IFNGR

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
IFNGR1
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1FG9, 1FYH, 1JRH

Identifikatori
AliasiIFNGR1
Vanjski ID-jeviOMIM: 107470 MGI: 107655 HomoloGene: 359 GeneCards: IFNGR1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 6 (čovjek)
Hrom.Hromosom 6 (čovjek)[1]
Hromosom 6 (čovjek)
Genomska lokacija za IFNGR1
Genomska lokacija za IFNGR1
Bend6q23.3Početak137,197,483 bp[1]
Kraj137,219,449 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 10 (miš)
Hrom.Hromosom 10 (miš)[2]
Hromosom 10 (miš)
Genomska lokacija za IFNGR1
Genomska lokacija za IFNGR1
Bend10 A3|10 8.49 cMPočetak19,467,697 bp[2]
Kraj19,485,977 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija interferon-gamma receptor activity
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
GO:0019974 cytokine binding
GO:0016518 cytokine receptor activity
Ćelijska komponenta integral component of membrane
integral component of plasma membrane
membrana
ćelijska membrana
Biološki proces response to virus
regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway
GO:0072468 Transdukcija signala
interferon-gamma-mediated signaling pathway
cytokine-mediated signaling pathway
microglial cell activation
GO:1901313 positive regulation of gene expression
astrocyte activation
negative regulation of amyloid-beta clearance
positive regulation of amyloid-beta formation
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_000416
NM_001363526
NM_001363527

NM_010511

RefSeq (bjelančevina)

NP_000407
NP_001350455
NP_001350456

NP_034641

Lokacija (UCSC)Chr 6: 137.2 – 137.22 MbChr 10: 19.47 – 19.49 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš
Interferonski gama receptor 1
Kristalografska struktura 3:2 kompleksa alfa lanca receptora IFN-γ (IFNGR1) (zelena, cijan i zelena/cijan) i IFN-γ ligand (crvena i narandžasta).[5]
Identifikatori
SimbolIFNGR1
Alt. simboliIFNGR
NCBI gen3459
HGNC5439
OMIM107470
RefSeqNM_000416
UniProtP15260
Ostali podaci
LokusHrom. 6 q23-q24
Pretraga za
StruktureSwiss-model
DomeneInterPro
Interferonski gama receptor 2 (interferonski gama transduktor 1)
Identifikatori
SimbolIFNGR2
Alt. simboliIFNGT1
NCBI gen3460
HGNC5440
OMIM147569
RefSeqNM_005534
UniProtP38484
Ostali podaci
LokusHrom. 21 q22.1
Pretraga za
StruktureSwiss-model
DomeneInterPro

Interferonski gama receptor (IFNGR) jest proteinski kompleks, heterodimer od dva lanca: IFNGR1 i IFNGR2. Veže Interferon-gamainterferon-γ, jedini član interferona tipa II.

Struktura i funkcija[uredi | uredi izvor]

Proteinski kompleks ljudskih interferon-gama receptora sastoji se od heterodimera dva lanca: IFNGR1 i IFNGR2.[6][7] U nestimuliranim ćelijama, ove podjedinice nisu međusobno unaprijed povezane, već se preko svojih unutarćelijskih domena povezuju s neaktivnim oblicima specifičnih kinaza porodice Janus (Jak1 i Jak2). Jak1 i Jak2 konstitutivno su povezani sa IFNGR1, odnosno IFNGR2. Vezivanje IFN-γ za IFNGR1 inducira brzu dimerizaciju lanaca IFNGR1, čime se formira mjesto koje je prepoznato po vanćelijskom domenu IFNGR2. Sklop kompletnog receptorskog kompleksa induciranog ligandom sadrži po dvije IFNGR1 i IFNGR2 podjedinice, koje dovode u blisku sučeljavanje unutarćelijske domene ovih proteina zajedno s neaktivnim kinazama Jak1 i Jak2 s kojima su povezane. U ovom kompleksu, Jak1 i Jak2 se međusobno transaktiviraju, a zatim fosforiliraju IFNGR1, formirajući tako upareni skup pristanišnih mjesta Stat1 na ligatu. Dvije molekule Stat1 tada se povezuju sa uparenim mjestima za vezanje, dovodeći se u neposrednu blizinu s receptor-aktiviranim JAK kinazama i aktiviraju se fosforilacijom Stat1. Tirozin-fosforilirane molekule Stat1 odvajaju se od svoje receptorske veze i tvore homodimerne komplekse. Aktivirani Stat1 se translocira u jedro i, nakon vezivanja za specifičnu sekvencu u promotorske regije genski induciranih IFN-γ efekata transkripcije).

