KATNBL1

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
KATNBL1
Identifikatori
AliasiKATNBL1
Vanjski ID-jeviOMIM: 616235 MGI: 1919675 HomoloGene: 11495 GeneCards: KATNBL1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 15 (čovjek)
Hrom.Hromosom 15 (čovjek)[1]
Hromosom 15 (čovjek)
Genomska lokacija za KATNBL1
Genomska lokacija za KATNBL1
Bend15q14Početak34,140,674 bp[1]
Kraj34,210,096 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 2 (miš)
Hrom.Hromosom 2 (miš)[2]
Hromosom 2 (miš)
Genomska lokacija za KATNBL1
Genomska lokacija za KATNBL1
Bend2|2 E3Početak112,209,556 bp[2]
Kraj112,244,585 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Ćelijska komponenta Jedarce
spindle pole
Jedro
citoplazma
citoskelet
mitotic spindle pole
Biološki proces positive regulation of cytoskeleton organization
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_024713

NM_024254

RefSeq (bjelančevina)

NP_078989

NP_077216

Lokacija (UCSC)Chr 15: 34.14 – 34.21 MbChr 2: 112.21 – 112.24 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

KATNBL1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom KATNBL1.[5][6]

Katanini su ATPaze za razlaganje mikrotubula, a sastoje se od katalitskih i regulatornih podjedinica, koje reguliraju dužinu mitotskog vretena. Predviđa se da će KATNBL1 funkcionirati kao regulatorna podjedinica katanina (Roll-Mecak i McNally, 2010). Patricia Hartz (2015) mapirala je gen KATNBL1 u hromosom 15q14, na osnovu poravnanja sekvence KATNBL1 (GenBank AK026210) sa genomskom sekvencom (GRCh38).[7]

Kloniranje i ekspresija[uredi | uredi izvor]

Analizom baze podataka, Roll-Mecak i McNally (2010) identificirali su C15ORF29 kao vjerovatnu regulatornu podjedinicu katanina. Međutim, za razliku od kanonske regulatorne podjedinice p80 katanina KATNB1, C15ORF29 nema N-terminalni WD40 domen i ima samo konzerviranu C-terminalni domen.[8]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 304 aminokiseline, a molekulska težina 34.767 Da.[9].

1020304050
MASETHNVKKRNFCNKIEDHFIDLPRKKISNFTNKNMKEVKKSPKQLAAY
INRTVGQTVKSPDKLRKVIYRRKKVHHPFPNPCYRKKQSPGSGGCDMANK
ENELACAGHLPEKLHHDSRTYLVNSSDSGSSQTESPSSKYSGFFSEVSQD
HETMAQVLFSRNMRLNVALTFWRKRSISELVAYLLRIEDLGVVVDCLPVL
TNCLQEEKQYISLGCCVDLLPLVKSLLKSKFEEYVIVGLNWLQAVIKRWW
SELSSKTEIINDGNIQILKQQLSGLWEQENHLTLVPGYTGNIAKDVDAYL
LQLH
Simboli

Funkcija gena[uredi | uredi izvor]

Koristeći ljudske proteine eksprimirane u E. coli, McNally i McNally (2011) otkrili su da je C15ORF29 vezao stabilizirane mikrotubule in vitro. Dodavanjem katalitske kataninske podjedinice KATNAL1 povećan je afinitet vezanja mikrotubula iznad onog koji se mjeri za bilo koji protein. Analiza mutacije otkrila je da je C15ORF29 vezao KATNAL1 preko N-terminalnog domena.[10]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000134152 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000027132 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Bocher M, Blocker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Dusterhoft A, Beyer A, Kohrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwalder B, Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (Mar 2001). "Toward a Catalog of Human Genes and Proteins: Sequencing and Analysis of 500 Novel Complete Protein Coding Human cDNAs". Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
  6. ^ "Entrez Gene: C15orf29 chromosome 15 open reading frame 29".
  7. ^ Hartz, P. A. Personal Communication. Baltimore, Md. 2/19/2015.
  8. ^ Roll-Mecak, A., McNally, F. J. Microtubule-severing enzymes. Curr. Opin. Cell Biol. 22: 96-103, 2010. PubMed: 19963362
  9. ^ "UniProt, Q9H079". Pristupljeno 15. 7. 2021.
  10. ^ McNally, K. P., McNally, F. J. The spindle assembly function of Caenorhabditis elegans katanin does not require microtubule-severing activity. Molec. Biol. Cell 22: 1550-1560, 2011. Note: Erratum: Molec. Biol. Cell 23: 4472 only, 2012. PubMed: 21372175

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi[uredi | uredi izvor]