Razlika između verzija stranice "EC broj enzima"

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
Pregled historije
[pregledana izmjena][pregledana izmjena]
← Starija izmjenaNovija izmjena →
Uklonjeni sadržaj Dodani sadržaj
VizualnoWikitekst
Red 28: Red 28:
! Primjer enzima <br>(sa trivijalnim imenom)
! Primjer enzima <br>(sa trivijalnim imenom)
|-
|-
|colspan=1 style="background:#ddffdd;"|'''[[Spisak EC brojeva (EC 1)|EC 1]]<br>[[Oksidoreduktaza|Oksidoreduktaze]]'''
|colspan=1 style="background:#ddffdd;"|'''[[Spisak EC brojeva (EC 1)|EC 1]]'''<br>'''[[Oksidoreduktaza|Oksidoreduktaze]]'''
|[[Redoks]] reakcije; transfer H i O atoma ili [[elektron]]a iz jedne supstance na drugu
|[[Redoks]] reakcije; transfer H i O atoma ili [[elektron]]a iz jedne supstance na drugu
| '''AH + B → A + BH''' (<small>redukcija</small>)<br/> '''A + O → AO''' (<small>oksidacija</small>)
| '''AH + B → A + BH''' (<small>redukcija</small>)<br/> '''A + O → AO''' (<small>oksidacija</small>)
Red 38: Red 38:
|[[Transaminaza]], [[Kinaza]]
|[[Transaminaza]], [[Kinaza]]
|-
|-
!colspan=1 style="background:#ddffdd;"| [[Spisak EC brojeva(EC 3)|EC 3]]<br>[[Hidrolaze]]
!colspan=1 style="background:#ddffdd;"| [[Spisak EC brojeva (EC 3)|EC 3]]<br>[[Hidrolaze]]
| Formiranje dva proizvoda od jednog supstrata putem [[hidroliza|Hidrolize]]
| Formiranje dva proizvoda od jednog supstrata putem [[hidroliza|Hidrolize]]
| '''AB + H<sub>2</sub>O → AOH + BH'''
| '''AB + H<sub>2</sub>O → AOH + BH'''
| [[Lipaza]], [[Amilaza]], [[Peptidaza]]
| [[Lipaza]], [[Amilaza]], [[Peptidaza]]
|-
|-
! [[Spisak ECbrojeva (EC 4)|EC 4]]<br>[[Lijaza|Lijaze]]
! [[Spisak EC brojeva (EC 4)|EC 4]]<br>[[Lijaza|Lijaze]]
| Nehidrolitsko dodavanje ili oduzimanje grupa ir supstrata. Mogu biti razgrađene C-C, C-N, C-O or C-S veze.
| Nehidrolitsko dodavanje ili oduzimanje grupa ir supstrata. Mogu biti razgrađene C-C, C-N, C-O or C-S veze.
| '''RCOCOOH → RCOH + CO<sub>2</sub> ili [X-A-B-Y] → [A=B + X-Y]'''
| '''RCOCOOH → RCOH + CO<sub>2</sub> ili [X-A-B-Y] → [A=B + X-Y]'''

Verzija na dan 19 decembar 2015 u 11:12

Kristali dezoksiribonukleaznog proteina

Definicija

Komisijski broj enzima ('EC: Enzyme Commision Number) broj) je pregled numeričke klasifikacije enzima, na osnovu hemijske reakcije koju kataliziraju. Ova sistemska nomenklatura enzima, svaki EC broj je povezuje s preporučenim imenom za odgovarajući enzim. [1][2]

Strogo govoreći, EC brojevi ne preciziraju enzim, već enzim katalizirane reakcije. Ako različiti enzimi (naprimjer, iz različitih organizama) kataliziraju istu reakciju, onda oni dobiju isti EC broj. Osim toga, usljed konvergentne evolucije, potpuno drugačiji proteinski oblici mogu katalizirati identičnu reakcija i stoga će im biti dodijeljen identičan broj EC. Ovi se označavaju kao nehomologni izofunkcijski enzimi, ili NISE). Za razliku od toga, UniProt identifikatori jedinstveno određuju proteinsku sekvencu po aminokiselinama. [3]

Format broja

Oznaka svakog od enzima sastoji se od slova "EC", a zatim četiri broja odvojena razmacima. Ti brojevi predstavljaju progresivno finiju klasifikaciju enzima. Postoje i preliminarni EC brojevi koji imaju oznaku n u sklopu četvrtog (serijskog) broja (npr. EC 3.5.1.n3). [4] Primjerice, tripeptid aminopeptidaza ima kod "EC 3.4.11.4", čije komponente ukazuju na sljedeće skupine enzima:

  • EC 3 – enzimi su hidrolaze (enzimi koji koriste vodu za razgradnju nekih drugih molekula);
  • EC 3.4 – hidrolaze koje djeluju na peptidne veze ;
  • EC 3.4.11 – hidrolaze koje odnose amino-terminal aminokiseline iz polipeptida;
  • EC 3.4.11.4 – hidrolaze kije skidaju amino-terminal tripeptida.

