NOL6

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
NOL6
Identifikatori
AliasiNOL6
Vanjski ID-jeviOMIM: 611532 MGI: 2140151 HomoloGene: 41505 GeneCards: NOL6
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 9 (čovjek)
Hrom.Hromosom 9 (čovjek)[1]
Hromosom 9 (čovjek)
Genomska lokacija za NOL6
Genomska lokacija za NOL6
Bend9p13.3Početak33,461,353 bp[1]
Kraj33,473,930 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 4 (miš)
Hrom.Hromosom 4 (miš)[2]
Hromosom 4 (miš)
Genomska lokacija za NOL6
Genomska lokacija za NOL6
Bend4|4 A5Početak41,114,427 bp[2]
Kraj41,124,455 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje sa RNK
Ćelijska komponenta kondenzovani nuklearni hromosom
small-subunit processome
Jedarce
mitohondrija
jedro
CURI complex
hromosom
UTP-C complex
nukleoplazma
Biološki proces tRNA export from nucleus
rRNA processing
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_139235
NM_022917
NM_130793

NM_139236
NM_139237

RefSeq (bjelančevina)

NP_075068
NP_631981

NP_631982

Lokacija (UCSC)Chr 9: 33.46 – 33.47 MbChr 4: 41.11 – 41.12 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Nukleolusni protein 6 je protein koji je kod ljudi kodiran genom NOL6.[5][6][7]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 1.146 aminokiselina, а molekulska težina 127.593 Da.[8]

1020304050
MGPAPAGEQLRGATGEPEVMEPALEGTGKEGKKASSRKRTLAEPPAKGLL
QPVKLSRAELYKEPTNEELNRLRETEILFHSSLLRLQVEELLKEVRLSEK
KKDRIDAFLREVNQRVVRVPSVPETELTDQAWLPAGVRVPLHQVPYAVKG
CFRFLPPAQVTVVGSYLLGTCIRPDINVDVALTMPREILQDKDGLNQRYF
RKRALYLAHLAHHLAQDPLFGSVCFSYTNGCHLKPSLLLRPRGKDERLVT
VRLHPCPPPDFFRPCRLLPTKNNVRSAWYRGQSPAGDGSPEPPTPRYNTW
VLQDTVLESHLQLLSTILSSAQGLKDGVALLKVWLRQRELDKGQGGFTGF
LVSMLVVFLVSTRKIHTTMSGYQVLRSVLQFLATTDLTVNGISLCLSSDP
SLPALADFHQAFSVVFLDSSGHLNLCADVTASTYHQVQHEARLSMMLLDS
RADDGFHLLLMTPKPMIRAFDHVLHLRPLSRLQAACHRLKLWPELQDNGG
DYVSAALGPLTTLLEQGLGARLNLLAHSRPPVPEWDISQDPPKHKDSGTL
TLGLLLRPEGLTSVLELGPEADQPEAAKFRQFWGSRSELRRFQDGAIREA
VVWEAASMSQKRLIPHQVVTHLLALHADIPETCVHYVGGPLDALIQGLKE
TSSTGEEALVAAVRCYDDLSRLLWGLEGLPLTVSAVQGAHPVLRYTEVFP
PTPVRPAFSFYETLRERSSLLPRLDKPCPAYVEPMTVVCHLEGSGQWPQD
AEAVQRVRAAFQLRLAELLTQQHGLQCRATATHTDVLKDGFVFRIRVAYQ
REPQILKEVQSPEGMISLRDTAASLRLERDTRQLPLLTSALHGLQQQHPA
FSGVARLAKRWVRAQLLGEGFADESLDLVAAALFLHPEPFTPPSSPQVGF
LRFLFLVSTFDWKNNPLFVNLNNELTVEEQVEIRSGFLAARAQLPVMVIV
TPQDRKNSVWTQDGPSAQILQQLVVLAAEALPMLEKQLMDPRGPGDIRTV
FRPPLDIYDVLIRLSPRHIPRHRQAVDSPAASFCRGLLSQPGPSSLMPVL
GYDPPQLYLTQLREAFGDLALFFYDQHGGEVIGVLWKPTSFQPQPFKASS
TKGRMVMSRGGELVMVPNVEAILEDFAVLGEGLVQTVEARSERWTV

Funkcija[uredi | uredi izvor]

Jedarce je gusta subjedarna membranska organela koja se okuplja oko klastera gena rRNK i funkcionira u biogenezi ribosoma. Ovaj gen kodira jedarčani protein povezan s RNK koji je visoko konzerviran među vrstama. Tretman permeabiliziranih ćrlija Rnazama pokazuje da je nukleolusna lokalizacija ovisna o RNK. Daljnje studije ukazuju da je protein povezan s biogenezom ribosoma kroz interakciju s primarnim transkriptima pre-rRNK. Na ovom mjestu postoji alternativna prerada i identificirane su dvije prerađene varijante koje kodiraju različite izoforme.[7]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000165271 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028430 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Utama B, Kennedy D, Ru K, Mattick JS (Mar 2002). "Isolation and characterization of a new nucleolar protein, Nrap, that is conserved from yeast to humans". Genes Cells. 7 (2): 115–32. doi:10.1046/j.1356-9597.2001.00507.x. PMID 11895476. S2CID 21385000.
  6. ^ Bernstein KA, Gallagher JE, Mitchell BM, Granneman S, Baserga SJ (Dec 2004). "The small-subunit processome is a ribosome assembly intermediate". Eukaryot Cell. 3 (6): 1619–26. doi:10.1128/EC.3.6.1619-1626.2004. PMC 539036. PMID 15590835.
  7. ^ a b "Entrez Gene: NOL6 nucleolar protein family 6 (RNA-associated)".
  8. ^ "UniProt, Q9H6R4". Pristupljeno 10. 9. 2021.

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]