Idi na sadržaj

Hromosom 11

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
(Preusmjereno sa Hromosom 11 (čovjek))
Hromosom 11
Par ljudskih hromosoma 11 nakon G-pruganja.
Jedan je od majke, drugi od oca
Par ljudskih hromosoma 11 u kariogramu muškarca
Karakteristike
Dužina (bp)135,086,622 bp
(GRCh38)[1]
Br. gena1.224 (CCDS)
VrstaAutosom
Pozicija centromereSubmetacentrik[2]
(53,4 Mbp)
Kompletan spisak gena
CCDSSpisak gena
HGNCSpisak gena
UniProtSpisak gena
NCBISpisak gena
Vanjski preglednici karata
EnsemblHromosom 11
EntrezHromosom 11
NCBIHromosom 11
UCSCHromosom 11
Potpune DNK sekvence
RefSeqNC_000011 (FASTA)
GenBankCM000673 (FASTA)

Hromosom 11 je autosom i jedan od i23 para hromosoma u ljudskoj garnituri.Osobe normalno imaju po dvije njegove kopije. Prema položaju centromere ,pripada kategoriji submeracentričnih hromosoma. Sadrži oko 134,5 miliona baznih parova (gradivnih elemenata DNK) , a predstavlja 4 – 4,5 % ukupne količine DNK u ćeliji. Ovaj hromosom je jedan od najbogatijih genima u ljudskom genom, pa i onima koji su u vezi sa određenim bolestima. Identifikacija gena na svakom hromosomu jr veoma aktivno područje genetičkih istraživanja. Zato se i procjene broja lokusa na svakom od njih , zavisno od pristupa, međusobno mogu razlikovati. Hromosom 11 sadrži 1.300 – 1.700 gena .

Dosadašnje studije na hromosomu 11 pokazuju 11,6 gena po baznom paru za 1.524 protein-kodirajućih gena i 765 pseudogena .[3] Više od 40% od 856 olfaktorno-receptornih genes u genomu čovjeka je locirano u 28 pojedinačnim i multi-genskim klasterima duž ovog hromosoma.

Broj gena

[uredi | uredi izvor]

Ovo su neke od procjena broja gena za ljudski hromosom 9. Budući da istraživači koriste različite pristupe označavanju genoma, njihova predviđanja broja gena na svakom hromosomu variraju (za tehničke detalje pogledajte predviđanje gena). Među raznim projektima, zajednički Projekt konsenzusnog kodiranja (CCDS) zauzima izuzetno konzervativnu strategiju. Dakle, predviđanje broja gena po CCDS-u predstavlja donju granicu ukupnog broja gena koji kodiraju ljudske proteine.[4]

Baza podataka Protein-kodirajući geni Nonkodirajući geni RNK Pseudogeni Izvor Datum objave
CCDS
1.224 [5] 2016-09-08
HGNC
1.262271666 [6] 2017-05-12
Ensembl
1.3011.060811 [7] 2017-03-29
UniProt
1.327 [8] 2018-02-28
NCBI
1.314860839 [9][10][11] 2017-05-19

Lista gena

[uredi | uredi izvor]

Bolesti i poremećaji

[uredi | uredi izvor]

Sljedeće bolesti su neke od onih koje mogu biti povezane sa gennima na hromosomu 11:

Citogenetičke pruge/bendovi

[uredi | uredi izvor]
G-prugani idiogrami ljudskog hromosoma 11
G-prugani idiogram ljudskog hromosoma 11 u rezoluciji 850 bphs. Dužina pruga na ovom idiogramu proporcionalna je dužini baznog para. Ovaj tip idIograma općenito se upotrebljava u genomskim preglednicima (npr. Ensembl, UCSC genomskom oregledniku).
Obrazac G-pruganja ljudskog hromosoma 11 iu tri različite rezolucije (400,[15] 550[16] i 850[17]). Dužina pruga u ovom idiogramu utemeljena je prema idiogramima ISCN (2013).[18] Ovaj tip idiograma predstavlja razne faze relativne dužine pod optičkim mikroskopom, tokom mitotskog procesa.[19]
G-pruge ljudskog hromosoma 11 u rezoluciji 850 bphs[17]
Hromosom Krak[20] Pruga ISCN
start[21]
NCBI
stop[21]
Bazni par
start
Bazni par
stop
Boja[22] Gustoća
11p 15.5023012.800.000 gneg
11p 15.42304612.800.00111.700.000 gpos50
11p 15.346174511.700.00113.800.000 gneg
11p 15.274593513.800.00116.900.000 gpos50
11p 15.1935124616.900.00122.000.000 gneg
11p 14.31246149022.000.00126.200.000 gpos100
11p 14.21490154526.200.00127.200.000 gneg
11p 14.11545177527.200.00131.000.000 gpos75
11p 131775211431.000.00136.400.000 gneg
11p 122114235736.400.00143.400.000 gpos100
11p 11.22357265543.400.00148.800.000 gneg
11p 11.122655287248.800.00151.000.000 gpos75
11p 11.112872303551.000.00153.400.000 acen
11q 113035319753.400.00155.800.000 acen
11q 12.13197341455.800.00160.100.000 gpos75
11q 12.23414355060.100.00161.900.000 gneg
11q 12.33550368561.900.00163.600.000 gpos25
11q 13.13685403763.600.00166.100.000 gneg
11q 13.24037418666.100.00168.700.000 gpos25
11q 13.34186451268.700.00170.500.000 gneg
11q 13.44512468870.500.00175.500.000 gpos50
11q 13.54688487775.500.00177.400.000 gneg
11q 14.14877514877.400.00185.900.000 gpos100
11q 14.25148525785.900.00188.600.000 gneg
11q 14.35257547488.600.00193.000.000 gpos100
11q 215474569093.000.00197.400.000 gneg
11q 22.15690593497.400.001102.300.000 gpos100
11q 22.259346070102.300.001103.000.000 gneg
11q 22.360706300103.000.001110.600.000 gpos100
11q 23.163006503110.600.001112.700.000 gneg
11q 23.265036693112.700.001114.600.000 gpos50
11q 23.366937167114.600.001121.300.000 gneg
11q 24.171677316121.300.001124.000.000 gpos50
11q 24.273167533124.000.001127.900.000 gneg
11q 24.375337695127.900.001130.900.000 gpos50
11q 2576957980130.900.001135.086.622 gneg

