ITPA

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
Idi na navigaciju Idi na pretragu
ITPA
Protein ITPA PDB 2car.png
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2CAR, 2I5D, 2J4E, 4F95

Identifikatori
AliasiITPA
Vanjski ID-jeviOMIM: 147520 MGI: 96622 HomoloGene: 6289 GeneCards: ITPA
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 20 (čovjek)
Hrom.Hromosom 20 (čovjek)[1]
Hromosom 20 (čovjek)
Genomska lokacija za ITPA
Genomska lokacija za ITPA
Bend20p13Početak3,208,868 bp[1]
Kraj3,223,870 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 2 (miš)
Hrom.Hromosom 2 (miš)[2]
Hromosom 2 (miš)
Genomska lokacija za ITPA
Genomska lokacija za ITPA
Bend2 F1|2 63.24 cMPočetak130,667,610 bp[2]
Kraj130,681,614 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
PBB GE ITPA 209171 at fs.png
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija nucleotide binding
dITP diphosphatase activity
XTP diphosphatase activity
ITP diphosphatase activity
hydrolase activity
metal ion binding
nucleotide diphosphatase activity
NADH pyrophosphatase activity
nucleoside-triphosphate diphosphatase activity
identical protein binding
Ćelijska komponenta citoplazma
citosol
Biološki proces ITP catabolic process
nucleotide metabolic process
chromosome organization
nucleoside triphosphate catabolic process
purine nucleotide catabolic process
deoxyribonucleoside triphosphate catabolic process
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)
NM_001267623
NM_033453
NM_181493
NM_001324236
NM_001324237

NM_001324238
NM_001324240
NM_001351739

NM_025922
NM_001362648

RefSeq (bjelančevina)
NP_001254552
NP_001311165
NP_001311166
NP_001311167
NP_001311169

NP_258412
NP_852470
NP_001338668

NP_080198
NP_001349577

Lokacija (UCSC)Chr 20: 3.21 – 3.22 MbChr 2: 130.67 – 130.68 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Inozin-trifosfat pirofosfataza jest enzim koji je kod ljudi kodiran genom ITPA,[5][6] gwenom rdgB kod bakterija E.coli[7] i genom HAM1 kod kvasca S. cerevisiae.[8] Za ovaj gen pronađene su dvije varijante transkripta koje kodiraju dvije različite izoforme. Također, identificirane su najmanje dvije druge varijante transkripta koje su vjerovatno regulatorni, a ne kodirajući proteini.

Funkcija[uredi | uredi izvor]

Protein kodiran ovim genom, hidrolizira inozin-trifosfat i deoksiinozin-trifosfat u monofosfat-nukleotid i difosfat.[6] Enzim ima višestruku specifičnost za supstrat i djeluje na druge nukleotide, uključujući ksantozin-trifosfat i dezoksiksantozin-trifosfat.[8] Kodirani protein, koji je član porodice HAM1 NTPaze, nalazi se u citoplazmi i djeluje kao homodimer.

Klinički značaj[uredi | uredi izvor]

Defekti kodiranog proteina mogu rezultirati nedostatkom inozin-trifosfat pirofosforilaze.[6] Enzim ITPaza defosforilizira ribavirin-trifosfat in vitro u ribavirin-monofosfat, a ITPazna smanjena enzimska aktivnost prisutna kod 30% ljudi pojačava mutagenezu virusa za hepatitis C.[9] Genske varijante koje predviđaju smanjenu aktivnost ITPaze povezane su sa smanjenim rizikom od anemije izazvane ribavirinom, povećanim rizikom od trombocitopenije, nižim koncentracijama ribavirina, kao i smanjenim rizikom relapsa sličnog ribavirinu, nakon terapije virusa hepatitisa C (HCV), zasnovane na interferonu infekcija v irisom genotipa 2 ili 3.[10]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000125877 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000074797 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Lin S, McLennan AG, Ying K, Wang Z, Gu S, Jin H, Wu C, Liu W, Yuan Y, Tang R, Xie Y, Mao Y (maj 2001). "Cloning, expression, and characterization of a human inosine triphosphate pyrophosphatase encoded by the itpa gene". J Biol Chem. 276 (22): 18695–701. doi:10.1074/jbc.M011084200. PMID 11278832.
  6. ^ a b c "Entrez Gene: ITPA inosine triphosphatase (nucleoside triphosphate pyrophosphatase)".
  7. ^ Burgis NE, Cunningham RP (2007). "Substrate specificity of RdgB protein, a deoxyribonucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase". J Biol Chem. 282 (8): 3531–8. doi:10.1074/jbc.M608708200. PMID 17090528.
  8. ^ a b Davies O, Mendes P, Smallbone K, Malys N (2012). "Characterisation of multiple substrate-specific (d)ITP/(d)XTPase and modelling of deaminated purine nucleotide metabolism". BMB Reports. 45 (4): 259–64. doi:10.5483/BMBRep.2012.45.4.259. PMID 22531138.
  9. ^ Nyström K, Wanrooij PH, Waldenström J, Adamek L, Brunet S, Said J, Nilsson S, Wind-Rotolo M, Hellstrand K, Norder H, Tang KW, Lagging M (oktobar 2018). "Inosine Triphosphate Pyrophosphatase Dephosphorylates Ribavirin Triphosphate and Reduced Enzymatic Activity Potentiates Mutagenesis in Hepatitis C Virus". Journal of Virology. 92 (19): 01087–18. doi:10.1002/hep.27009. PMC 6146798. PMID 30045981.
  10. ^ Rembeck K, Waldenstrom J, Hellstrand K, Nilsson S, Nyström K, Martner A, Lindh M, Norkrans G, Westin J, Pedersen C, Färkkil M, Langeland N, Rauning Buhl M, Morch K, Brehm Christensen P, and Lagging M (juni 2014). "Variants of the inosine triphosphate pyrophosphatase gene are associated with reduced relapse risk following treatment for HCV genotype 2/3". Hepatology. 59 (6): 2131–2139. doi:10.1002/hep.27009. PMID 24519039.

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]