Transformirajući faktor rasta alfa

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
Transformirajući faktor rasta alfa
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1GK5, 1MOX, 1YUF, 1YUG, 2TGF, 3E50, 3TGF, 4TGF

Identifikatori
AliasiTGFA
Vanjski ID-jeviOMIM: 190170 MGI: 98724 HomoloGene: 2431 GeneCards: TGFA
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 2 (čovjek)
Hrom.Hromosom 2 (čovjek)[1]
Hromosom 2 (čovjek)
Genomska lokacija za Transformirajući faktor rasta alfa
Genomska lokacija za Transformirajući faktor rasta alfa
Bend2p13.3Početak70,447,284 bp[1]
Kraj70,554,193 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 6 (miš)
Hrom.Hromosom 6 (miš)[2]
Hromosom 6 (miš)
Genomska lokacija za Transformirajući faktor rasta alfa
Genomska lokacija za Transformirajući faktor rasta alfa
Bend6 D1|6 37.62 cMPočetak86,172,205 bp[2]
Kraj86,252,701 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije




Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija epidermal growth factor receptor binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
growth factor activity
Ćelijska komponenta integral component of membrane
endoplasmic reticulum membrane
membrana
ćelijska membrana
integral component of plasma membrane
extracellular region
cell surface
basolateral plasma membrane
perinuklearno područje citoplazme
ER to Golgi transport vesicle membrane
endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane
GO:0016023 citoplazmatska vezikula
Golđijeva membrana
Vanćelijsko
clathrin-coated vesicle membrane
Biološki proces positive regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity
positive regulation of epithelial cell proliferation
endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport
COPII vesicle coating
Ćelijska proliferacija
positive regulation of mitotic nuclear division
positive regulation of cell division
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
epidermal growth factor receptor signaling pathway
positive regulation of cell population proliferation
MAPK cascade
GO:0072468 Transdukcija signala
negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway
positive regulation of protein kinase B signaling
membrane organization
GO:0007243 intracellular signal transduction
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001099691
NM_001308158
NM_001308159
NM_003236

NM_031199

RefSeq (bjelančevina)

NP_001093161
NP_001295087
NP_001295088
NP_003227

NP_112476
NP_001390047

Lokacija (UCSC)Chr 2: 70.45 – 70.55 MbChr 6: 86.17 – 86.25 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Transformirajući faktor rasta alfa (TGF-α) jest protein koji je kod ljudi kodiran genom TGFA sa hromosoma 2.[5] Kao član porodice sličnih EGF članova epidermnog faktora rasta (EGF), TGF-α je mitogeni polipeptid.[6] Protein se aktivira kada se veže za receptore koji su sposobni za aktivnost protein-kinaza za ćelijsku signalizaciju.

TGF-α je transformirajući faktor rasta koji je ligand za receptor epidermnog faktora rasta, koji aktivira signalni put za proliferaciju, diferencijaciju i razvoj ćelija. Ovaj protein može djelovati ili kao transmembranski vezani ili kao rastvorljivi ligand. Ovaj gen povezan je sa mnogim tipovima karcinoma, a može biti uključen i u nekim slučajevima rascjepa usne/nepca.[5]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 160 aminokiselina, a molekulska težina 17.006 Da.[5]

1020304050
MVPSAGQLALFALGIVLAACQALENSTSPLSADPPVAAAVVSHFNDCPDS
HTQFCFHGTCRFLVQEDKPACVCHSGYVGARCEHADLLAVVAASQKKQAI
TALVVVSIVALAVLIITCVLIHCCQVRKHCEWCRALICRHEKPSALLKGR
TACCHSETVV

Funkcija[uredi | uredi izvor]

TGF-α se može proizvesti u makrofagima, ćelijama mozga i keratinocitima. TGF-α indukuje razvoj epitela. S obzirom da je TGF-α član porodice EGF, biološka dejstva TGF-α i EGF-a su slična. Naprimjer, TGF-α i EGF se vezuju za isti receptor. Kada se TGF-α veže za EGFR, može pokrenuti višestruke događaje ćelijske proliferacije.[7] Ćelijske proliferacije koje uključuju TGF-α vezan za EGFR obuhvataju zarastanje rana i embriogenezu. TGF-α je također uključen u tumerigenezu, a vjeruje se da promovira angiogenezu.[8]

Također se pokazalo da TGF-α stimuliše neuronske ćelije za proliferaciju kod povreda mozga odraslih.[9]

