Idi na sadržaj

HLA-DPA1

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
HLA-DPA1
Dostupne strukture
PDBPretraga Human UniProta: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

3LQZ, 4P4K, 4P4R, 4P57, 4P5K, 4P5M

Identifikatori
AliasiHLA-DPA1
Vanjski ID-jeviOMIM: 142880 HomoloGene: 110708 GeneCards: HLA-DPA1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 6 (čovjek)
Hrom.Hromosom 6 (čovjek)[1]
Hromosom 6 (čovjek)
Genomska lokacija za HLA-DPA1
Genomska lokacija za HLA-DPA1
Bend6p21.32Početak33,064,569 bp[1]
Kraj33,080,775 bp[1]
Ontologija gena
Molekularna funkcija peptide antigen binding
MHC class II receptor activity
Ćelijska komponenta integral component of membrane
endocytic vesicle membrane
clathrin-coated endocytic vesicle membrane
endozom
Golđijev aparat
trans-Golgi network membrane
endoplasmic reticulum membrane
membrana
Golđijeva membrana
ćelijska membrana
transport vesicle membrane
integral component of plasma membrane
MHC class II protein complex
cell surface
lysosomal membrane
Endoplazmatski retikulum
ER to Golgi transport vesicle membrane
Lizozom
integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane
endosome membrane
intracellular membrane-bounded organelle
Biološki proces antigen processing and presentation
antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II
interferon-gamma-mediated signaling pathway
immune system process
positive regulation of interferon-gamma production
antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II
positive regulation of T cell activation
GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 Imuni odgovor
positive regulation of T cell proliferation
cellular response to interferon-gamma
T cell receptor signaling pathway
adaptive immune response
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
ENSG00000229685
ENSG00000224103
ENSG00000206291
ENSG00000168384
ENSG00000228163
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001242524
NM_001242525
NM_033554
NM_001405020

n/a

RefSeq (bjelančevina)

NP_001229453
NP_001229454
NP_291032

n/a

Lokacija (UCSC)Chr 6: 33.06 – 33.08 Mbn/a
PubMed pretraga[2]n/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek
Klasa II-DP-alfa 1 glavnig kompleksa histokompatibilnosti
Klasa II MHC-a
Identifikatori
SimbolHLA-DPA1
Alt. simboliHLA-DP1A
NCBI gen3113
HGNC4938
OMIM142880
RefSeqNM_033554
UniProtP20036
Ostali podaci
LokusHrom. 6 p21.3
Pretraga za
StruktureSwiss-model
DomeneInterPro

Klasa II-DP-alfa 1 glavnig kompleksa histokompatibilnosti , znana i kao HLA-DPA1, je ljudski gen.[3]

Genska struktura i polimorfizmi

[uredi | uredi izvor]

Alfa lanac je približne molekulske težine od 33-35 kDa. Kodiran je s pet egzona, jedan egzon kodira vodeći peptid, egzoni 2 i 3 kodiraju dva vanćelijska domena, ea gzon 4 kodira transmembranski i citoplazmatski rep. Unutar molekula DP i alfa- lanac i beta-lanac sadrže polimorfizme specificirajući posebnosti vezivanja peptida, što rezultira u četiri različite molekule.[3]

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Protein kodiran ovim genom pripada HLA klasi II alfa-lančanih paraloga. Molekual klase II je heterodimer koji se sastoji od alfa- (DPA) i beta-lanca (DPB), oba usidrena u membrani. Ima centralnu ulogu u imunskom sistemu predstavljajući peptide izvedene iz vanćelijskih proteina. Molekule klase II su eksprimirane u ćelijama koje prezentiraju ntigene (APC: B limfociti, dendritske ćelije, makrofagi).[3]

Takkođer pogledajte

[uredi | uredi izvor]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. 1 2 3 ENSG00000224103, ENSG00000206291, ENSG00000168384, ENSG00000228163, ENSG00000236177, ENSG00000235844, ENSG00000231389 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000229685, ENSG00000224103, ENSG00000206291, ENSG00000168384, ENSG00000228163, ENSG00000236177, ENSG00000235844, ENSG00000231389 - Ensembl, maj 2017
  2. "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. 1 2 3 "Entrez Gene: HLA-DPA1 major histocompatibility complex, class II, DP alpha 1".

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]