UNC13C

UNC13C
Identifikatori
Aliasi	UNC13C
Vanjski ID-jevi	OMIM: 614568 MGI: 2149021 HomoloGene: 45443 GeneCards: UNC13C
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 15 (čovjek)
Kraj	54,628,707 bp
Lokacija gena (miš)
Hrom.	Hromosom 9 (miš)
Kraj	73,876,248 bp
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• diacylglycerol binding; • vezivanje iona metala; • calcium ion binding; • phospholipid binding; • calmodulin binding; • syntaxin-1 binding;
Ćelijska komponenta	• citoplazma; • presynaptic active zone; • međućelijske veze; • ćelijska membrana; • sinapsa; • presynaptic membrane; • membrana; • terminal bouton; • calyx of Held; • presynapse; • parallel fiber to Purkinje cell synapse; • synaptic vesicle membrane; • Nervno-mišićna veza; • presynaptic active zone cytoplasmic component;
Biološki proces	• GO:0007243 intracellular signal transduction; • Egzocitoza; • chemical synaptic transmission; • synaptic vesicle exocytosis; • negative regulation of synaptic plasticity; • neuromuscular junction development; • synaptic vesicle docking; • synaptic vesicle priming; • synaptic vesicle maturation; • synaptic transmission, glutamatergic; • dense core granule priming; • presynaptic dense core vesicle exocytosis;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	440279
	208898
	ENSG00000137766
	ENSMUSG00000062151
	Q8NB66
	Q8K0T7
	NM_001080534; NM_001329919
	NM_001081153; NM_153531
	NP_001074003; NP_001316848
	NP_001074622
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek	Pogledaj/uredi – miš

Unc-13 homolog C (C. elegans) je protein koji je kod ljudi kodiran genom UNC13C.^[5]

UNC13 proteini, poput UNC13C, dijele homologiju sa Unc13 C. elegans i pretežno se eksprimiraju u mozgu. UNC13 proteini sadrže forbol, ester vezujući C1 domen i dva C2 domena

Hartz (2012) je mapirala gen UNC13C na hromosomu 15, sekvence q21.3, na osnovu poravnanja sekvence UNC13C (GenBank AK054981) sa genomskom sekvencom (GRCh37). Može imati ulogu u sazrijevanju vezikula tokom egzocitoze, kao meta puta drugog glasnika diacilglicerola. Može biti uključen u regulaciju sinaptsnog prenosa na paralelnim sinapsama vlakna – Purkinjeove ćelije (po sličnosti).

Kod sisara, proteini Munc13 tvore porodicu od tri receptora forbol-estera, prvenstveno specifičnih za mozak receptora forbol estera (Munc13-1/2/3) . Munc13-1 je komponenta presinapsnih aktivnih zona u kojima djeluje kao osnovni protein sinapse, koji puni vezikulu. Za razliku od Munc13-1, koji je prisutan u većini neurona u CNS-u pacova i miša, Munc13-3 je gotovo isključivo eksprimiran u malom mozgu. iRNK Munc13-3 je prisutna u granulama i Purkinjeovim ćelijama, ali nema je u ćelijama glije. Protein Munc13-3 lokaliziran je u sinapsnom neuropilu molekulskog sloja malog mozga, ali ga nema u dendritima Purkinjeovih ćelija, što ukazuje na to da je Munc13-3, poput Munc13-1, presinapsnii protein u paralelnim sinapsama vlakna – Purkinjeovih ćelija. Da bi se ispitala ulogu Munc13-3 u cerebelarnoj fiziologiji, generirani su mutirani miševi s nedostatkom Munc13-3. Delecijski mutanti Munc13-3 pokazuju povećanu olakšanost uparenog pulsa u paralelnim sinapsama vlakna-Purkinjeove ćelije. Pored toga, mutirani miševi pokazuju normalnu spontanu motornu aktivnost, ali imaju oštećenu sposobnost učenja složenih motornih zadataka. Ti podaci pokazuju da Munc13-3 regulira sinapanii prenos u paralelnim sinapsama vlakno – Purkinjeove ćelije. Predloženo je da Munc13-3 djeluje u sličnom koraku ciklusa sinapsnih vezikula kao i Munc13-1, iako s manje efikasnosti. S obzirom na sadašnje podatke i dobro uspostavljenu funkciju punjenja vezikula Munc13-1, vjerovatno je da gubitak Munc13-3 dovodi do smanjenja vjerovatnoće oslobađanja u paralelnim sinapsama vlakno – Purkinjeova ćelija, ometajući prajmeriranje vezikula. To bi zauzvrat dovelo do povećanja olakšavanja uparenog pulsa i moglo bi doprinijeti uočenom deficitu u učenju motornih funkcija.^[6]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 2.214 aminokiselina, a molekulska težina 250 911 Da.^[7].

