HLA-DRB5

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
HLA-DRB5
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1FV1, 1H15, 1HQR, 1ZGL

Identifikatori
AliasiHLA-DRB5
Vanjski ID-jeviOMIM: 604776 MGI: 95901 HomoloGene: 101524 GeneCards: HLA-DRB5
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 6 (čovjek)
Hrom.Hromosom 6 (čovjek)[1]
Hromosom 6 (čovjek)
Genomska lokacija za HLA-DRB5
Genomska lokacija za HLA-DRB5
Bend6p21.32Početak32,517,353 bp[1]
Kraj32,530,287 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 17 (miš)
Hrom.Hromosom 17 (miš)[2]
Hromosom 17 (miš)
Genomska lokacija za HLA-DRB5
Genomska lokacija za HLA-DRB5
Bend17 B1|17 17.98 cMPočetak34,524,841 bp[2]
Kraj34,535,648 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija peptide antigen binding
Ćelijska komponenta integral component of membrane
endocytic vesicle membrane
clathrin-coated endocytic vesicle membrane
endozom
Golđijev aparat
trans-Golgi network membrane
endoplasmic reticulum membrane
membrana
late endosome membrane
Golđijeva membrana
Ćelijska membrana
transport vesicle membrane
MHC class II protein complex
lysosomal membrane
Endoplazmatski retikulum
ER to Golgi transport vesicle membrane
Lizozom
integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane
endosome membrane
Egzosom
Biološki proces antigen processing and presentation
antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II
interferon-gamma-mediated signaling pathway
immune system process
T cell costimulation
antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II
GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 Imuni odgovor
T cell receptor signaling pathway
adaptive immune response
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
P04231
P04230
P18468
P18469
O78196
RefSeq (mRNK)

NM_002125

NM_010382

RefSeq (bjelančevina)

NP_002116

NP_034512

Lokacija (UCSC)Chr 6: 32.52 – 32.53 MbChr 17: 34.52 – 34.54 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

DRB5 beta lanac HLA klase II antigena histokompatibilnosti jest protein koji je kod ljudi kodiran genom sa hromosoma 6.[5]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 266 aminokiselina, a molekulska težina 30.056 Da.[5]

1020304050
MVCLKLPGGSYMAKLTVTLMVLSSPLALAGDTRPRFLQQDKYECHFFNGT
ERVRFLHRDIYNQEEDLRFDSDVGEYRAVTELGRPDAEYWNSQKDFLEDR
RAAVDTYCRHNYGVGESFTVQRRVEPKVTVYPARTQTLQHHNLLVCSVNG
FYPGSIEVRWFRNSQEEKAGVVSTGLIQNGDWTFQTLVMLETVPRSGEVY
TCQVEHPSVTSPLTVEWRAQSESAQSKMLSGVGGFVLGLLFLGAGLFIYF
KNQKGHSGLHPTGLVS

Funkcija[uredi | uredi izvor]

Protein kodiran ovim genom pripada HLA klasi II beta lanca paraloga. Molekula klase II je heterodimer koji se sastoji od alfa (DRA) i beta lanca (DRB), oba usidrena u membrani. Ima centralnu ulogu u imunskom sistemu prezentirajući peptide izvedene iz vanćelijskih proteina. Molekule klase II ekspimirane su u ćelijama koje prezentiraju antigen (APC: B limfociti, dendritske ćelije, makrofagi).[5]

Struktura gena i polimorfizmi[uredi | uredi izvor]

Beta lanac velik je otprilike 26-28 kDa. Kodira ga šest egzona; egzon 1 kodira vodeći peptid, egzoni 2 i 3 kodiraju dva vanćelijska domena, egzon 4 kodira transmembranski domen i egzon 5 kodira citoplazmaatski rep. Unutar DR molekula, beta lanac sadrži sve polimorfizme koji određuju specifičnosti vezivanja peptida. Opisane su stotine DRB1 alela i tipizacija za ove polimorfizme radi se rutinski za transplantaciju koštane srži i bubrega.[5]

Ekspresija gena[uredi | uredi izvor]

DRB1 eksprimiran je na nivou pet puta većem od njegovih paraloga DRB3, DRB4 i DRB5. DRB1 je prisutan kod svih osoba. Alelne varijante DRB1 nisu povezane ni sa jednim ili sa jednim od gena DRB3, DRB4 i DRB5. Prisustvo DRB5 je povezano sa alelnim varijantama DRB1, inače se izostavlja. Postoje četiri srodna pseudogena: DRB2, DRB6, DRB7, DRB8 i DRB9.[5]

Također pogledajte[uredi | uredi izvor]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000198502 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000060586 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b c d e "Entrez Gene: HLA-DRB5 major histocompatibility complex, class II, DR beta 5".

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi[uredi | uredi izvor]