Protomera

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
(Preusmjereno sa Protomere)
Jump to navigation Jump to search

Protomera – u strukturnoj biologiji – je strukturna jedinica oligomernog proteina. To je najmanja jedinica koja je sastavljena od najmanje dva različita proteinska lanca koji formiraju heterooligomer putem spajanja dvije ili više kopija ove jedinice.

Termin protomer je uveo Četverin[1] za nomenklaturu u nedvosmislenosti Na/K-ATPaza. Na/K sadrži α- i β-podjedinicu (plus proteolipid, zvani γ-podjedinica). U to vrijeme nije bilo jasno koliko svaka id njih djeluje zajedno. Osim toga, kada se govorilo o dimerima, da li se odnose na αβ ili (αβ)2, Četverin je predložio da je αβ protomer, a (αβ)2 diprotomer.

Protomeri obično imaju obično cikličnu simetriju za formiranje zatvorenih simetrija grupe tačaka.

Primjeri[uredi | uredi izvor]

Hemoglobin je heterotetramer koji je sastavljen od četiri podjedinice (po dvije α i β). Međutim, strukturno i funkcijski, hemoglobin je opisan boljim u (αβ)2, kada se kaže da je dimer dva αβ-protomera, tj. diprotomer.[2]

Aspartat karbamoiltransferaza ima kompoziciju α6β6 podjedinica. Šest αβ-protomera se aranžiraju u simetriju D3.

Virusne kapride često su načinjene od protomera.

Također pogledajte[uredi | uredi izvor]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ Chetverin, A.B. (1986). "Evidence for a diprotomeric structure of Na, K-ATPase: Accurate determination of protein concentration and quantitative end-group analysis". FEBS Lett 196: 121–125. PMID 3002859. doi:10.1016/0014-5793(86)80225-3. 
  2. ^ Buxbaum, E. (2007). Fundamentals of protein structure and function. New York: Springer. str. 105–120. ISBN 978-0-387-26352-6. 

Vanjski linkovi[uredi | uredi izvor]