LINC00926

LINC00926
Identifikatori
Aliasi	LINC00926
Vanjski ID-jevi	GeneCards: LINC00926
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 15 (čovjek)
Kraj	57,307,769 bp
Ortolozi
	283663
	n/a
	ENSG00000247982
	n/a
	n; a
	n/a
	n/a
	n/a
	n/a
	n/a
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Duga međugenska protein-nekodirajuća iRNK 926 je protein koji je kod ljudi kodiran genom LINC00926 .^[3]

Prethodni izvještaj pokazao je da bi LINC00926 mogao biti uključen u suzbijanje metastaza raka dojke. Međutim, studije u vezi s funkcijom LINC00926 kod adenokarcinoma pluća su rijetke.

Postoje podaci o 10 sekvenciranja jednolančane RNK(scRNA-seq) za osam zdravih plućnih tkiva i pet tkiva plućnog adenokarcinoma. Sekvenca LINC00926 dobijena je iz baze Noncode (http://www.noncode.org/), a ćelijsku lokaciju lncRNA-a je predvidio lncLocator (http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/lncLocator/ ). Ciljanu miRNK lncRNK je predvidio Starbase (http://starbase.sysu.edu.cn/ Arhivirano 22. 2. 2011. na Wayback Machine). Ciljne gene miRNK predvidio je miRDB (http://mirdb.org/). Funkcionalnu anotaciju ciljnih gena napravio je DAVID (https://david.ncifcrf.gov/). Ukupni opstanak pacijenata u TCGA-LUAD sa različitim nivoom ekspresije LINC00926 upoređivao je GEPIA (http://gepia.cancer-pku.cn/).

LINC00926 je specifično eksprimiran u B-ćelijama u adenokarcinomu pluća. Međutim, LINC00926 nije eksprimiran u B-ćelijama u normalnim plućima. LINC00926 se uglavnom nalazio u citoplazmi, što sugerira da bi mogao funkcionisati kao RNK-spužva. LINC00926 može vezati mikroRNK hsa-miR-3194-5p. Ciljni geni hsa-miR-3194-5p obogaćeni su terminma genske ontologije (GO) kao što su ćelijski spoj, vezivanje protein-kinaze i putevi Kjotske enciklopedije gena i genoma (KEGG), kao što je Ras signalni put. Visoka ekspresija LINC00926 povezana je s boljim ukupnim preživljavanjem pacijenata sa adenokarcinomom pluća.

Prema tome, LINC00926 može biti marker specifičan za B-ćelije i možda će imati zaštitnu ulogu kod pacijenata sa adenokarcinomom pluća. Potrebna su dalja istraživanja kako bi se istražilo kako LINC00926 funkcionira kod pacijenata sa adenokarcinomom pluća.^[4]

Reference[uredi | uredi izvor]

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000247982 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Entrez Gene: Long intergenic non-protein coding RNA 926". Pristupljeno 31. 8. 2016.
^ https://www.jto.org/article/S1556-0864(21)01853-0/11P^{[mrtav link]} LINC00926 is a B cell-specific long non-coding RNA in lung adenocarcinoma and is associated with the prognosis of patients with this disease - Journal of Thoracic Oncology (jto.org)

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000247982 - Ensembl, maj 2017

[2] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-3] "Entrez Gene: Long intergenic non-protein coding RNA 926". Pristupljeno 31. 8. 2016.

[4] ttps://www.jto.org/article/S1556-0864(21)01853-0/11P^{[mrtav link]} LINC00926 is a B cell-specific long non-coding RNA in lung adenocarcinoma and is associated with the prognosis of patients with this disease - Journal of Thoracic Oncology (jto.org)

[1]

[2]

[3]

[4]