Sinteza[uredi | uredi izvor]

TGF-α se sintetizira interno kao dio transmembranskog prekursora od 160 (ljudski) ili 159 (pacov) aminokiselina.[8] Prekursor se sastoji od vanćelijskog domena koji sadrži hidrofobni transmembranski domen, od 50 aminokiselina TGF-α i citoplazmatski domen od 35 ostataka.[8] U svom najmanjem obliku, TGF-α ima šest cisteina povezanih preko tri disulfidna mosta. Zajedno, svi članovi porodice EGF/TGF-α dijele ovu strukturu. Protein, međutim, nije direktno povezan sa TGF-β.

Ograničeni uspjeh rezultat je pokušaja da se sintetizira redukcijski molekul za TGF-α koji eksprimira sličan biološki profil.[7]

Sinteza u želucu[uredi | uredi izvor]

U želucu, TGF-α se proizvodi unutar normalne želučane sluznice.[10] Pokazalo se da TGF-α inhibira lučenje želučane kiseline.

Receptor[uredi | uredi izvor]

Glikozilirani protein od 170 kDa poznat kao EGF receptor vezuje se za TGF-α, omogućavajući polipeptidu da funkcioniše na različitim signalnim putevima.[6] EGF receptor karakteriše postojanje vanćelijskog domena koji ima brojne aminokiselinske motive. EGFR je neophodan za jedan transmembranski domen, unutartćelijski domen (sadrži aktivnost tirozin-kinaza) i prepoznavanje liganda.[6] Kao faktor rasta usidren membranom, TGF-α se može otcijepiti od integralnog membranskog glikoproteina putem proteaza.[8] Rastvorljivi oblici TGF-α koji nastaju cijepanjem imaju kapacitet da aktiviraju EGFR. EGFR se također može aktivirati iz faktora rasta koji je ugrađen u membranu.

Kada se TGF-α veže za EGFR, dimerizira, izazivajući fosforilaciju protein-tirozin kinaze. Aktivnost protein-tirozin kinaze uzrokuje autofosforilaciju između nekoliko ostataka tirozina unutar EGFR, utičući na aktivaciju i signalizaciju drugih proteina koji djeluju u mnogim putevima prijenosa signala.

Signalni put nakon vezivanja za TGF-α receptora epidermnog faktora rasta (EGFR).

Studije na životinjama[uredi | uredi izvor]

U životinjskom modelu Parkinsonove bolesti gdje su dopaminski neuroni oštećeni 6-hidroksidopaminom, infuzija TGF-α u mozak izazvala je povećanje broja neuronskih prekursorskih ćelija.[9] Međutim, tretman TGF-α nije rezultirao neurogenezom dopaminskih neurona.[11]

Studije na ljudima[uredi | uredi izvor]

Neuroendokrini sistem[uredi | uredi izvor]

Pokazalo se da porodica EGF/TGF-α reguliše luteinizirajući hormon-oslobađajući hormon (LHRH), preko glija-neuronskog interaktivnog procesa.[6] Proizveden u astrocitima hipotalamusa, TGF -α indirektno stimuliše oslobađanje LHRH putem različitih intermedijera. Kao rezultat toga, TGF-α je fiziološka komponenta neophodna za početak procesa ženskog puberteta.[6]

Suprahijazmatsko jezgro[uredi | uredi izvor]

Primijećeno je također da je TGF-α visoko eksprimiran u suprahijazmatskom jezgru (SCN) (5). Ovaj nalaz ukazuje na ulogu EGFR signalizacije u regulaciji SATA i cirkadijskih ritmova unutar SCN-a..[12] Slične studije pokazale su da, kada se ubrizgava u treću komoru, TGF-α može potisnuti cirkadijskoo lokomotorno ponašanje zajedno s aktivnostima pića ili jela.[12]

Tumori[uredi | uredi izvor]

Ovaj protein pokazuje potencijalnu upotrebu kao prognostičkog biomarkera kod različitih tumora, kao što je karcinom želuca[13] ili melanom (što je sugerirano).[14] Povećanje TGF-α vezano je za Menetrierovu bolest, predkancerozno stanje želuca.[15]

Interakcije[uredi | uredi izvor]

Pokazalo se da TGF alfa reaguje sa GORASP1[16] i GORASP2.[16]