Također pogledajte

[uredi | uredi izvor]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. "Human Genome Assembly GRCh38 - Genome Reference Consortium". National Center for Biotechnology Information (jezik: engleski). 24. 12. 2013. Pristupljeno 4. 3. 2017.
  2. Tom Strachan; Andrew Read (2. 4. 2010). Human Molecular Genetics. Garland Science. str. 45. ISBN 978-1-136-84407-2.
  3. Taylor TD, Noguchi H, Totoki Y, Toyoda A, Kuroki Y, Dewar K, Lloyd C, Itoh T, Takeda T, Kim DW, She X, Barlow KF, Bloom T, Bruford E, Chang JL, Cuomo CA, Eichler E, FitzGerald MG, Jaffe DB, LaButti K, Nicol R, Park HS, Seaman C, Sougnez C, Yang X, Zimmer AR, Zody MC, Birren BW, Nusbaum C, Fujiyama A, Hattori M, Rogers J, Lander ES, Sakaki Y (2006). "Human chromosome 11 DNA sequence and analysis including novel gene identification". Nature. 440 (7083): 497–500. doi:10.1038/nature04632. PMID 16554811.CS1 održavanje: više imena: authors list (link)
  4. Pertea M, Salzberg SL (2010). "Between a chicken and a grape: estimating the number of human genes". Genome Biol. 11 (5): 206. doi:10.1186/gb-2010-11-5-206. PMC 2898077. PMID 20441615.
  5. "Search results - 1[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("has ccds"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. CCDS Release 20 for Homo sapiens. 8. 9. 2016. Pristupljeno 28. 5. 2017.
  6. "Statistics & Downloads for chromosome 9". HUGO Gene Nomenclature Committee. 12. 5. 2017. Arhivirano s originala, 20. 3. 2021. Pristupljeno 19. 5. 2017.
  7. "Chromosome 9: Chromosome summary - Homo sapiens". Ensembl Release 88. 29. 3. 2017. Pristupljeno 19. 5. 2017.
  8. "Human chromosome 9: entries, gene names and cross-references to MIM". UniProt. 28. 2. 2018. Pristupljeno 16. 3. 2018.
  9. "Search results - 9[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("genetip [[protein]] coding"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 19. 5. 2017. Pristupljeno 20. 5. 2017. Sukob URL-a i wikilinka (pomoć)
  10. "Search results - 9[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ( ("genetype miscrna"[Properties] OR "genetype ncrna"[Properties] OR "genetype rrna"[Properties] OR "genetype trna"[Properties] OR "genetype scrna"[Properties] OR "genetype snrna"[Properties] OR "genetype snorna"[Properties]) NOT "genetype protein coding"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 19. 5. 2017. Pristupljeno 20. 5. 2017.
  11. "Search results - 9[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("genetype pseudo"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 19. 5. 2017. Pristupljeno 20. 5. 2017.
  12. [http: Kodira//ghr.nlm.nih.gov/gene/INS INS - insulin - Genetics Home Reference]
  13. "Human Genome Project Information Site Has Been Updated". Arhivirano s originala, 10. 7. 2012. Pristupljeno 4. 1. 2009.
  14. "Autism gene breakthrough hailed". Health. BBC NEWS. 19. 2. 2007. Pristupljeno 2. 1. 2010.
  15. Genome Decoration Page, NCBI. Ideogram data for Homo sapience (400 bphs, Assembly GRCh38.p3). Last update 2014-03-04. Retrieved 2017-04-26.
  16. Genome Decoration Page, NCBI. Ideogram data for Homo sapience (550 bphs, Assembly GRCh38.p3). Last update 2015-08-11. Retrieved 2017-04-26.
  17. 1 2 Genome Decoration Page, NCBI. Ideogram data for Homo sapience (850 bphs, Assembly GRCh38.p3). Last update 2014-06-03. Retrieved 2017-04-26.
  18. International Standing Committee on Human Cytogenetic Nomenclature (2013). ISCN 2013: An International System for Human Cytogenetic Nomenclature (2013). Karger Medical and Scientific Publishers. ISBN 978-3-318-02253-7.
  19. Sethakulvichai, W.; Manitpornsut, S.; Wiboonrat, M.; Lilakiatsakun, W.; Assawamakin, A.; Tongsima, S. (2012). "Estimation of band level resolutions of human chromosome images". In Computer Science and Software Engineering (JCSSE), 2012 International Joint Conference on: 276–282. doi:10.1109/JCSSE.2012.6261965. ISBN 978-1-4673-1921-8. S2CID 16666470.
  20. p: Kratki krak; q: Dugi krak.
  21. 1 2 These values (ISCN start/stop) are based on the length of bands/ideograms from the ISCN book, An International System for Human Cytogenetic Nomenclature (2013). Arbitrarna jedinica.
  22. gpos: Regija koja je pozitivno obojena G-prugama, općenito bogata AT i siromašna genima; gneg: Regija koja je negativno obojena G-prugama, općenito bogata CG i bogata genima; acen Centromera. var: Varijabilna regija; stslk: drška.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]