LOC107984557

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
LOC107984557
Identifikatori
Aliasi
Vanjski ID-jeviGeneCards: [1]
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

n/a

n/a

RefSeq (bjelančevina)

n/a

n/a

Lokacija (UCSC)n/an/a
PubMed pretraga[1]n/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

TET1-lika metilctozin-dioksgenaza je protein koji je kod ljudi kodiran genom LOC107984557.[2]

Funkcija[uredi | uredi izvor]

Dioksigenaza katalizira pretvorbu modificirane genomske baze 5-metilcitozin (5mC) u 5-hidroksimetilcitozin (5hmC) i ima ključnu ulogu u aktivnoj demetilaciji DNK. Također posreduje u naknadnoj konverziji 5 hmC u 5-formilcitozin (5fC) i konverziji 5fC u 5-karboksilcitozin (5caC). Pretvorba 5mC u 5hmC, 5fC i 5caC vjerovatno predstavlja prvi korak u demetilaciji citozina. Metilacija na položaju C5 baze citozina je epigenetjčka modifikacija genoma sisara koja ima važnu ulogu u regulaciji transkripcije. Osim što ima ulogu u demetilaciji DNK, ima i općenitiju ulogu u regulaciji hromatina. Preferirano se veže za CpG-bogate sekvence kod promotora i transkripciono aktivnih i polikombno represiranih gena. Uključen je u regrutiranje OGT O-GlcNAc transferaze OGT, na početna mjesta transkripcije CpG-bogatih aktivnih gena, čime se potiče histonska H2B GlcN acilacija pomoću OGT-a. Također uključen je i u represiju transkripcije podskupa gena kroz regrutiranje transkripcijskih represora u promotore. ]Uključen je u održavanje ravnoteže između pluripotencije i predanosti ćelija, Ima ulogu u održavanju embrionskih matičnih ćelija i specifikaciji unutrašnjih ćelija.

Konverzija 5-metilcitozina u 5-hidtoksimetilcitozin

Ima važnu ulogu u tumorigenosti ćelija glioblastoma. TET1-posredovana proizvodnja 5 hmC djeluje kao signal za regrutiranje kompleksa CHTOP-metilosoma na selektivna mjesta na hromosomu, gdje metilira H4R3 i aktivira transkripciju gena uključenih u glioblastomagenezu (PubMed: 25284789).[3]

Vezuje se prvenstveno za DNK koja sadrži dinukleotide citidin-fosfat-gvanozin (CpG), preko CpH (H = A, T i C), hemimetilirani-CpG i hemimetilirani-hidroksimetil-CpG (PubMed: 29276034). Naredni koraci u demetilaciji citozina podliježu raspravi. Prema prvom modelu, demetilacija citozina događa se deaminacijom 5 hmC u 5-hidroksimetiluracil (5 hmU) i naknadnom zamjenom nemetiliranim citozinom sistemom za obnavljanje bazne ekscizije (PubMed: 21496894). Prema drugom modelu, demetilacija citozina prilično je posredovana konverzijom 5hmC u 5fC i 5caC, nakon čega slijedi izrezivanje TDG -om i zamjena nemetiliranim citozinom.[3]

Katalitske aktivnosti
  • 2-oksoglutarat + 5-metil-2'-deoksicitidin u DNK + O2 = 5-hidroksimetil-2'-deoksicitidin u DNK + CO2 + sukcinat-2 + O2 = 5-hidroksimetil-2'-dezoksicitidin u DNK 5-hidroksimetildezoksicitidin 5'-fosfatni ostatak + CO2 + sukcinat.[3]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  2. ^ "Entrez Gene: Methylcytosine dioxygenase TET1-like". Pristupljeno 10. 9. 2016.
  3. ^ a b c "ET1 - Methylcytosine dioxygenase TET1 - Homo sapiens (Human) - TET1 gene & protein". Pristupljeno 2. 8. 2021.