pacanowska, D. The NTP pyrophosphatase DCTPP1 contributes to the homoeostasis and cleansing of the dNTP pool in human cells. Biochem. J. 459: 171-180, 2014. PubMed: 24467396

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]