IK (gen)

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
IK (gen)
Identifikatori
AliasiIK
Vanjski ID-jeviOMIM: 600549 MGI: 1345142 HomoloGene: 36193 GeneCards: IK
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 5 (čovjek)
Hrom.Hromosom 5 (čovjek)[1]
Hromosom 5 (čovjek)
Genomska lokacija za IK (gen)
Genomska lokacija za IK (gen)
Bend5q31.3Početak140,647,058 bp[1]
Kraj140,662,480 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 18 (miš)
Hrom.Hromosom 18 (miš)[2]
Hromosom 18 (miš)
Genomska lokacija za IK (gen)
Genomska lokacija za IK (gen)
Bend18|18 B2Početak36,877,709 bp[2]
Kraj36,890,692 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 protein binding
identical protein binding
Ćelijska komponenta nuclear speck
nuclear chromosome
mitotic spindle pole
spindle pole
Nukleoplazma
spliceosomal complex
hromosom
citoplazma
citoskelet
Jedro
U2-type precatalytic spliceosome
Biološki proces GO:0007067 Mitoza
mitotic spindle assembly checkpoint signaling
protein localization to kinetochore
mRNA processing
Prerada RNK
GO:0022415 viral process
mRNA splicing, via spliceosome
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_006083

NM_011879

RefSeq (bjelančevina)

NP_006074
NP_006074.2

NP_036009

Lokacija (UCSC)Chr 5: 140.65 – 140.66 MbChr 18: 36.88 – 36.89 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Protein Red jest protein koji je kod ljudi kodiran genom IK sa hromosoma 5.[5][6]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 557 aminokiselina, а molekulska težina 65.602 Da.[7]

1020304050
MPERDSEPFSNPLAPDGHDVDDPHSFHQSKLTNEDFRKLLMTPRAAPTSA
PPSKSRHHEMPREYNEDEDPAARRRKKKSYYAKLRQQEIERERELAEKYR
DRAKERRDGVNKDYEETELISTTANYRAVGPTAEADKSAAEKRRQLIQES
KFLGGDMEHTHLVKGLDFALLQKVRAEIASKEKEEEELMEKPQKETKKDE
DPENKIEFKTRLGRNVYRMLFKSKAYERNELFLPGRMAYVVDLDDEYADT
DIPTTLIRSKADCPTMEAQTTLTTNDIVISKLTQILSYLRQGTRNKKLKK
KDKGKLEEKKPPEADMNIFEDIGDYVPSTTKTPRDKERERYRERERDRER
DRDRDRERERERDRERERERDREREEEKKRHSYFEKPKVDDEPMDVDKGP
GSTKELIKSINEKFAGSAGWEGTESLKKPEDKKQLGDFFGMSNSYAECYP
ATMDDMAVDSDEEVDYSKMDQGNKKGPLGRWDFDTQEEYSEYMNNKEALP
KAAFQYGIKMSEGRKTRRFKETNDKAELDRQWKKISAIIEKRKKMEADGV
EVKRPKY

Funkcija[uredi | uredi izvor]

Protein kodiran ovim genom identificiran je njegovim RED ponavljanjem, nizom ponovljenih ostataka arginina, glutaminske kiseline i asparaginske kiseline. Protein se nalazi u diskretnim tačkicama unutar jedra, isključujući nukleolus. Njegova funkcija nije poznata. Ovaj gen se mapira na hromosomu 5; međutim, njegov pseudogen može biti i na hromosomu 2.[6]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000113141 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024474 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Krief P, Augery-Bourget Y, Plaisance S, Merck MF, Assier E, Tanchou V, Billard M, Boucheix C, Jasmin C, Azzarone B (Dec 1994). "A new cytokine (IK) down-regulating HLA class II: monoclonal antibodies, cloning and chromosome localization". Oncogene. 9 (12): 3449–56. PMID 7970704.
  6. ^ a b "Entrez Gene: IK IK cytokine, down-regulator of HLA II".
  7. ^ "UniProt, Q13123" (jezik: engleski). Pristupljeno 16. 10. 2021.

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]