LINC00926
| LINC00926 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | LINC00926 | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | GeneCards: LINC00926 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez |
| ||||||||||||||||||||||||
| Ensembl |
| ||||||||||||||||||||||||
| UniProt |
| ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) |
|
| |||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) |
|
| |||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 15: 57.3 – 57.31 Mb | n/a | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [2] | n/a | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Duga međugenska protein-nekodirajuća iRNK 926 je protein koji je kod ljudi kodiran genom LINC00926 .[3]
Prethodni izvještaj pokazao je da bi LINC00926 mogao biti uključen u suzbijanje metastaza raka dojke. Međutim, studije u vezi s funkcijom LINC00926 kod adenokarcinoma pluća su rijetke.
Postoje podaci o 10 sekvenciranja jednolančane RNK(scRNA-seq) za osam zdravih plućnih tkiva i pet tkiva plućnog adenokarcinoma. Sekvenca LINC00926 dobijena je iz baze Noncode (http://www.noncode.org/ Arhivirano 22. 2. 2011. na Wayback Machine), a ćelijsku lokaciju lncRNA-a je predvidio lncLocator (http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/lncLocator/ Arhivirano 15. 7. 2021. na Wayback Machine ). Ciljanu miRNK lncRNK je predvidio Starbase (http://starbase.sysu.edu.cn/ Arhivirano 22. 2. 2011. na Wayback Machine). Ciljne gene miRNK predvidio je miRDB (http://mirdb.org/). Funkcionalnu anotaciju ciljnih gena napravio je DAVID (https://david.ncifcrf.gov/ Arhivirano 20. 7. 2021. na Wayback Machine). Ukupni opstanak pacijenata u TCGA-LUAD sa različitim nivoom ekspresije LINC00926 upoređivao je GEPIA (http://gepia.cancer-pku.cn/).
LINC00926 je specifično eksprimiran u B-ćelijama u adenokarcinomu pluća. Međutim, LINC00926 nije eksprimiran u B-ćelijama u normalnim plućima. LINC00926 se uglavnom nalazio u citoplazmi, što sugerira da bi mogao funkcionisati kao RNK-spužva. LINC00926 može vezati mikroRNK hsa-miR-3194-5p. Ciljni geni hsa-miR-3194-5p obogaćeni su terminma genske ontologije (GO) kao što su ćelijski spoj, vezivanje protein-kinaze i putevi Kjotske enciklopedije gena i genoma (KEGG), kao što je Ras signalni put. Visoka ekspresija LINC00926 povezana je s boljim ukupnim preživljavanjem pacijenata sa adenokarcinomom pluća.
Prema tome, LINC00926 može biti marker specifičan za B-ćelije i možda će imati zaštitnu ulogu kod pacijenata sa adenokarcinomom pluća. Potrebna su dalja istraživanja kako bi se istražilo kako LINC00926 funkcionira kod pacijenata sa adenokarcinomom pluća.[4]
Reference
[uredi | uredi izvor]- 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000247982 - Ensembl, maj 2017
- ↑ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ↑ "Entrez Gene: Long intergenic non-protein coding RNA 926". Pristupljeno 31. 8. 2016.
- ↑ https://www.jto.org/article/S1556-0864(21)01853-0/11P%5B%5D LINC00926 is a B cell-specific long non-coding RNA in lung adenocarcinoma and is associated with the prognosis of patients with this disease - Journal of Thoracic Oncology (jto.org)