Proteini Ku70 i Ku80 sastoje se od po tri strukturna domena. N-krajev domen je alfa/beta domen. Ovaj domen daje samo mali doprinos interfejsu dimera. Domen se sastoji od šestolančanog beta-listaRossmannovog nabora.[4] Centralni domen Ku70 i Ku80 je DNK-vezujući beta-barelski domen. Ku ostvaruje samo nekoliko kontakata sa šećerno-fosfatnom okosnicom, a nijedan sa DNK-bazama, ali se sterno uklapa u glavni i mali žljeb, formirajući prsten koji okružuje dupleks DNK, držeći dva puna okreta DNK molekula. Formiranjem mosta između slomljenih krajeva DNK, Ku djeluje tako da strukturno podupire i poravnava krajeve DNK, da ih zaštiti od degradacije i da spriječi promiskuitetno vezivanje za neprekinuti DNK. Ku efikasno poravnava DNK, dok i dalje dozvoljava pristup polimerazama, nukleazama i ligazama slomljenim krajevima DNK kako bi promovirao spajanje krajeva.[5]C-terminalni krak je alfa spiralni region koji obuhvata centralni beta-barelski domen suprotne podjedinice.[1] U nekim slučajevima je četvrti domen prisutan na C-terminalu, koji se vezuje za DNK zavisnu protein kinaznu katalitsku podjedinicu.[6]
Mutantni miševi defektni u Ku70 i Ku80, ili dvostruki mutantni miševi s nedostatkom i Ku70 i Ku80 pokazuju rano starenje.[11] Srednji životni vijek tri mutantna soja miševa bio je sličan jedan drugom, oko 37 sedmica, u poređenju sa 108 sedmica za kontrolu divljeg tipa. Ispitano je šest specifičnih znakova starenja, a utvrđeno je da tri mutantna miša pokazuju iste znakove starenja kao kontrolni miševi, ali u mnogo ranijoj dobi. Incidencija raka nije povećana kod mutantnih miševa. Ovi rezultati sugeriraju da je funkcija Ku važna za osiguranje dugovječnosti i da NHEJ put popravke DNK (posredovan Ku-om) ima ključnu ulogu u popravljanju dvolančanih prekida DNK koji bi inače uzrokovao rano starenje.[12]
Ku70 i Ku80 su također eksperimentalno okarakterizirani u biljkama, gdje se čini da imaju sličnu ulogu kao kod drugih eukariota. U riži se pokazalo da supresija bilo kojeg proteina potiče homolognu rekombinaciju (HR)[13] Ovaj efekt je iskorišćen da se poboljša efikasnost genskog ciljanja (GT) u Arabidopsis thaliana. U studiji je učestalost GT-a zasnovanog na HR uz korištenje nukleaze cinkovog prsta (ZFN) povećana do šesnaest puta kod mutanata ku70.[14] Ovaj rezultat ima obećavajuće implikacije za uređivanje genoma kod eukariota jer su DSB mehanizmi popravka visoko konzervirani. Značajna razlika je u tome što kod biljaka Ku također učestvuje u održavanju alternativne morfologije telomera koju karakteriziraju tupi krajevi ili kratki (≤ 3-nt) 3’ prevjesi.[15] Ova funkcija je nezavisna od uloge Ku-a u popravljanju DSB-a, jer se pokazalo da uklanjanje sposobnosti kompleksa Ku da se translocira duž DNK konzr+ervira telomere sa tupim krajevima dok ometa popravak DNK.[16]
Arheje obično takođe imaju samo jedan Ku gen (za ~4% vrsta koje ga uopće imaju). Evolucijska povijest je zamagljena opsežnim horizontalnim prijenosom gena s bakterijama.[18]
Bakterijski i arhejski Ku proteini se razlikuju od svojih eukariotskih parnjaka po tome što imaju samo centralni domen beta-barela.
^Sugihara T, Wadhwa R, Kaul SC, Mitsui Y (april 1999). "A novel testis-specific metallothionein-like protein, tesmin, is an early marker of male germ cell differentiation". Genomics. 57 (1): 130–6. doi:10.1006/geno.1999.5756. PMID10191092.
^Harris R, Esposito D, Sankar A, Maman JD, Hinks JA, Pearl LH, Driscoll PC (januar 2004). "The 3D solution structure of the C-terminal region of Ku86 (Ku86CTR)". J. Mol. Biol. 335 (2): 573–82. doi:10.1016/j.jmb.2003.10.047. PMID14672664.
