PYGO1

PYGO1
Dostupne strukture
PDB	Pretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova
	2VP7, 2VPB, 2VPD, 2VPE, 2VPG
Identifikatori
Aliasi	PYGO1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 606902 MGI: 1919385 HomoloGene: 41050 GeneCards: PYGO1
Lokacija gena (miš)
Hrom.	Hromosom 9 (miš)
Kraj	72,859,463 bp
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine; • vezivanje iona metala; • methylated histone binding;
Ćelijska komponenta	• jedro; • nukleoplazma;
Biološki proces	• protein localization to nucleus; • spermatid nucleus differentiation; • post-embryonic development; • Wnt-signalni put; • hematopoietic progenitor cell differentiation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • Nefrogeneza; • spermatid development; • beta-catenin-TCF complex assembly; • canonical Wnt signaling pathway;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	26108
	72135
	n/a
	ENSMUSG00000034910
	Q9Y3Y4
	Q9D0P5
	NM_015617; NM_001330326; NM_001367806
	NM_028116
	NP_001317255; NP_056432; NP_001354735
	NP_082392
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek	Pogledaj/uredi – miš

Drozofilski pigusni homolog 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom PYGO1.^[4]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 419 aminokiselina, a molekulska težina 45.116 Da^[5]

10	20	30	40	50
MPAENSPAPA	YKVSSHGGDS	GLDGLGGPGV	QLGSPDKKKR	KANTQGPSFP
PLSEYAPPPN	PNSDHLVAAN	PFDDNYNTIS	YKPLPSSNPY	LGPGYPGFGG
YSTFRMPPHV	PPRMSSPYCG	PYSLRNQPHP	FPQNPLGMGF	NRPHAFNFGP
HDNSSFGNPS	YNNALSQNVN	MPNQHFRQNP	AENFSQIPPQ	NASQVSNPDL
ASNFVPGNNS	NFTSPLESNH	SFIPPPNTFG	QAKAPPPKQD	FTQGATKNTN
QNSSAHPPHL	NMDDTVNQSN	IELKNVNRNN	AVNQENSRSS	STEATNNNPA
NGTQNKPRQP	RGAADACTTE	KSNKSSLHPN	RHGHSSSDPV	YPCGICTNEV
NDDQDAILCE	ASCQKWFHRI	CTGMTETAYG	LLTAEASAVW	GCDTCMADKD
VQLMRTRETF	GPSAVGSDA

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

Kloniranje i ekspresija[uredi | uredi izvor]

WNT signalizacija kontrolira mnoge temeljne procese tokom razvoja životinja. Transdukcija WNT-a posreduje povezivanjem beta-katenina sa jedarnim TCF (npr. LEF1) DNK-vezujućim faktorima. Kramps et al. (2002) su identificirali gene za polarnost dva segmenta kod Drosophila, beznoge (Lgs) i pigopusa (Pygo), i pokazali da su njihovi proizvodi potrebni za transdukciju WNT signala na nivou jedarnog beta-katenina. Lgs kodira homolog ljudskog BCL9 , a autori su pružili genetičkeke i molekulske dokaze da ti proteini vrše svoju funkciju fizičkim povezivanjem Pygo-a s beta-kateninom. Identificirali su i izolirali dva ljudska homologa gena Drosophila Pygo, PYGO1 i PYGO2. Proteini PYGO1 i PYGO2, koji sadrže 419, odnosno 406 aminokiselina, imaju visoko konzervirani PHD prst koji komunicira s homolognim domenom-1 (HD1) BCL9. Nalazi sugeriraju da regrutacija PYGO omogućava beta-kateninu da transkripcijski aktivira WNT ciljne gene i povećala mogućnost da deregulacija ovih događaja može imati uzročnu ulogu u razvoju malignih tumora B-ćelija.^[6]

Reference[uredi | uredi izvor]

^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000034910 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Entrez Gene: Pygopus homolog 1 (Drosophila)". Pristupljeno 23. 12. 2012.
^ "UniProt, Q9Y3Y4". Pristupljeno 17. 7. 2021.
^ Kramps, T., Peter, O., Brunner, E., Nellen, D., Froesch, B., Chatterjee, S., Murone, M., Zullig, S., Basler, K. Wnt/Wingless signaling requires BCL9/legless-mediated recruitment of pygopus to the nuclear beta-catenin-TCF complex. Cell 109: 47-60, 2002. PubMed: 11955446

Vanjski linkovi[uredi | uredi izvor]

PDBe-KB provides an overview of all the structure information available in the PDB for Human Pygopus homolog 1

[refGRCm38Ensembl-1] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000034910 - Ensembl, maj 2017

[2] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[3] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-4] "Entrez Gene: Pygopus homolog 1 (Drosophila)". Pristupljeno 23. 12. 2012.

[UniProt-5] "UniProt, Q9Y3Y4". Pristupljeno 17. 7. 2021.

[6] Kramps, T., Peter, O., Brunner, E., Nellen, D., Froesch, B., Chatterjee, S., Murone, M., Zullig, S., Basler, K. Wnt/Wingless signaling requires BCL9/legless-mediated recruitment of pygopus to the nuclear beta-catenin-TCF complex. Cell 109: 47-60, 2002. PubMed: 11955446

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]