SPAG11B

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
SPAG11B
Identifikatori
AliasiSPAG11B
Vanjski ID-jeviOMIM: 606560 MGI: 3647173 HomoloGene: 83383 GeneCards: SPAG11B
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 8 (čovjek)
Hrom.Hromosom 8 (čovjek)[1]
Hromosom 8 (čovjek)
Genomska lokacija za SPAG11B
Genomska lokacija za SPAG11B
Bend8p23.1Početak7,442,684 bp[1]
Kraj7,463,674 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 8 (miš)
Hrom.Hromosom 8 (miš)[2]
Hromosom 8 (miš)
Genomska lokacija za SPAG11B
Genomska lokacija za SPAG11B
Bend8|8 A1.3Početak19,190,775 bp[2]
Kraj19,193,026 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija molecular function
Ćelijska komponenta extracellular region
Biološki proces Spermatogeneza
antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide
defense response
defense response to bacterium
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)
NM_016512
NM_058200
NM_058201
NM_058202
NM_058203

NM_058206
NM_058207

NM_001034905
NM_001039563
NM_001286493

RefSeq (bjelančevina)
NP_057596
NP_478107
NP_478108
NP_478109
NP_478110

NP_478113
NP_478114
NP_001075021
NP_001350655
NP_001075021
NP_001350655

NP_694755
NP_001030077
NP_001034652
NP_001273422

Lokacija (UCSC)Chr 8: 7.44 – 7.46 MbChr 8: 19.19 – 19.19 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Spermopridruženi antigen 11B je protein koji je kod ljudi kodiran genom SPAG11B.[5][6][7]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 103 aminokiseline, а molekulska težina 11.431 Da.[8]

1020304050
MRQRLLPSVTSLLLVALLFPGSSQARHVNHSATEALGELRERAPGQGTNG
FQLLRHAVKRDLLPPRTPPYQVHISHREARGPSFRICVDFLGPRWARGCS
TGN

Funkcija[uredi | uredi izvor]

Ovaj gen kodira nekoliko androgeno zavisnih, epididimisno specifičnih sekretornih proteina. Specifične funkcije ovih proteina nisu utvrđene, ali se smatra da su uključene u sazrijevanje spermatozoida. Neke od izoformi sadrže regije slične beta-defenzinima, porodice antimikrobnih peptida. Gen se nalazi na hromosomu 8, sekvenca p23, u blizini klastera gena za defenzin. Alternativna prerada ovog gena rezultira sa sedam varijanti transkripta koje kodiraju različite izoforme. Dvije različite N-terminalne i pet različitih C-terminalnih proteinskih sekvenci kodirane su prerađenim varijantama. Opisane su dvije dodatne varijante, ali njihove pune sekvence nisu utvrđene.[7]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c ENSG00000274405, ENSG00000288309 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000164871, ENSG00000274405, ENSG00000288309 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000059463 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Osterhoff C, Kirchhoff C, Krull N, Ivell R (mart 1994). "Molecular cloning and characterization of a novel human sperm antigen (HE2) specifically expressed in the proximal epididymis". Biology of Reproduction. 50 (3): 516–25. doi:10.1095/biolreprod50.3.516. PMID 8167223.
  6. ^ Kirchhoff C, Osterhoff C, Habben I, Ivell R, Kirchloff C (april 1990). "Cloning and analysis of mRNAs expressed specifically in the human epididymis". International Journal of Andrology. 13 (2): 155–67. doi:10.1111/j.1365-2605.1990.tb00972.x. PMID 1693137.
  7. ^ a b "Entrez Gene: SPAG11 sperm associated antigen 11".
  8. ^ "UniProt, Q08648" (jezik: engleski). Pristupljeno 21. 9. 2021.

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]