STAU1

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
STAU1
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

4DKK

Identifikatori
AliasiSTAU1
Vanjski ID-jeviOMIM: 601716 MGI: 1338864 HomoloGene: 3384 GeneCards: STAU1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 20 (čovjek)
Hrom.Hromosom 20 (čovjek)[1]
Hromosom 20 (čovjek)
Genomska lokacija za STAU1
Genomska lokacija za STAU1
Bend20q13.13Početak49,113,339 bp[1]
Kraj49,188,367 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 2 (miš)
Hrom.Hromosom 2 (miš)[2]
Hromosom 2 (miš)
Genomska lokacija za STAU1
Genomska lokacija za STAU1
Bend2|2 H3Početak166,789,469 bp[2]
Kraj166,838,219 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije




Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija protein phosphatase 1 binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
double-stranded RNA binding
RNA binding
Ćelijska komponenta citoplazma
cell body
rough endoplasmic reticulum
membrana
Ćelijska membrana
microtubule associated complex
neuronal cell body
dendrit
Endoplazmatski retikulum
cytoplasmic ribonucleoprotein granule
neuron projection
cytoplasmic stress granule
Egzosom
citosol
glutamatergic synapse
Biološki proces positive regulation of long-term synaptic potentiation
positive regulation by virus of viral protein levels in host cell
cellular response to oxidative stress
positive regulation of viral genome replication
modulation of chemical synaptic transmission
modification of postsynaptic structure
GO:0022415 viral process
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)
NM_001037328
NM_004602
NM_017452
NM_017453
NM_017454

NM_001319134
NM_001319135
NM_001322927
NM_001322928
NM_001322929
NM_001322930
NM_001322931
NM_001322932
NM_001322933

NM_001109905
NM_001109906
NM_001291160
NM_011490

RefSeq (bjelančevina)
NP_001032405
NP_001306063
NP_001306064
NP_001309856
NP_001309857

NP_001309858
NP_001309859
NP_001309860
NP_001309861
NP_001309862
NP_004593
NP_059346
NP_059347
NP_059348

NP_001103375
NP_001103376
NP_001278089
NP_035620

Lokacija (UCSC)Chr 20: 49.11 – 49.19 MbChr 2: 166.79 – 166.84 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Dvolančani RNK-vezujući staufen-proteinski homolog 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom STAU1.[5][6][7]

Staufen je član porodice dvolančanih RNK (dsRNA)-vezujućih proteina koji učestvuju u transportu i / ili lokalizaciji iRNK u različite subćelijskim odeljcima i / ili organelama. Ove proteine karakterizira prisustvo višestrukih dsRNK-vezujućih domena, koje su potrebni da vežu RNK sa dvolančanom sekundarnom strukturom. Ljudski homolog staufena kodiran pomoću STAU, osim toga, sadrži mikrotubule–vezujući domen sličan domenu protein 1B povezan sa mikrotubulama i veže tubulin. Pokazalo se da je proizvod gena STAU prisutan u citoplazmi zajedno sa hrapavim endoplazmatskim retikulumom (RER), implicirajući ovaj protein u transportu iRNK mrežom mikrotubula do mesta translacije RER-a. Opisane su pet varijanti transkripta koje proizlaze iz alternativne prerade proizvoda gena STAU i kodiraju tri izoforme. Tri od ovih varijanti kodiraju istu izoformu, alirazlikuju se u svojm 5'UTR.[7]

STAU1 je povezan sa granulama stresova.[8]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Simboli
1020304050
MSQVQVQVQNPSAALSGSQILNKNQSLLSQPLMSIPSTTSSLPSENAGRP
IQNSALPSASITSTSAAAESITPTVELNALCMKLGKKPMYKPVDPYSRMQ
STYNYNMRGGAYPPRYFYPFPVPPLLYQVELSVGGQQFNGKGKTRQAAKH
DAAAKALRILQNEPLPERLEVNGRESEEENLNKSEISQVFEIALKRNLPV
NFEVARESGPPHMKNFVTKVSVGEFVGEGEGKSKKISKKNAAIAVLEELK
KLPPLPAVERVKPRIKKKTKPIVKPQTSPEYGQGINPISRLAQIQQAKKE
KEPEYTLLTERGLPRRREFVMQVKVGNHTAEGTGTNKKVAKRNAAENMLE
ILGFKVPQAQPTKPALKSEEKTPIKKPGDGRKVTFFEPGSGDENGTSNKE
DEFRMPYLSHQQLPAGILPMVPEVAQAVGVSQGHHTKDFTRAAPNPAKAT
VTAMIARELLYGGTSPTAETILKNNISSGHVPHGPLTRPSEQLDYLSRVQ
GFQVEYKDFPKNNKNEFVSLINCSSQPPLISHGIGKDVESCHDMAALNIL
KLLSELDQQSTEMPRTGNGPMSVCGRC

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000124214 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000039536 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ DesGroseillers L, Lemieux N (Feb 1997). "Localization of a human double-stranded RNA-binding protein gene (STAU) to band 20q13.1 by fluorescence in situ hybridization". Genomics. 36 (3): 527–529. doi:10.1006/geno.1996.0499. PMID 8884277.
  6. ^ Kim YK, Furic L, Desgroseillers L, Maquat LE (Jan 2005). "Mammalian Staufen1 recruits Upf1 to specific mRNA 3'UTRs so as to elicit mRNA decay". Cell. 120 (2): 195–208. doi:10.1016/j.cell.2004.11.050. PMID 15680326.
  7. ^ a b "Entrez Gene: STAU1 staufen, RNA binding protein, homolog 1 (Drosophila)".
  8. ^ Thomas MG, Martinez Tosar LJ, Loschi M, Pasquini JM, Correale J, Kindler S, Boccaccio GL (januar 2005). "Staufen recruitment into stress granules does not affect early mRNA transport in oligodendrocytes". Molecular Biology of the Cell. 16 (1): 405–420. doi:10.1091/mbc.E04-06-0516. PMC 539183. PMID 15525674.

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]