Idi na sadržaj

FANCI

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
FANCI
Identifikatori
AliasiFANCI
Vanjski ID-jeviOMIM: 611360 MGI: 2384790 HomoloGene: 49530 GeneCards: FANCI
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 15 (čovjek)
Hrom.Hromosom 15 (čovjek)[1]
Hromosom 15 (čovjek)
Genomska lokacija za FANCI
Genomska lokacija za FANCI
Bend15q26.1Početak89,243,945 bp[1]
Kraj89,317,261 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 7 (miš)
Hrom.Hromosom 7 (miš)[2]
Hromosom 7 (miš)
Genomska lokacija za FANCI
Genomska lokacija za FANCI
Bend7|7 D2Početak79,041,677 bp[2]
Kraj79,100,012 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje sa DNK
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
DNA polymerase binding
Ćelijska komponenta membrana
jedro
nukleoplazma
citosol
Biološki proces ćelijski ciklus
mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling
positive regulation of protein ubiquitination
interstrand cross-link repair
cellular response to DNA damage stimulus
GO:0100026 Popravka DNK
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001113378
NM_018193
NM_001376910
NM_001376911

NM_145946

RefSeq (bjelančevina)

NP_001106849
NP_060663
NP_001363839
NP_001363840

NP_666058

Lokacija (UCSC)Chr 15: 89.24 – 89.32 MbChr 7: 79.04 – 79.1 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Komplementacijska grupa I Fanconijeve anemije (FANCI), znana i kao KIAA1794, jest protein koji je kod ljudi kodiran genom FANCI sa hromosoma 15.[5][6][7][8][9] Poznato je da mutacije u genu FANCI uzrokuju Fanconijevu anemiju.[10]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 1.328 aminokiselina, a molekulska težina 149.324 Da.[5]

1020304050
MDQKILSLAAEKTADKLQEFLQTLREGDLTNLLQNQAVKGKVAGALLRAI
FKGSPCSEEAGTLRRRKIYTCCIQLVESGDLQKEIASEIIGLLMLEAHHF
PGPLLVELANEFISAVREGSLVNGKSLELLPIILTALATKKENLAYGKGV
LSGEECKKQLINTLCSGRWDQQYVIQLTSMFKDVPLTAEEVEFVVEKALS
MFSKMNLQEIPPLVYQLLVLSSKGSRKSVLEGIIAFFSALDKQHNEEQSG
DELLDVVTVPSGELRHVEGTIILHIVFAIKLDYELGRELVKHLKVGQQGD
SNNNLSPFSIALLLSVTRIQRFQDQVLDLLKTSVVKSFKDLQLLQGSKFL
QNLVPHRSYVSTMILEVVKNSVHSWDHVTQGLVELGFILMDSYGPKKVLD
GKTIETSPSLSRMPNQHACKLGANILLETFKIHEMIRQEILEQVLNRVVT
RASSPISHFLDLLSNIVMYAPLVLQSCSSKVTEAFDYLSFLPLQTVQRLL
KAVQPLLKVSMSMRDCLILVLRKAMFANQLDARKSAVAGFLLLLKNFKVL
GSLSSSQCSQSLSVSQVHVDVHSHYNSVANETFCLEIMDSLRRCLSQQAD
VRLMLYEGFYDVLRRNSQLANSVMQTLLSQLKQFYEPKPDLLPPLKLEAC
ILTQGDKISLQEPLDYLLCCIQHCLAWYKNTVIPLQQGEEEEEEEEAFYE
DLDDILESITNRMIKSELEDFELDKSADFSQSTSIGIKNNICAFLVMGVC
EVLIEYNFSISSFSKNRFEDILSLFMCYKKLSDILNEKAGKAKTKMANKT
SDSLLSMKFVSSLLTALFRDSIQSHQESLSVLRSSNEFMRYAVNVALQKV
QQLKETGHVSGPDGQNPEKIFQNLCDITRVLLWRYTSIPTSVEESGKKEK
GKSISLLCLEGLQKIFSAVQQFYQPKIQQFLRALDVTDKEGEEREDADVS
VTQRTAFQIRQFQRSLLNLLSSQEEDFNSKEALLLVTVLTSLSKLLEPSS
PQFVQMLSWTSKICKENSREDALFCKSLMNLLFSLHVSYKSPVILLRDLS
QDIHGHLGDIDQDVEVEKTNHFAIVNLRTAAPTVCLLVLSQAEKVLEEVD
WLITKLKGQVSQETLSEEASSQATLPNQPVEKAIIMQLGTLLTFFHELVQ
TALPSGSCVDTLLKDLCKMYTTLTALVRYYLQVCQSSGGIPKNMEKLVKL
SGSHLTPLCYSFISYVQNKSKSLNYTGEKKEKPAAVATAMARVLRETKPI
PNLIFAIEQYEKFLIHLSKKSKVNLMQHMKLSTSRDFKIKGNILDMVLRE
DGEDENEEGTASEHGGQNKEPAKKKRKK

