TAF7L

TAF7L
Identifikatori
Aliasi	TAF7L
Vanjski ID-jevi	OMIM: 300314 MGI: 1921719 HomoloGene: 83311 GeneCards: TAF7L
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom X
Kraj	101,293,057 bp
Lokacija gena (miš)
Hrom.	Hromosom X (miš)
Kraj	133,377,239 bp
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• GO:0001105 transcription coactivator activity; • transcription factor binding; • histone acetyltransferase binding; • molekularna funkcija;
Ćelijska komponenta	• citoplazma; • transcription factor TFIID complex; • jedro;
Biološki proces	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • multicellular organism development; • Ćelijska diferencijacija; • RNA polymerase II preinitiation complex assembly; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • Spermatogeneza; • transcription, DNA-templated; • GO:0022610 biološki proces; • positive regulation of nucleic acid-templated transcription;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	54457
	74469
	ENSG00000102387
	ENSMUSG00000009596
	Q5H9L4
	Q9D3R9
	NM_001168474; NM_024885
	NM_028958
	NP_001161946; NP_079161
	NP_083234
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek	Pogledaj/uredi – miš

TATA-boks vezujući protein-asocirani 7-oliki faktor, znan i kao CT40 je protein koji je kod ljudi kodiran genom TAF7l.^[5] Bliski je homolog s TAF7 genom, iako njegova funkcija može biti drugačija. Sada se malo zna o ovom genu. Prvobitno je pokazano da je zasnovan na testisnim RT-PCR eksperimentima na ekstraktima tkiva; međutim, sada je pronađen u bijelom i smeđem masnom tkivu,^[6] kao i kod određenih tipova karcinoma.^[7]

Funkcija[uredi | uredi izvor]

Funkcija u formiranju masnog tkiva[uredi | uredi izvor]

Studije provedene na nokaut životinjama otkrile su da Taf7l daje važan doprinos u određivanju sudbine mezenhimskih matičnih ćelija. Što je najvažnije, Zhou et al. pronašli su ga u Taf7L^−/− (Taf7L nokaut) životinjama koje imaju smanjene masne jastučiće, infiltrirane u koštano mišićno tkivo. Koristeći RNK-seq i programa Gene Ontology Enrichment (GO), ista grupa otkrila je da je došlo do povećanja GO termina (a time i kategorija gena) koji su bili uključeni u razvoj skeleta i mišića. U kombinaciji s dokazima in vitro, čini se da je Taf7l sposoban inicirati proizvodnju smeđe masti (takozvane zdrave masti). Pored toga, otkrili su da, zajedno s PPARgammom, Taf7l vjerovatno može regulirati vezanje kompleksa TFIID / RNKolimeraze II (RNAP II). Konkretno, prisustvo Taf7l može promijeniti petlju hromatina, a time i povezanost distalnih pojačivača s BAT-specifičnim promotorima gena, poput Cidea i Scd1.

Funkcija u kancerima[uredi | uredi izvor]

Nedavno je utvrđeno da kod tri pacijenta sa kolorektumskim karcinomom postoji okvirna mutacija. Konkretno, za regiju ponavljanja poli-A mono-nukleotida u egzonu 6 Taf7l utvrđeno je da mu nedostaje jedan nukleotid (delecijska mutacija), što rezultira mutacijom pomicanja okvira. Dodatno je utvrđeno da je smanjen u 58% akutnoj mijelogenoj leukemiji (AML).

Funkcija u spermatogenezi: uzajamnost s TAF7[uredi | uredi izvor]