Sličnost reakcije

Sličnost između enzimskih reakcija (EC) može se izračunati pomoću promjene veza, reakcijskih centara ili podkonstrukcije metrike (tj. EC-BLAST).

Historija

Šema nomenklature enzima je razvijen početkom 1955. godine, kada je Međunarodni kongres za biohemiju u Briselu postavio Komisiju za enzime. Prva verzija je objavljena u 1961. Sadašnje šesto izdanju, koje je objavila Međunarodna unija za biohemiju i molekulsku biologiju 1992. godine, sadrži 3196 različitih enzima. Suplementi 1-4 objavljeni su od 1993. do 1999. Naknadni suplementi su objavljeni elektronskim putem, na internet stranici Odbora za nomenklaturu Međunarodne unije za biohemiju i molekularnu biologiju.

Razina kodova

Najvažniji EC brojevi[5]
Grupa Katalizirana reakcija Tipska rakcija Primjer enzima
(sa trivijalnim imenom)
EC 1
Oksidoreduktaze 		Redoks reakcije; transfer H i O atoma ili elektrona iz jedne supstance na drugu AH + B → A + BH (redukcija)
A + O → AO (oksidacija) 		Dehidrogenaza, Oksidaza
EC 2
Transferaze 		Transfer funkcijske grupe od jedne supstance do druge. Grupa može biti metil-, acil-, amino- ili fosfatna grupa AB + C → A + BC Transaminaza, Kinaza
EC 3
Hidrolaze 		Formiranje dva proizvoda od jednog supstrata putem Hidrolize AB + H2O → AOH + BH Lipaza, Amilaza, Peptidaza
EC 4
Lijaze 		Nehidrolitsko dodavanje ili oduzimanje grupa ir supstrata. Mogu biti razgrađene C-C, C-N, C-O or C-S veze. RCOCOOH → RCOH + CO2 ili [X-A-B-Y] → [A=B + X-Y] Dekarboksilaza
EC 5
Izomeraze 		Unutarmolekulski rearanžmani, tj. izomerizacijske promjene unutaj jedne molekule. ABC → BCA Izomeraze, Mutaze
EC 6
Ligaze 		Povezuju dvije molekule sintezom novih C-O, C-S, C-N ili C-C kovalentnih veza putem simultane razgradnje Adenozin trifosfata (ATP) X + Y + ATP → XY + ADP + Pi Sintetaza

Također pogledajte

Reference

  1. ^ Webb E. C. (1992); Enzyme nomenclature 1992: recommendations of the Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology on the nomenclature and classification of enzymes. Published for the International Union of Biochemistry and Molecular Biology by Academic Press. San Diego, ISBN 0-12-227164-5: http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/.
  2. ^ ExPASy: Enzyme (Enzyme nomenclature database): http://www.expasy.org/enzyme/.
  3. ^ Omelchenko M. V., Galperin M. Y., Wolf Y. I., Koonin E. V. (20210): Non-homologous isofunctional enzymes: a systematic analysis of alternative solutions in enzyme evolution. Biol. Direct., 5: 1-31 | pmc = 2876114 | doi = 10.1186/1745-6150-5-31.
  4. ^ Apweiler R., Bairoch A., Wu C. H., Barker W. C., Boeckmann B., Ferro S., Gasteiger E., Huang H., Lopez R., Magrane M., Martin M. J., Natale D. A., O'Donovan C., Redaschi N., Yeh L. S. (2004): UniProt: the Universal Protein knowledgebase. Nucleic Acids Res., 32: Database issue: D115–9 |date=January 2004 | pmid = 14681372 | pmc = 308865 | doi = 10.1093/nar/gkh131.
  5. ^ Moss G. P. (2006): Recommendations of the Nomenclature Committee. International Union of Biochemistry and Molecular Biology on the Nomenclature and Classification of Enzymes by the Reactions they Catalyse: http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/.

Vanjski linkovi

Preuzeto iz "https://bs.wikipedia.org/w/index.php?title=EC_broj_enzima&oldid=2673361"