Idi na sadržaj

LZTS3

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
LZTS3
Identifikatori
AliasiLZTS3
Vanjski ID-jeviOMIM: 610484 MGI: 2656976 HomoloGene: 8824 GeneCards: LZTS3
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 20 (čovjek)
Hrom.Hromosom 20 (čovjek)[1]
Hromosom 20 (čovjek)
Genomska lokacija za LZTS3
Genomska lokacija za LZTS3
Bend20p13Početak3,162,617 bp[1]
Kraj3,173,549 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 2 (miš)
Hrom.Hromosom 2 (miš)[2]
Hromosom 2 (miš)
Genomska lokacija za LZTS3
Genomska lokacija za LZTS3
Bend2|2 F1Početak130,474,759 bp[2]
Kraj130,484,723 bp[2]
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)
NM_001282533
NM_014731
NM_001365618
NM_001367609
NM_001388189

NM_001388190
NM_001388191
NM_001388192
NM_001388193

NM_001291027
NM_001291028
NM_197945

RefSeq (bjelančevina)

NP_001269462
NP_001352547
NP_001354538

NP_001277956
NP_001277957
NP_922936

Lokacija (UCSC)Chr 20: 3.16 – 3.17 MbChr 2: 130.47 – 130.48 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Leucinski zatvarač, navodni član porodice supresora tumora 3 je protein koji je kod ljudi kodiran genom LZTS3.[5]

Sekvenciranjem klonova dobijenih iz frakcionirane biblioteke cDNK ljudskog mozga, kloniran je KIAA0552, koja sadrži ponavljajući element u svom 3-baznom UTR-u, a izvedeni protein sadrži 673 aminokiselina. Prevedeni protein imao je pretpostavljenu molekulsku masu od 75 kD, pomoću SDS-PAGE. RT-PCR-om je otkrivena visoka ekspresija u mozgu i bubrezima, srednju ekspresiju u srcu, posteljici, jajnicima i tankom crijevu i slabu ekspresiju u plućima, jetri, skeletnim mišićima, gušterači, prostati i sjemenicima. U slezeni i timusu nije otkrivena bilo kakva ekspresija.

Western blot analiza pokazala je da su se nivoi proteina povećali u mozgu pacova nakon rođenja i bili najviši u dobi od tri mjeseca. Najviši nivoi bili su u kori velikog mozga, malom mozgu i hipokampusu. Subćelijska frakcionacija otkrila je obogaćivanje Prosapip1 u postsinapsnim denzitetima (PSD) u primarnim kulturama pacovskog hipokampusnog proteina koji se kolonizirao u PSD s Prosap2 (SHANK3; 606230).

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

2-hibridnom analizom kvasaca, otkriveno je da je pacovski Prosapip1 stupio u interakciju s Prosap2. Analiza delecija pokazala je da je motiv vezanja PDZ domena Prosapip1 vezao PDZ domen Prosap2. Testovi koimunoprecipitacije homogenata pacovskog mozga potvrdili su interakciju Prosapip1-Prosap2. Prosapip1 je formirao homodimere i heteromultimere sa PSD-Zip70 (LZTS1; 606551), a oba proteina su u sinapse uključila SPAR (SIPA1L1) [6][7]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]
1020304050
MAKLETLPVRADPGRDPLLAFAPRPSELGPPDPRLAMGSVGSGVAHAQEF
AMKSVGTRTGGGGSQGSFPGPRGSGSGASRERPGRYPSEDKGLANSLYLN
GELRGSDHTDVCGNVVGSSGGSSSSGGSDKAPPQYREPSHPPKLLATSGK
LDQCSEPLVRPSAFKPVVPKNFHSMQNLCPPQTNGTPEGRQGPGGLKGGL
DKSRTMTPAGGSGSGLSDSGRNSLTSLPTYSSSYSQHLAPLSASTSHINR
IGTASYGSGSGGSSGGGSGYQDLGTSDSGRASSKSGSSSSMGRPGHLGSG
EGGGGGLPFAACSPPSPSALIQELEERLWEKEQEVAALRRSLEQSEAAVA
QVLEERQKAWERELAELRQGCSGKLQQVARRAQRAQQGLQLQVLRLQQDK
KQLQEEAARLMRQREELEDKVAACQKEQADFLPRIEETKWEVCQKAGEIS
LLKQQLKDSQADVSQKLSEIVGLRSQLREGRASLREKEEQLLSLRDSFSS
KQASLELGEGELPAACLKPALTPVDPAEPQDALATCESDEAKMRRQAGVA
AAASLVSVDGEAEAGGESGTRALRREVGRLQAELAAERRARERQGASFAE
ERRVWLEEKEKVIEYQKQLQLSYVEMYQRNQQLERRLRERGAAGGASTPT
PQHGEEKKAWTPSRLERIESTEI

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000088899 - Ensembl, maj 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000037703 - Ensembl, maj 2017
  3. "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. "Entrez Gene: Leucine zipper, putative tumor suppressor family member 3". Pristupljeno 3. 6. 2013.
  6. Nagase, T., Ishikawa, K., Miyajima, N., Tanaka, A., Kotani, H., Nomura, N., Ohara, O. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which can code for large proteins in vitro. DNA Res. 5: 31-39, 1998. PubMed: 9628581.
  7. Wendholt, D., Spilker, C., Schmitt, A., Dolnik, A., Smalla, K.-H., Proepper, C., Bockmann, J., Sobue, K., Gundelfinger, E. D., Kreutz, M. R., Boeckers, T. M. ProSAP-interacting protein 1 (ProSAPiP1), a novel protein of the postsynaptic density that links the spine-associated Rap-Gap (SPAR) to the scaffolding protein ProSAP2/Shank3. J. Biol. Chem. 281: 13805-13816, 2006. PubMed: 16522626.