Veći dio početnog rada potekao je od Pointuda et al., koji su otkrili su da, tokom spermatogeneze, Taf7l ima dvostruku funkcionalnost. U spermatocitima u ranoj fazi, naprimjer u primarnim spermatocitima (tada još uvijek diploidni), TAF7l se nalazi u citoplazmi, dok se kompleks TATA-vežućeg proteina (TBP) nalazi u jedru. Zatim, TAF7l polahko prelazi u jedro, tokom srednje faze pahitina, gdje također dolazi do dramatičnog povećanja ekspresije proteina TBP u jedru. Pored toga, postoji uzajamna veza sa odnosom ekspresije TAF7: Za razliku od TAF7l, TAF7 se u ranim fazama eksprimira u jedru i na taj način odvaja od TAF7l. Zatim, u kasnijim fazama, kada TAF7l prelazi u jedro, što se događa otprilike u vrijeme kada se dogodi somatski (diploidni) prijelaz u zametne ćelije (haploidni), TAF7 dramatično opada. To može ukazivati da TAF7l ima važnu ulogu u regulaciji TFIID-a tokom razvoja sperme. Pointud i sur. (2003) pretpostavljaju da u haploidnim spermatocitima TAF7l može "označiti" određene gene za ekspresiju ili represiju.

Funkcija tokom transkripcije[uredi | uredi izvor]

Definitivna uloga TAF7l tokom transkripcije i dalje ostaje nedostižna. Snimcihibridnog kvasca-2 utvrdili su da TAF7l snažno komunicira s TAF1 u potpuno istoj regiji (aminokiseline 1170-1226 kod TAF1) za koju se TAF7 veže i inaktivira funkciju acetiltransferaze (AT) TAF1. Zato je vjerovatno da TAF7l ima sličnu ulogu kao TAF7, u inhibiranju TAF1, a time i aktivnosti kompleksa TFIID. TAF7l se tokom rane spermatogeneze lokalizira u drugom odjeljku u odnosu na TBP, što implicira funkciju neovisnu o TBP, koja čeka dalje istraživanje. Pored toga, program Chromosome Conformation Capture identificirao je ulogu TAF7 u izravnom posredovanju vezanja elemenata pojačivača na promotorske sekvence na koje se veže TFIID. To dalje sugerira da TAF7l zamjenjuje funkciju TAF7, jer je također pokazano da se TAF7 veže i regulira ekspresiju gena (vitamin D3 ili tireoidni hormon, naprimjer) na specifičan način promotora^[8]

Reference[uredi | uredi izvor]

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000102387 - Ensembl, maj 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000009596 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Pointud JC, Mengus G, Brancorsini S, Monaco L, Parvinen M, Sassone-Corsi P, Davidson I (maj 2003). "The intracellular localisation of TAF7L, a paralogue of transcription factor TFIID subunit TAF7, is developmentally regulated during male germ-cell differentiation". Journal of Cell Science. 1 (116): 1847–58. doi:10.1242/jcs.00391. PMID 12665565.
^ https://elifesciences.org/content/3/e02811
^ Oh HR, An CH, Yoo NJ, Lee SH (juli 2015). "Frameshift mutations of TAF7L gene, a core component for transcription by RNA polymerase II, in colorectal cancers". Pathology of Oncology Research. 21 (3): 849–50. doi:10.1007/s12253-014-9832-4. PMID 25098277.
^ G. S. Gupta (2 Jul 2006). Proteomics of Spermatogenesis. Springer Science & Business Media. str. 327. ISBN 9780387276557.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000102387 - Ensembl, maj 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000009596 - Ensembl, maj 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid12665565-5] Pointud JC, Mengus G, Brancorsini S, Monaco L, Parvinen M, Sassone-Corsi P, Davidson I (maj 2003). "The intracellular localisation of TAF7L, a paralogue of transcription factor TFIID subunit TAF7, is developmentally regulated during male germ-cell differentiation". Journal of Cell Science. 1 (116): 1847–58. doi:10.1242/jcs.00391. PMID 12665565.

[elifesciences.org-6] ttps://elifesciences.org/content/3/e02811

[pmid25098277-7] Oh HR, An CH, Yoo NJ, Lee SH (juli 2015). "Frameshift mutations of TAF7L gene, a core component for transcription by RNA polymerase II, in colorectal cancers". Pathology of Oncology Research. 21 (3): 849–50. doi:10.1007/s12253-014-9832-4. PMID 25098277.

[8] G. S. Gupta (2 Jul 2006). Proteomics of Spermatogenesis. Springer Science & Business Media. str. 327. ISBN 9780387276557.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]