MPHOSPH6

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
MPHOSPH6
Identifikatori
AliasiMPHOSPH6
Vanjski ID-jeviOMIM: 605500 MGI: 1915783 HomoloGene: 38100 GeneCards: MPHOSPH6
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 16 (čovjek)
Hrom.Hromosom 16 (čovjek)[1]
Hromosom 16 (čovjek)
Genomska lokacija za MPHOSPH6
Genomska lokacija za MPHOSPH6
Bend16q23.3Početak82,147,798 bp[1]
Kraj82,170,224 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 8 (miš)
Hrom.Hromosom 8 (miš)[2]
Hromosom 8 (miš)
Genomska lokacija za MPHOSPH6
Genomska lokacija za MPHOSPH6
Bend8|8 E1Početak118,518,384 bp[2]
Kraj118,528,682 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija• GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
• vezivanje sa RNK
Ćelijska komponenta• nuclear exosome (RNase complex)
• Jedarce
• Egzosomski kompleks
• jedro
• nukleoplazma
• citoplazma
Biološki proces• maturation of 5.8S rRNA
• rRNA processing
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez

10200

68533

Ensembl

ENSG00000135698

ENSMUSG00000031843

UniProt

Q99547

Q9D1Q1

RefSeq (mRNK)

NM_005792

NM_026758
NM_001357232
NM_001357233

RefSeq (bjelančevina)

NP_005783

NP_081034
NP_001344161
NP_001344162

Lokacija (UCSC)Chr 16: 82.15 – 82.17 MbChr 8: 118.52 – 118.53 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

M-fazni fosfoprotein 6 je enzim koji je kod ljudi kodiran genom MPHOSPH6.[5][6]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 160 aminokiselina, a molekulska težina 19.024 Da.[7]

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

1020304050
MAAERKTRLSKNLLRMKFMQRGLDSETKKQLEEEEKKIISEEHWYLDLPE
LKEKESFIIEEQSFLLCEDLLYGRMSFRGFNPEVEKLMLQMNAKHKAEEV
EDETVELDVSDEEMARRYETLVGTIGKKFARKRDHANYEEDENGDITPIK
AKKMFLKPQD

Kloniranje i ekspresija[uredi | uredi izvor]

Tretiranjem biblioteka za ekspresiju bakterija u citosolu M-faze koji sadrži relevantne kinaze u prisustvu inhibitora fosfataze, nakon čega slijedi imunoskrining s antitijelima MPM2, Matsumoto-Taniura et al. (1996) izolirali su cDNK za brojne MPHOSPH, uključujući MPHOSPH6, koji su nazvali MPP6. Matsumoto-Taniura, N., Pirollet, F., Monroe, R., Gerace, L., Westendorf, J. M. Identification of novel M phase phosphoproteins by expression cloning. Molec. Biol. Cell 7: 1455-1469, 1996. PubMed: 8885239</ref> Imunoblotska analiza pokazala je da se kada se osforilizira, u ćelijama M-faze, MPHOSPH6 eksprimira kao protein od 17 kD. Imunofluorescentna mikroskopija lokalizirala je MPHOSPH6 u čitavom jedru, sa umjerenom koncentracijom u jedarcima, u interfazi i u čitavoj ćeliji tokom mitoze.

Inherentno nestabilne iRNK sisara sadrže elemente bogate AU (ARE) u svojim 3-glavnim neprevedenim regijama. U kvascima, degradaciju iRNK od tri do pet primarnih dijelova posreduje egzon, višejedinična čestica. Chen et al. (2001) pročistili su i okarakterizirali ljudski egzosom masenom spektrometrijom i utvrdili da je njegov sastav sličan kvaščevom. Unutar ljudskog egzozoma, utvrdili su sljedeće proteinske podjedinice:[8]

  • p7, koja je homologna proteinu kvasca Rrp4, p8, koji je homologan proteinu kvasca Rrp42;
  • p9, koja je homologna proteinu kvasca Rrp43 (OIP2);
  • p10, homologna proteinu kvasca Rrp40;
  • p11, koja je homologna kvaščevom proteinu Mtr3 ;
  • p12A, homolog kvaščevog proteina Rrp41;
  • p12B, homologni kvaščevog proteina Rrp46 i
  • p13, homolog kvaščevog protein Csl4. Također su identificirali dva faktora povezana s egzosomom, p1 i p14, koji nisu homologni niti jednoj komponenti egzozoma kvasca.

Funkcija gena[uredi | uredi izvor]

Koristeći sistem raspadanja RNK bez ćelija, Chen et al. (2001) pokazali su da je egzosom sisara potreban za brzu razgradnju RNK koja sadrži ARE, ali ne i za skraćivanje poli (A). Otkrili su da egzosom sisara ne prepoznaje RNK koje sadrže ARE. Za prepoznavanje ARE potrebni su određeni proteini koji se vežu za ARE i koji mogu stupiti u interakciju s egzosomom i regrutovati ga u nestabilne RNK, čime se pospješuje njihova brza razgradnja.

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000135698 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031843 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Matsumoto-Taniura N, Pirollet F, Monroe R, Gerace L, Westendorf JM (Jan 1997). "Identification of novel M phase phosphoproteins by expression cloning". Mol Biol Cell. 7 (9): 1455–69. doi:10.1091/mbc.7.9.1455. PMC 275994. PMID 8885239.
  6. ^ "Entrez Gene: MPHOSPH6 M-phase phosphoprotein 6".
  7. ^ "UniProt, Q99547". Pristupljeno 8. 7. 2021.
  8. ^ Chen, C.-Y., Gherzi, R., Ong, S.-E., Chan, E. L., Raijmakers, R., Pruijn, G. J. M., Stoecklin, G., Moroni, C., Mann, M., Karin, M. AU binding proteins recruit the exosome to degrade ARE-containing mRNAs. Cell 107: 451-464, 2001. PubMed: 11719186

Vanjski linkovi[uredi | uredi izvor]

MPHOSPH6 detalji ljudskog genoma u UCSC Genome Browser.

Preuzeto iz "https://bs.wikipedia.org/w/index.php?title=MPHOSPH6&oldid=3331401"