Klinički značaj[uredi | uredi izvor]

Nedostatak IFNGR1 povezan je s povećanom osjetljivošću na određene zarazne bolesti kod pacijenata, posebno na mikobakterijske infekcije.[8][9]

Mutacije[uredi | uredi izvor]

Diseminirane infekcije BCG javljaju se kod dojenčadi sa teškom kombiniranom imunodeficijencijom ili sa drugim teškim oštećenjima T-ćelija. Međutim, u otprilike polovini slučajeva nije pronađen specifičan nedostatak domaćina. Jedno moguće objašnjenje za ovu sklonost pronađeno je kod 2,5-mjesečne Tunižanke koja je imala fatalnu idiopatsku diseminiranu BCG infekciju.[10] Četvero djece s Malte imalo je diseminiranu atipisku mikobakterijsku infekciju u nedostatku prepoznate imunodeficijencije.[11] U slučaju petoro druge djece, postojao je srodstvo u njihovim rodoslovima. Utvrđeno je da svi pogođeni imaju funkcionalni nedostatak u povećanju proizvodnje TNFα u krvnim makrofagima, kao odgovor na stimulaciju s IFNγ. Nadalje, svima je nedostajala ekspresija IFNγR u monocitima ili limfocitima, a za svakog je utvrđeno da ima mutaciju u genu na hromosomu 6, regija q22-q23 koji kodira IFNγR1. Zanimljivo je da ova djeca nisu podložna infekciji drugim uzročnicima osim mikobakterija. Činilo se da je odgovor Th1-a normalan kod ovih pacijenata. Osjetljivost ove djece na mikobakterijske infekcije stoga očito proizlazi iz unutrašnjeg oštećenja odgovora IFNγ puta na ove određene unutarćelijske patogene, što pokazuje da je IFNγ obavezan za efikasno antimikobakterijsko djelovanje makrofaga. Od prvih otkrića ljudi s nedostatkom IFNγR1, pronađeno je još mnogo primjera, a pronađene su i osobe s nedostatkom IFNγR2.[12][13]

Također pogledajte[uredi | uredi izvor]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000027697 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000020009 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ PDB 1FG9; Thiel DJ, le Du MH, Walter RL, D'Arcy A, Chène C, Fountoulakis M, Garotta G, Winkler FK, Ealick SE (septembar 2000). "Observation of an unexpected third receptor molecule in the crystal structure of human interferon-gamma receptor complex". Structure. 8 (9): 927–36. doi:10.1016/S0969-2126(00)00184-2. PMID 10986460.
  6. ^ Bach EA, Aguet M, Schreiber RD (1997). "The IFN gamma receptor: a paradigm for cytokine receptor signaling". Annu. Rev. Immunol. 15: 563–91. doi:10.1146/annurev.immunol.15.1.563. PMID 9143700.
  7. ^ Pestka S, Kotenko SV, Muthukumaran G, Izotova LS, Cook JR, Garotta G (1997). "The interferon gamma (IFN-gamma) receptor: a paradigm for the multichain cytokine receptor". Cytokine Growth Factor Rev. 8 (3): 189–206. doi:10.1016/S1359-6101(97)00009-9. PMID 9462485.
  8. ^ Jouanguy E, Lamhamedi-Cherradi S, Lammas D, Dorman SE, Fondanèche MC, Dupuis S, Döffinger R, Altare F, Girdlestone J, Emile JF, Ducoulombier H, Edgar D, Clarke J, Oxelius VA, Brai M, Novelli V, Heyne K, Fischer A, Holland SM, Kumararatne DS, Schreiber RD, Casanova JL (1999). "A human IFNGR1 small deletion hotspot associated with dominant susceptibility to mycobacterial infection". Nat. Genet. 21 (4): 370–8. doi:10.1038/7701. PMID 10192386. S2CID 27637137.
  9. ^ Levin M, Newport MJ, D'Souza S, Kalabalikis P, Brown IN, Lenicker HM, Agius PV, Davies EG, Thrasher A, Klein N (1995). "Familial disseminated atypical mycobacterial infection in childhood: a human mycobacterial susceptibility gene?". Lancet. 345 (8942): 79–83. doi:10.1016/S0140-6736(95)90059-4. PMID 7815885. S2CID 28602598.
  10. ^ Jouanguy E, Altare F, Lamhamedi S, et al. Interferon-gamma-receptor deficiency in an infant with fatal bacille Calmette-Guerin infection. N Engl J Med. 1996;335:1956–1961.
  11. ^ . Newport MJ, Huxley CM, Huston S, et al. A mutation in the interferon-gamma-receptor gene and susceptibility to mycobacterial infection. N Engl J Med. 1996;335:1941–1949.
  12. ^ Dorman SE, Holland SM. Interferon-gamma and interleukin-12 pathway defects and human disease. Cytokine Growth Factor Rev. 2000;11(4):321–333.
  13. ^ Newport MJ, Holland SM, Levin M, et al. Inherited disorders of the interleukin-12/23-interferon gamma axis. In: Ochs HD, Smith CIE, Puck JM, e eds. Primary immunodeficiency diseases: a molecular and genetic approach. Oxford: Oxford University Press, 2007: 390–401.

Vanjski linkovi[uredi | uredi izvor]