Katepsin F

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
Jump to navigation Jump to search
Katepsin F
Protein CTSF PDB 1m6d.png
Trakasti model PPCA-Dimera
Identifikatori
Simbol CTSF; CATSF; CLN13
Pfam PF00112
Pfam clan CL0125
InterPro IPR000668
SMART Pept_C1
PROSITE PDOC00126
MEROPS C1
SCOP 1aec
SUPERFAMILY 1aec

Katepsin F (EC 3.4.22.41 je enzim iz familije papaina, koji je kod čovjeka kodiran iz gena CTSF.[1][2][3][4][5][6][7]

Katepsin F, kao rekombinantni enzim, katalizira sledeću hemijsku reakciju:

razlaže sintetske supstrate sa fenilalaninom (Phe) i leucinom (Leu) (u većoj mjeri nego valinom (Val) u P2, sa visokom specifičnošću, sličnom kao i katepsin L.

Katepsini su papainska porodice cistein proteinaza koje predstavljaju glavnu komponentu lizosomnih proteolitskih sistema. U principu, sadrže signalne sekvence, praćene propeptidima, a zatim katalitski aktivnu zrelu regiju. Veoma su dug (ostaci 251 aminokiseline). Prekursor za regiju katepsina F sadrži domene C-kraja koje su slične pro-segmentu katepsina L, sa 50 ostataka fleksibilnog linker peptida, domena N-kraja, izgleda da ima put sličan cistatinskom savijanju. Proregikja katepsin F je jedinstvena u cistein proteaznoj porodici papain u tome što sadrži taj dodatni N-terminalni segment predviđen da dijeli strukturnu sličnosti sa inhibitorima cistein proteaza cistatinske superfamilije C1. Ova cisteinolika domena sadrži neke elemente za koje je poznato da su važne za inhibicijske aktivnosti. CTSF kodira predvidivi protein od 484 aminokiselinae, koji, u signalnom peptidu, sadrži 19 ostataka. Katepsin F sadrži pet potencijalnih lokacija N-glikozilacije, može biti usmjeren na endosomno/lizosomne pregrade preko receptorskog puta manoza 6-fosfata. Gen za katepsin F se sveprisutno ispoljava, a mapiran je na hromosomu 11: *pozicija 11q13, u neposrednoj blizini gena koji kodira katepsin W.

Također pogledajte[uredi | uredi izvor]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ Cornish-Bowden A. (2004): Fundamentals of enzyme kinetics, 3rd Ed. Portland Press. ISBN 9781855781580; ISBN 1855781581.
  2. ^ Međedović S., Maslić E., Hadžiselimović R. (2000): Biologija 2. Svjetlost, Sarajevo, ISBN 9958-10-222-6.
  3. ^ Bajrović K, Jevrić-Čaušević A., Hadžiselimović R., Ed. (2005): Uvod u genetičko inženjerstvo i biotehnologiju. Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju (INGEB), Sarajevo, ISBN 9958-9344-1-8.
  4. ^ Santamaría, I., Velasco, G., Pendás, A.M., Paz, A. and López-Otín, C. (1999). "Molecular cloning and structural and functional chararcterization of cathepsin F, a new cysteine proteinase of the papain family with a long propeptide domain". J. Biol. Chem. 274: 13800–13809. PMID 10318784. 
  5. ^ Nägler, D.K. Sulea, T. and Ménard, R. (1999). "Full length cDNA of human cathepsin F predicts the presence of a cystatin domain at the N-terminus of the cysteine protease zymogen". Biochem. Biophys. Res. Commun. 257: 313–318. PMID 10198209. 
  6. ^ Wex, T., Levy, B., Wex, H. and Brömme, D. (1999). "Human cathepsins F and W: A new subgroup of cathepsins". Biochem. Biophys. Res. Commun. 259: 401–407. PMID 10362521. 
  7. ^ Wang, B., Shi, G.-P., Yao, P.M., Li, Z., Chapman, H.A. and Brömme, D. (1998). "Human cathepsin F. Molecular cloning, functional expression, tissue localization, and enzymatic characterization". J. Biol. Chem. 273: 32000–32008. PMID 9822672. 

Vanjski linkovi[uredi | uredi izvor]