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Komplementarna grupa za Fanconijevu anemiju (FANC) uključuje FANCA, FANCB, FANCC, FANCD1 (također zvana BRCA2), FANCD2, FANCE , FANCF, FANCG, FANCI, FANCJ (također zvana i BRIP1), FANCL, FANCM i FANCN (također PALB2). Prethodno definirana grupa FANCH je ista kao i FANCA. Fanconijeva anemija je genetički heterogeni recesivni poremećaj karakteriziran citogenetičkom nestabilnošću, preosjetljivošću na agense za umrežavanje DNK, povećanim lomovima hromosoma i defektnom popravkom DNK. Članovi komplementacijske grupe za Fanconijevu anemiju ne dijele sličnost sekvenci; oni su povezani svojim sklapanjem u zajednički jedarni proteinski kompleks. Ovaj gen kodira protein za komplementacionu grupu I. Alternativna prerada RNK rezultira dvije varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme.[5]

FANCI formira heterodimer sa proteinom FANCD2. I FANCD2 i FANCI su monoubikvitinirani podjedinicom kompleksa Fanconijeve anemije FANCL. Monoubikvitinacija FANCI je neophodna za popravku međulančanih umrežavanja DNK i spaja protein na DNK zajedno sa njegovim partnerskim proteinom FANCD2. Monoubikvitinirani kompleks FANCD2:FANCI prekriva DNK u sekvenci nalik na filamente, potencijalno kao način zaštite DNK povezane sa zastojem u replikaciji.[11]

Pored proteina koji su uključeni u popravku DNK, FANCI stupa u interakciju s proteinima lokaliziranim na jedarcetu,[12][13] jedarnom tijelu, gdje započinje biogeneza ribosoma. FANCI funkcionira u obradi preribosomske RNK (pre-rRNK) za veliku ribosomsku podjedinicu, transkribirajuči pre-rRNK pomoću RNKPI, održavajući nivoe zrele 28S ribozomske RNK (rRNK), i globalne ćelijske translacije proteina pomoću ribosoma.[12] U jedarcetu, FANCI je pretežno u deubikvitiniranom obliku i stupa u interakciju sa velikom podjedinicom RNAPI i članovima kompleksa PeBoW (PES1 i BOP1).[12] Možda postoji još jedna uloga FA proteina izvan jedarceta u biogenezama ribosoma ili translacija proteina kao FANCI i FANCD2 su jedini FA proteini povezani sa polisomima.[14]

