UBAP2

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
UBAP2
Identifikatori
AliasiUBAP2
Vanjski ID-jeviMGI: 1916176 HomoloGene: 73649 GeneCards: UBAP2
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 9 (čovjek)
Hrom.Hromosom 9 (čovjek)[1]
Hromosom 9 (čovjek)
Genomska lokacija za UBAP2
Genomska lokacija za UBAP2
Bend9p13.3Početak33,921,693 bp[1]
Kraj34,048,949 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 4 (miš)
Hrom.Hromosom 4 (miš)[2]
Hromosom 4 (miš)
Genomska lokacija za UBAP2
Genomska lokacija za UBAP2
Bend4|4 A5Početak41,194,313 bp[2]
Kraj41,275,144 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje sa RNK
cadherin binding
Ćelijska komponenta jedro
citoplazma
Biološki proces GO:1901313 positive regulation of gene expression
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_020867
NM_001282529
NM_001282530
NM_018449

NM_026872

RefSeq (bjelančevina)
NP_001269459
NP_060919
NP_001356988
NP_001356991
NP_001356993

NP_001356995
NP_001356996
NP_001356997

NP_081148

Lokacija (UCSC)Chr 9: 33.92 – 34.05 MbChr 4: 41.19 – 41.28 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Ubikvitinu-pridruženi protein 2 je protein koji je kod ljudi kodiran genom UBAP2.[5][6]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 1.119 aminokiselina, a molekulska težina 117.116 Da[7]

1020304050
MMTSVSSDHCRGAREKPQISAAQSTQPQKQVVQATAEQMRLAQVIFDKND
SDFEAKVKQLMEVTGKNQDECIVALHDCNGDVNKAINILLEGNSDTTSWE
TVGCKKKNFAKENSENKENREKKSEKESSRGRGNNNRKGRGGNRGREFRG
EENGIDCNQVDKPSDRGKRARGRGFGRGRGRGAGRFSTQGMGTFNPADYS
DSTSTDVCGTKLVVWEAAQNGADEGTELASNTHNIAQDLSNKSSYGLKGA
WKNSVEEWTTEDWTEDLSETKVFTASSAPAENHILPGQSIDLVALLQKPV
PHSQASEANSFETSQQQGFGQALVFTNSQHNNQMAPGTGSSTAVNSCSPQ
SLSSVLGSGFGELAPPKMANITSSQILDQLKAPSLGQFTTTPSTQQNSTS
HPTTTTSWDLKPPTSQSSVLSHLDFKSQPEPSPVLSQLSQRQQHQSQAVT
VPPPGLESFPSQAKLRESTPGDSPSTVNKLLQLPSTTIENISVSVHQPQP
KHIKLAKRRIPPASKIPASAVEMPGSADVTGLNVQFGALEFGSEPSLSEF
GSAPSSENSNQIPISLYSKSLSEPLNTSLSMTSAVQNSTYTTSVITSCSL
TSSSLNSASPVAMSSSYDQSSVHNRIPYQSPVSSSESAPGTIMNGHGGGR
SQQTLDTPKTTGPPSALPSVSSLPSTTSCTALLPSTSQHTGDLTSSPLSQ
LSSSLSSHQSSLSAHAALSSSTSHTHASVESASSHQSSATFSTAATSVSS
SASSGASLSSSMNTANSLCLGGTPASASSSSSRAAPLVTSGKAPPNLPQG
VPPLLHNQYLVGPGGLLPAYPIYGYDELQMLQSRLPVDYYGIPFAAPTAL
ASRDGSLANNPYPGDVTKFGRGDSASPAPATTPAQPQQSQSQTHHTAQQP
FVNPALPPGYSYTGLPYYTGMPSAFQYGPTMFVPPASAKQHGVNLSTPTP
PFQQASGYGQHGYSTGYDDLTQGTAAGDYSKGGYAGSSQAPNKSAGSGPG
KGVSVSSSTTGLPDMTGSVYNKTQTFDKQGFHAGTPPPFSLPSVLGSTGP
LASGAAPGYAPPPFLHILPAHQQPHSQLLHHHLPQDAQSGSGQRSQPSSL
QPKSQASKPAYGNSPYWTN

Funkcija[uredi | uredi izvor]

Ovaj gen je novi gen izoliran na osnovu njegove ekspresije u ljudskojk nadbubrežnoj žlijezdi. Protein cijele dužine kodiran ovim genom sadrži UBA-domen (domen povezan sa ubikvitinom), koji je motiv u nekoliko proteina koji imaju veze sa ubikvitinskim putem sveprisutnosti. Osim toga, protein sadrži područje slično domenu u članovima porodice atrofin-1. Funkcija ovog proteina nije utvrđena. Mogu postojati I dodatne alternativno prerađene varijante, ali njihova puna dužina nije utvrđena.[6]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000137073 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028433 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Hofmann K, Bucher P (maj 1996). "The UBA domain: a sequence motif present in multiple enzyme classes of the ubiquitination pathway". Trends in Biochemical Sciences. 21 (5): 172–3. doi:10.1016/S0968-0004(96)30015-7. PMID 8871400.
  6. ^ a b "Entrez Gene: UBAP2 ubiquitin associated protein 2".
  7. ^ "UniProt, Q5T6F2". Pristupljeno 10. 9. 2021.

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]