Idi na sadržaj

SSC4D

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
SSC4D
Identifikatori
AliasiSSC4D
Vanjski ID-jeviOMIM: 607639 MGI: 1924709 HomoloGene: 34137 GeneCards: SSC4D
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 7 (čovjek)
Hrom.Hromosom 7 (čovjek)[1]
Hromosom 7 (čovjek)
Genomska lokacija za SSC4D
Genomska lokacija za SSC4D
Bend7q11.23Početak76,389,334 bp[1]
Kraj76,409,697 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 5 (miš)
Hrom.Hromosom 5 (miš)[2]
Hromosom 5 (miš)
Genomska lokacija za SSC4D
Genomska lokacija za SSC4D
Bend5|5 G2Početak135,989,065 bp[2]
Kraj136,003,385 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija scavenger receptor activity
Ćelijska komponenta membrana
extracellular region
external side of plasma membrane
Biološki proces receptor-mediated endocytosis
vesicle-mediated transport
Endocitoza
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_080744

NM_001160366

RefSeq (bjelančevina)

NP_542782

NP_001153838

Lokacija (UCSC)Chr 7: 76.39 – 76.41 MbChr 5: 135.99 – 136 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Član skavengerske porodice proteina bogatih cisteinom sa četiri domena jest protein koji je kod ljudi kodiran genom SSC4D. [5]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 575 aminokiselina, а molekulska težina 60.819 Da.[6]

1020304050
MHKEAEMLIGPQLDEKRWGWRLGDGSAAPPFLPQALSFLLLLPLASALQP
TPLPFQELRLVGGPSRCRGRLEVMHGGSWGSVCDDDWDVVDANVVCRQLG
CGLALPVPRPLAFGQGRGPILLDNVECRGQEAALSECGSRGWGVHNCFHY
EDVAVLCDEFLPTQPPTRKMLTSRAPPTTLPNGKSEGSVRLVGGANLCQG
RVEILHSGLWGTVCDDDWGLPDAAVVCRQLGCGAAMAATTNAFFGYGTGH
ILLDNVHCEGGEPRLAACQSLGWGVHNCGHHEDAGALCAGLGPPTLTALP
SSATREDWAWQTDPSATGVGPQPSRETALLTTAAWAAGKKSGRLRLVGGP
GPCRGRVEVLHAGGWGTVCDDDWDFADARVACREAGCGPALGATGLGHFG
YGRGPVLLDNVGCAGTEARLSDCFHLGWGQHNCGHHEDAGALCAGPEELG
LQVQQDGSETTRVPTPRPRDGHLRLVNGAHRCEGRVELYLGQRWGTVCDD
AWDLRAAGVLCRQLGCGQALAAPGEAHFGPGRGPILLDNVKCRGEESALL
LCSHIRWDAHNCDHSEDASVLCQPS

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Proteinski domen skavengerskog receptora bogatog cisteinom (SRCR) je stara i visoko konzervirana grupa površinskih ćelijskih i/ili izlučenih proteina, od kojih su neki uključeni u razvoj imunskog sistema i regulaciju urođenog i adaptivnih imunskih odgovora. SRCR domeni grupe B obično sadrže po osam pravilno raspoređenih cistein,a koji uzrokuju dobro definiran unutardomen disulfidne veze.

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000146700 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029699 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: Scavenger receptor cysteine rich family member with 4 domains". Pristupljeno 2016-09-05.
  6. ^ "UniProt, Q8WTU2" (jezik: engleski). Zanemaren tekst "2021-09-29" (pomoć)

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]
  • Padilla O, Pujana MA, López-de la Iglesia A, Gimferrer I, Arman M, Vilà JM, Places L, Vives J, Estivill X, Lozano F (2002). "Cloning of S4D-SRCRB, a new soluble member of the group B scavenger receptor cysteine-rich family (SRCR-SF) mapping to human chromosome 7q11.23". Immunogenetics. 54 (9): 621–34. doi:10.1007/s00251-002-0507-z. PMID 12466895. S2CID 731351.