TRIT1

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
TRIT1
Identifikatori
AliasiTRIT1
Vanjski ID-jeviOMIM: 617840 MGI: 1914216 HomoloGene: 7010 GeneCards: TRIT1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 1 (čovjek)
Hrom.Hromosom 1 (čovjek)[1]
Hromosom 1 (čovjek)
Genomska lokacija za TRIT1
Genomska lokacija za TRIT1
Bend1p34.2Početak39,838,110 bp[1]
Kraj39,883,511 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 4 (miš)
Hrom.Hromosom 4 (miš)[2]
Hromosom 4 (miš)
Genomska lokacija za TRIT1
Genomska lokacija za TRIT1
Bend4|4 D2.2Početak122,910,390 bp[2]
Kraj122,948,742 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija aktivnost sa transferazom
nucleotide binding
ATP binding
vezivanje iona metala
tRNA dimethylallyltransferase activity
nucleic acid binding
vezivanje iona cinka
Ćelijska komponenta citoplazma
mitochondrial matrix
mitohondrija
ćelijska komponenta
Biološki proces mitochondrial tRNA modification
tRNA processing
tRNA modification
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001312691
NM_001312692
NM_017646

NM_025873

RefSeq (bjelančevina)

NP_001299620
NP_001299621
NP_060116

NP_080149

Lokacija (UCSC)Chr 1: 39.84 – 39.88 MbChr 4: 122.91 – 122.95 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Mitohondrijska tRNK izopenteniltransferaza jest enzim koji je kod ljudi kodiran genom TRIT1 sa hromosoma 1.

Katalizira dodavanje izopentenil grupe iz dimetilalil-difosfata (DMAPP) na adenozinski ostatak 37 određenih molekula tRNK.[5][6][7]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 467 aminokiselina, a molekulska težina 52.725 Da.[8]

1020304050
MASVAAARAVPVGSGLRGLQRTLPLVVILGATGTGKSTLALQLGQRLGGE
IVSADSMQVYEGLDIITNKVSAQEQRICRHHMISFVDPLVTNYTVVDFRN
RATALIEDIFARDKIPIVVGGTNYYIESLLWKVLVNTKPQEMGTEKVIDR
KVELEKEDGLVLHKRLSQVDPEMAAKLHPHDKRKVARSLQVFEETGISHS
EFLHRQHTEEGGGPLGGPLKFSNPCILWLHADQAVLDERLDKRVDDMLAA
GLLEELRDFHRRYNQKNVSENSQDYQHGIFQSIGFKEFHEYLITEGKCTL
ETSNQLLKKGIEALKQVTKRYARKQNRWVKNRFLSRPGPIVPPVYGLEVS
DVSKWEESVLEPALEIVQSFIQGHKPTATPIKMPYNEAENKRSYHLCDLC
DRIIIGDREWAAHIKSKSHLNQLKKRRRLDSDAVNTIESQSVSPDHNKEP
KEKGSPGQNDQELKCSV

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000043514 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028653 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Golovko A, Hjalm G, Sitbon F, Nicander B (Jan 2001). "Cloning of a human tRNA isopentenyl transferase". Gene. 258 (1–2): 85–93. doi:10.1016/S0378-1119(00)00421-2. PMID 11111046.
  6. ^ Spinola M, Galvan A, Pignatiello C, Conti B, Pastorino U, Nicander B, Paroni R, Dragani TA (Aug 2005). "Identification and functional characterization of the candidate tumor suppressor gene TRIT1 in human lung cancer". Oncogene. 24 (35): 5502–9. doi:10.1038/sj.onc.1208687. PMID 15870694.
  7. ^ "Entrez Gene: TRIT1 tRNA isopentenyltransferase 1".
  8. ^ "UniProt, Q9H3H1" (jezik: eng.). Pristupljeno 3. 12. 2021.CS1 održavanje: nepoznati jezik (link)

Dopunska likteratura[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi[uredi | uredi izvor]