OLFM1

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
OLFM1
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

4XAT

Identifikatori
AliasiOLFM1
Vanjski ID-jeviOMIM: 605366 MGI: 1860437 HomoloGene: 8612 GeneCards: OLFM1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 9 (čovjek)
Hrom.Hromosom 9 (čovjek)[1]
Hromosom 9 (čovjek)
Genomska lokacija za OLFM1
Genomska lokacija za OLFM1
Bend9q34.3Početak135,075,422 bp[1]
Kraj135,121,180 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 2 (miš)
Hrom.Hromosom 2 (miš)[2]
Hromosom 2 (miš)
Genomska lokacija za OLFM1
Genomska lokacija za OLFM1
Bend2|2 A3Početak28,083,004 bp[2]
Kraj28,120,748 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije




Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Ćelijska komponenta extracellular region
međućelijske veze
Akson
neuronal cell body
perikaryon
axonal growth cone
sinapsa
projekcija ćelije
Endoplazmatski retikulum
Vanćelijsko
Biološki proces multicellular organism development
atrioventricular valve formation
neuronal signal transduction
GO:1901313 positive regulation of gene expression
regulation of axon extension
positive regulation of epithelial to mesenchymal transition
negative regulation of gene expression
nervous system development
cardiac epithelial to mesenchymal transition
positive regulation of apoptotic process
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_058199
NM_001282611
NM_001282612
NM_006334
NM_014279

NM_001038612
NM_001038613
NM_001038614
NM_019498

RefSeq (bjelančevina)

NP_001269540
NP_001269541
NP_006325
NP_055094

NP_001033701
NP_001033702
NP_001033703
NP_062371

Lokacija (UCSC)Chr 9: 135.08 – 135.12 MbChr 2: 28.08 – 28.12 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Olfaktomedin 1, znan i kao noelin 1 ili pankortin, je protein koji je kod ljudi kodiran genom OLFM1.[5][6] The name noelin stands for "neuronal olfactomedin-related endoplasmic reticulum-localized 1".[7]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 485 aminokiselina, а molekulska težina 55.343 Da.[8]

1020304050
MSVPLLKIGVVLSTMAMITNWMSQTLPSLVGLNTTKLSAAGGGTLDRSTG
VLPTNPEESWQVYSSAQDSEGRCICTVVAPQQTMCSRDARTKQLRQLLEK
VQNMSQSIEVLDRRTQRDLQYVEKMENQMKGLESKFKQVEESHKQHLARQ
FKAIKAKMDELRPLIPVLEEYKADAKLVLQFKEEVQNLTSVLNELQEEIG
AYDYDELQSRVSNLEERLRACMQKLACGKLTGISDPVTVKTSGSRFGSWM
TDPLAPEGDNRVWYMDGYHNNRFVREYKSMVDFMNTDNFTSHRLPHPWSG
TGQVVYNGSIYFNKFQSHIIIRFDLKTETILKTRSLDYAGYNNMYHYAWG
GHSDIDLMVDESGLWAVYATNQNAGNIVVSRLDPVSLQTLQTWNTSYPKR
SAGEAFIICGTLYVTNGYSGGTKVHYAYQTNASTYEYIDIPFQNKYSHIS
MLDYNPKDRALYAWNNGHQILYNVTLFHVIRSDEL

Funkcija[uredi | uredi izvor]

Ovaj genski proizvod ima veliku sličnost sekvence sa proteinom pacovskih neuronskih olfaktomedina povezanih sa proteinom u endoplazamatskom retikulumu (ER). Iako tačna funkcija kodiranog proteina nije poznata, njegova obilna ekspresija u mozgu sugerira da može imati bitnu ulogu u živčanom tkivu. Za ovaj gen pronađeno je nekoliko alternativno prerađenih transkripata koji kodiraju različite izoforme.[6]

Kancer[uredi | uredi izvor]

Otkriveno je da gen OLFM1 progresivno aktivan u papiloma virus-pozitivanim neoplazmatskim keratinocitima izvedenim iz cerviksa materice preneoplazijske lezije na različitim nivoima malignosti.[9] Zato je ovaj gen vjerovatno povezan s tumorigenezom i može biti potencijalni prognostički marker za napredovanje raka cerviksa maternice preneoplazijske lezije.[9]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000130558 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026833 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Yokoyama M, Nishi Y, Yoshii J, Okubo K, Matsubara K (maj 1997). "Identification and cloning of neuroblastoma-specific and nerve tissue-specific genes through compiled expression profiles". DNA Res. 3 (5): 311–20. doi:10.1093/dnares/3.5.311. PMID 9039501.
  6. ^ a b "Entrez Gene: OLFM1 olfactomedin 1".
  7. ^ Anholt, Robert R. H. (2014). "Olfactomedin proteins: central players in development and disease". Frontiers in Cell and Developmental Biology. 2: 6. doi:10.3389/fcell.2014.00006. PMC 4206993. PMID 25364714.
  8. ^ "UniProt, Q99784". Pristupljeno 10. 9. 2021.
  9. ^ a b Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F (april 2015). "Gene expression changes in progression of cervical neoplasia revealed by microarray analysis of cervical neoplastic keratinocytes". J Cell Physiol. 230 (4): 802–812. doi:10.1002/jcp.24808. PMID 25205602. S2CID 24986454.

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]