DDX31

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
DDX31
Identifikatori
AliasiDDX31
Vanjski ID-jeviOMIM: 616533 MGI: 2682639 HomoloGene: 6389 GeneCards: DDX31
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 9 (čovjek)
Hrom.Hromosom 9 (čovjek)[1]
Hromosom 9 (čovjek)
Genomska lokacija za DDX31
Genomska lokacija za DDX31
Bend9q34.13Početak132,592,997 bp[1]
Kraj132,670,401 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 2 (miš)
Hrom.Hromosom 2 (miš)[2]
Hromosom 2 (miš)
Genomska lokacija za DDX31
Genomska lokacija za DDX31
Bend2|2 A3Početak28,730,418 bp[2]
Kraj28,795,583 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija nucleotide binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
hydrolase activity
ATP binding
GO:0008026 helicase activity
nucleic acid binding
RNA binding
Ćelijska komponenta Golđijev aparat
intracellular membrane-bounded organelle
Jedro
Jedarce
citoplazma
Biološki proces ribosome biogenesis
RNA secondary structure unwinding
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)
NM_022779
NM_138620
NM_001322340
NM_001322341
NM_001322342

NM_001322343
NM_001322344

NM_001033294

RefSeq (bjelančevina)
NP_001309269
NP_001309270
NP_001309271
NP_001309272
NP_001309273

NP_073616
NP_619526

NP_001028466

Lokacija (UCSC)Chr 9: 132.59 – 132.67 MbChr 2: 28.73 – 28.8 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) kutijski polipeptid 31, znan i kao DDX31, je ljudski gen.[5]

DEAD-kutijski proteini, koje karakterizira konzervirani motivAsp-Glu-Ala-Asp (DEAD), pretpostavljene su RNK helikaze. Uključeni su u brojne ćelijske procese koji uključuju promjenu sekundarne strukture RNK, kao što su inicijacija translacija, jedarna i mitohondrijska orerada i sklapanje ribosoma i splajsosoma. Na osnovu njihovih obrazaca distribucije, vjeruje se da su neki članovi ove porodice proteina iz DEAD-kutije uključeni u embriogenezu, spermatogenezu i ćelijski rast i diobu. Ovaj gen kodira člana ove porodice. Funkcija ovog člana nije utvrđena. Alternativna prerada ovog gena generira dvije varijante transkripta.[5]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 851 aminokiselina, а molekulska težina 94.087 Da.[6]

1020304050
MAPDLASQRHSESFPSVNSRPNVILPGREGRREGLPPGGGTRGSLVPTRP
VPPSPAPLGTSPYSWSRSGPGRGGGAGSSRVPRGVPGPAVCAPGSLLHHA
SPTQTMAAADGSLFDNPRTFSRRPPAQASRQAKATKRKYQASSEAPPAKR
RNETSFLPAKKTSVKETQRTFKGNAQKMFSPKKHSVSTSDRNQEERQCIK
TSSLFKNNPDIPELHRPVVKQVQEKVFTSAAFHELGLHPHLISTINTVLK
MSSMTSVQKQSIPVLLEGRDALVRSQTGSGKTLAYCIPVVQSLQAMESKI
QRSDGPYALVLVPTRELALQSFDTVQKLLKPFTWIVPGVLMGGEKRKSEK
ARLRKGINILISTPGRLVDHIKSTKNIHFSRLRWLVFDEADRILDLGFEK
DITVILNAVNAECQKRQNVLLSATLTEGVTRLADISLHDPVSISVLDKSH
DQLNPKDKAVQEVCPPPAGDKLDSFAIPESLKQHVTVVPSKLRLVCLAAF
ILQKCKFEEDQKMVVFFSSCELVEFHYSLFLQTLLSSSGAPASGQLPSAS
MRLKFLRLHGGMEQEERTAVFQEFSHSRRGVLLCTDVAARGLDLPQVTWI
VQYNAPSSPAEYIHRIGRTARIGCHGSSLLILAPSEAEYVNSLASHKINV
SEIKMEDILCVLTRDDCFKGKRWGAQKSHAVGPQEIRERATVLQTVFEDY
VHSSERRVSWAKKALQSFIQAYATYPRELKHIFHVRSLHLGHVAKSFGLR
DAPRNLSALTRKKRKAHVKRPDLHKKTQSKHSLAEILRSEYSSGMEADIA
KVKKQNAPGEPGGRPLQHSLQPTPCFGRGKTLKWRKTQKGVQRDSKTSQK
V

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000125485 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026806 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b "Entrez Gene: DDX31 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 31".
  6. ^ "UniProt, Q9H8H2". Pristupljeno 7. 9. 2021.

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]