Također pogledajte[uredi | uredi izvor]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000163235 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029999 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b c "Entrez Gene: TGFA transforming growth factor alpha".
  6. ^ a b c d e Ojeda, S. R.; Ma, Y. J.; Rage, F. (septembar 1997). "The transforming growth factor alpha gene family is involved in the neuroendocrine control of mammalian puberty". Molecular Psychiatry. 2 (5): 355–358. doi:10.1038/sj.mp.4000307. PMID 9322223.
  7. ^ a b McInnes, C; Wang, J; Al Moustafa, AE; Yansouni, C; O'Connor-McCourt, M; Sykes, BD (1998). "Structure-based minimization of transforming growth factor-alpha (TGF-alpha) through NMR analysis of the receptor-bound ligand. Design, solution structure, and activity of TGF-alpha 8-50"". J. Biol. Chem. 273 (42): 27357–63. doi:10.1074/jbc.273.42.27357. PMID 9765263.
  8. ^ a b c d Ferrer, I.; Alcantara, S.; Ballabriga, J.; Olive, M.; Blanco, R.; Rivera, R.; Carmona, M.; Berruezo, M.; Pitarch, S.; Planas, A. Transforming growth factor- α (TGF-α) and epidermal growth factor-receptor (EGF-R) immunoreactivity in normal and pathologic brain. Prog. Neurobiol. 1996, 49, 99.
  9. ^ a b Fallon J, Reid S, Kinyamu R, Opole I, Opole R, Baratta J, Korc M, Endo TL, Duong A, Nguyen G, Karkehabadhi M, Twardzik D, Patel S, Loughlin S (2000). "In vivo induction of massive proliferation, directed migration, and differentiation of neural cells in the adult mammalian brain". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 97 (26): 14686–91. Bibcode:2000PNAS...9714686F. doi:10.1073/pnas.97.26.14686. PMC 18979. PMID 11121069.CS1 održavanje: upotreba parametra authors (link)
  10. ^ Coffey, R.; Gangarosa, L.; Damstrup, L.; Dempsey, P. Osnovne akcije transformacije faktora rasta-α i srodnih peptida. EUR. J. Gastroen. Hepat. 1995, 7, 923.
  11. ^ Cooper O, Isacson O (oktobar 2004). "Intrastriatal transforming growth factor alpha delivery to a model of Parkinson's disease induces proliferation and migration of endogenous adult neural progenitor cells without differentiation into dopaminergic neurons". J. Neurosci. 24 (41): 8924–31. doi:10.1523/JNEUROSCI.2344-04.2004. PMC 2613225. PMID 15483111.
  12. ^ a b Hao, H.; Schwaber, J. Epidermal growth factor receptor induced Erk phosphorylation in the suprachiasmatic nucleus. Brain Res. 2006, 1088, 45.
  13. ^ Fanelli MF (Aug 2012). "The influence of transforming growth factor-α, cyclooxygenase-2, matrix metalloproteinase (MMP)-7, MMP-9 and CXCR4 proteins involved in epithelial-mesenchymal transition on overall survival of patients with gastric cancer". Histopathology. 61 (2): 153–61. doi:10.1111/j.1365-2559.2011.04139.x. PMID 22582975. S2CID 6566296.
  14. ^ Tarhini AA (Jan 2014). "A four-marker signature of TNF-RII, TGF-α, TIMP-1 and CRP is prognostic of worse survival in high-risk surgically resected melanoma". J Transl Med. 12: 19. doi:10.1186/1479-5876-12-19. PMC 3909384. PMID 24457057.
  15. ^ Coffey, Robert J.; Washington, Mary Kay; Corless, Christopher L.; Heinrich, Michael C. (2007). "Ménétrier disease and gastrointestinal stromal tumors: hyperproliferative disorders of the stomach". Journal of Clinical Investigation. 117 (1): 70–80. doi:10.1172/JCI30491. PMC 1716220. PMID 17200708.
  16. ^ a b Barr FA, Preisinger C, Kopajtich R, Körner R (decembar 2001). "Golgi matrix proteins interact with p24 cargo receptors and aid their efficient retention in the Golgi apparatus". J. Cell Biol. 155 (6): 885–91. doi:10.1083/jcb.200108102. PMC 2150891. PMID 11739402.

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi[uredi | uredi izvor]

Ovaj članak uključuje tekst iz Nacionalne medicinske biblioteke Sjedinjenih Država, koji je u javnom vlasništvu.