Kod miševa, FANCI protein učestvuje u mejotskoj rekombinaciji zametnih ćelija, a deleciju gena Fanci uzrokujuči jak mejotski fenotip i teški hipogonadizam.[15] Fanci–/– mužjaci miševa imaju potpuno poremećenu spermatogenezu,[15][16] a ženke takvih miševa ne proizvode jajničke folikule.[15]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000140525 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000039187 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b c "Entrez Gene: FANCI".
  6. ^ Nagase T, Nakayama M, Nakajima D, Kikuno R, Ohara O (april 2001). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro". DNA Research. 8 (2): 85–95. doi:10.1093/dnares/8.2.85. PMID 11347906.
  7. ^ Dorsman JC, Levitus M, Rockx D, Rooimans MA, Oostra AB, Haitjema A, et al. (2007). "Identification of the Fanconi anemia complementation group I gene, FANCI". Cellular Oncology. 29 (3): 211–218. doi:10.1155/2007/151968. PMC 4618213. PMID 17452773.
  8. ^ Sims AE, Spiteri E, Sims RJ, Arita AG, Lach FP, Landers T, et al. (juni 2007). "FANCI is a second monoubiquitinated member of the Fanconi anemia pathway". Nature Structural & Molecular Biology. 14 (6): 564–567. doi:10.1038/nsmb1252. PMID 17460694. S2CID 40947913.
  9. ^ Smogorzewska A, Matsuoka S, Vinciguerra P, McDonald ER, Hurov KE, Luo J, et al. (april 2007). "Identification of the FANCI protein, a monoubiquitinated FANCD2 paralog required for DNA repair". Cell. 129 (2): 289–301. doi:10.1016/j.cell.2007.03.009. PMC 2175179. PMID 17412408.
  10. ^ Levitus M, Rooimans MA, Steltenpool J, Cool NF, Oostra AB, Mathew CG, et al. (april 2004). "Heterogeneity in Fanconi anemia: evidence for 2 new genetic subtypes". Blood. 103 (7): 2498–2503. doi:10.1182/blood-2003-08-2915. PMID 14630800. S2CID 7033645.
  11. ^ Tan W, van Twest S, Leis A, Bythell-Douglas R, Murphy VJ, Sharp M, et al. (mart 2020). "Monoubiquitination by the human Fanconi anemia core complex clamps FANCI:FANCD2 on DNA in filamentous arrays". eLife. 9. doi:10.7554/eLife.54128. PMC 7156235. PMID 32167469.
  12. ^ a b c Sondalle SB, Longerich S, Ogawa LM, Sung P, Baserga SJ (februar 2019). "Fanconi anemia protein FANCI functions in ribosome biogenesis". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 116 (7): 2561–2570. Bibcode:2019PNAS..116.2561S. doi:10.1073/pnas.1811557116. PMC 6377447. PMID 30692263.
  13. ^ Moriel-Carretero M, Ovejero S, Gérus-Durand M, Vryzas D, Constantinou A (decembar 2017). "Fanconi anemia FANCD2 and FANCI proteins regulate the nuclear dynamics of splicing factors". The Journal of Cell Biology. 216 (12): 4007–4026. doi:10.1083/jcb.201702136. PMC 5716273. PMID 29030393.
  14. ^ Gueiderikh A, Maczkowiak-Chartois F, Rouvet G, Souquère-Besse S, Apcher S, Diaz JJ, Rosselli F (januar 2021). "Fanconi anemia A protein participates in nucleolar homeostasis maintenance and ribosome biogenesis". Science Advances. 7 (1): eabb5414. Bibcode:2021SciA....7.5414G. doi:10.1126/sciadv.abb5414. PMC 7775781. PMID 33523834.
  15. ^ a b c Dubois EL, Guitton-Sert L, Béliveau M, Parmar K, Chagraoui J, Vignard J, Pauty J, Caron MC, Coulombe Y, Buisson R, Jacquet K, Gamblin C, Gao Y, Laprise P, Lebel M, Sauvageau G, D d'Andrea A, Masson JY. A Fanci knockout mouse model reveals common and distinct functions for FANCI and FANCD2. Nucleic Acids Res. 2019 Aug 22;47(14):7532-7547. doi: 10.1093/nar/gkz514. PMID 31219578; PMCID: PMC6698648
  16. ^ Xu L, Xu W, Li D, Yu X, Gao F, Qin Y, Yang Y, Zhao S. FANCI plays an essential role in spermatogenesis and regulates meiotic histone methylation. Cell Death Dis. 2021 Aug 9;12(8):780. doi: 10.1038/s41419-021-04034-7. Erratum in: Cell Death Dis. 2021 Aug 26;12(9):808. PMID 34373449; PMCID: PMC8353022

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]

Ovaj članak uključuje tekst iz Nacionalne medicinske biblioteke Sjedinjenih Država, koji je u javnom vlasništvu.