NRSN2

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
NRSN2
Identifikatori
AliasiNRSN2
Vanjski ID-jeviOMIM: 610666 MGI: 2684969 HomoloGene: 11802 GeneCards: NRSN2
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 20 (čovjek)
Hrom.Hromosom 20 (čovjek)[1]
Hromosom 20 (čovjek)
Genomska lokacija za NRSN2
Genomska lokacija za NRSN2
Bend20p13Početak346,782 bp[1]
Kraj359,660 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 2 (miš)
Hrom.Hromosom 2 (miš)[2]
Hromosom 2 (miš)
Genomska lokacija za NRSN2
Genomska lokacija za NRSN2
Bend2|2 G3Početak152,210,675 bp[2]
Kraj152,218,558 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija molecular function
Ćelijska komponenta integral component of membrane
neuronal cell body
Ćelijska membrana
transport vesicle
membrana
GO:0016023 citoplazmatska vezikula
neuron projection
Biološki proces GO:0022610 biološki proces
nervous system development
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)
NM_024958
NM_001323679
NM_001323680
NM_001323681
NM_001323682

NM_001323683
NM_001323684
NM_001323685

NM_001009948
NM_001370749
NM_001370750

RefSeq (bjelančevina)
NP_001310608
NP_001310609
NP_001310610
NP_001310611
NP_001310612

NP_001310613
NP_001310614
NP_079234

NP_001009948
NP_001357678
NP_001357679

Lokacija (UCSC)Chr 20: 0.35 – 0.36 MbChr 2: 152.21 – 152.22 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Neurenzin-2 je protein koji je kod ljudi kodiran genom NRSN2.[5][6]

Kloniranje i ekspresija[uredi | uredi izvor]

Koristeći BLAST analizu sa sekvencom mišjeg neurezina-1 (NRSN1; 616630) kao upit, Nakanishi et al. (2006) su identifikovali sekvence mišjeg i ljudskog homolognog gena koje su nazvali neurenzin-2 (NRSN2). Ljudski protein NRSN2 sadrži dva domena koja se protežu kroz membranu i dijeli 41% identiteta s mišjimm Nrsn1. Northern blot analiza mišjih tkiva pokazala je specifičnu ekspresiju za mozak 1,7-kb Nrsn2 transkripta. Imunoblot analiza pokazala je ekspresiju proteina Nrsn2 15,5 embrionskog dana, sa snažnom ekspresijom viđenom od 7 -14 postnatusnih dana i u dobi od 10 sedmica. Imunoblot analiza moždanog područja pokazala je da je Nrsn2 široko eksprimiran kroz mozak, sa najvećom ekspresijom u talamusu/hipotalamusu. Indirektna imunofluorescencija u transficiranim Neuro2a ćelijama pokazala je da se Nrsn2 lokalizira u perijedarne organele , sa procesima u regijama različitim od onih obojenih Nrsn1, a u transformiranim COS-7 ćelijama pokazalo je da se Nrsn2 lokalizira u lizosomima. Imunohistohemijska analiza u mozgu miša pokazala je sličnu ukupnu raspodjelu Nrsn2 i Nrsn1, ali različite subćelijske lokalizacije, s Nrsn2 u somatskim regijama i Nrsn1 u neuritskim procesima. Nrsn2-pozitivne ćelije su viđene septumskom jezgru, dijagonalnom pojasu, hipokampusu, amigdaloidnom jezgru, jezgru habenula i pokrovi moždane kore, a istaknuto imunobojanje viđeno je u ćelijskim tijelima cerebelarnih Purkinjeovih ćelija.[7]

Molekulska funkcija
Biološki procesi
  • biološki promet
  • razvoj nervnog sistema
Izvori:Amigo/QuickGO

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

1020304050
MMPSCNRSCSCSRGPSVEDGKWYGVRSYLH</ td>LFYEDCAGTALSDDPEGPPV
LCPRRPWPSLCWKISLSSGTLLLLLGVAALTTGYAVPPKLEGIGEGEFLV
LDQRAADYNQALGTCRLAGTALCVAAGVLLAICLFWAMIGWLSQDTKAEP
LDPEADSHVEVFGDEPEQQLSPIFRNASGQSWFSPPASPFGQSSVQTIQP
KRDS
Oznake aminokiselina

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000125841 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000059361 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Nakanishi K, Ida M, Suzuki H, Kitano C, Yamamoto A, Mori N, Araki M, Taketani S (Apr 2006). "Molecular characterization of a transport vesicle protein Neurensin-2, a homologue of Neurensin-1, expressed in neural cells". Brain Res. 1081 (1): 1–8. doi:10.1016/j.brainres.2006.01.085. PMID 16527258.
  6. ^ "Entrez Gene: NRSN2 neurensin 2".
  7. ^ Nakanishi, K., Ida, M., Suzuki, H., Kitano, C., Yamamoto, A., Mori, N., Araki, M., Taketani, S. Molecular characterization of a transport vesicle protein neurensin-2, a homologue of neurensin-1, expressed in neural cells. Brain Res. 1081: 1-8, 2006. PubMed: 16527258.

Dopunska literarura[uredi | uredi izvor]