10	20	30	40	50
MVANFFKSLI	LPYIHKLCKG	MFTKKLGNTN	KNKEYRQQKK	DQDFPTAGQT
KSPKFSYTFK	STVKKIAKCS	STHNLSTEED	EASKEFSLSP	TFSYRVAIAN
GLQKNAKVTN	SDNEDLLQEL	SSIESSYSES	LNELRSSTEN	QAQSTHTMPV
RRNRKSSSSL	APSEGSSDGE	RTLHGLKLGA	LRKLRKWKKS	QECVSSDSEL
STMKKSWGIR	SKSLDRTVRN	PKTNALEPGF	SSSGCISQTH	DVMEMIFKEL
QGISQIETEL	SELRGHVNAL	KHSIDEISSS	VEVVQSEIEQ	LRTGFVQSRR
ETRDIHDYIK	HLGHMGSKAS	LRFLNVTEER	FEYVESVVYQ	ILIDKMGFSD
APNAIKIEFA	QRIGHQRDCP	NAKPRPILVY	FETPQQRDSV	LKKSYKLKGT
GIGISTDILT	HDIRERKEKG	IPSSQTYESM	AIKLSTPEPK	IKKNNWQSPD
DSDEDLESDL	NRNSYAVLSK	SELLTKGSTS	KPSSKSHSAR	SKNKTANSSR
ISNKSDYDKI	SSQLPESDIL	EKQTTTHYAD	ATPLWHSQSD	FFTAKLSRSE
SDFSKLCQSY	SEDFSENQFF	TRTNGSSLLS	SSDRELWQRK	QEGTATLYDS
PKDQHLNGGV	QGIQGQTETE	NTETVDSGMS	NGMVCASGDR	SHYSDSQLSL
HEDLSPWKEW	NQGADLGLDS	STQEGFDYET	NSLFDQQLDV	YNKDLEYLGK
CHSDLQDDSE	SYDLTQDDNS	SPCPGLDNEP	QGQWVGQYDS	YQGANSNELY
QNQNQLSMMY	RSQSELQSDD	SEDAPPKSWH	SRLSIDLSDK	TFSFPKFGST
LQRAKSALEV	VWNKSTQSLS	GYEDSGSSLM	GRFRTLSQST	ANESSTTLDS
DVYTEPYYYK	AEDEEDYTEP	VADNETDYVE	VMEQVLAKLE	NRTSITETDE
QMQAYDHLSY	ETPYETPQDE	GYDGPADDMV	SEEGLEPLNE	TSAEMEIRED
ENQNIPEQPV	EITKPKRIRP	SFKEAALRAY	KKQMAELEEK	ILAGDSSSVD
EKARIVSGND	LDASKFSALQ	VCGGAGGGLY	GIDSMPDLRR	KKTLPIVRDV
AMTLAARKSG	LSLAMVIRTS	LNNEELKMHV	FKKTLQALIY	PMSSTIPHNF
EVWTATTPTY	CYECEGLLWG	IARQGMKCLE	CGVKCHEKCQ	DLLNADCLQR
AAEKSSKHGA	EDKTQTIITA	MKERMKIREK	NRPEVFEVIQ	EMFQISKEDF
VQFTKAAKQS	VLDGTSKWSA	KITITVVSAQ	GLQAKDKTGS	SDPYVTVQVG
KNKRRTKTIF	GNLNPVWDEK	FYFECHNSTD	RIKVRVWDED	DDIKSRVKQH
FKKESDDFLG	QTIVEVRTLS	GEMDVWYNLE	KRTDKSAVSG	AIRLKINVEI
KGEEKVAPYH	IQYTCLHENL	FHYLTEVKSN	GGVKIPEVKG	DEAWKVFFDD
ASQEIVDEFA	MRYGIESIYQ	AMTHFSCLSS	KYMCPGVPAV	MSTLLANINA
FYAHTTVSTN	IQVSASDRFA	ATNFGREKFI	KLLDQLHNSL	RIDLSKYREN
FPASNTERLQ	DLKSTVDLLT	SITFFRMKVL	ELQSPPKASM	VVKDCVRACL
DSTYKYIFDN	CHELYSQLTD	PSKKQDIPRE	DQGPTTKNLD	FWPQLITLMV
TIIDEDKTAY	TPVLNQFPQE	LNMGKISAEI	MWTLFALDMK	YALEEHENQR
LCKSTDYMNL	HFKVKWFYNE	YVRELPAFKD	AVPEYSLWFE	PFVMQWLDEN
EDVSMEFLHG	ALGRDKKDGF	QQTSEHALFS	CSVVDVFAQL	NQSFEIIKKL
ECPNPEALSH	LMRRFAKTIN	KVLLQYAAIV	SSDFSSHCDK	ENVPCILMNN
IQQLRVQLEK	MFESMGGKEL	DSEASTILKE	LQVKLSGVLD	ELSVTYGESF
QVIIEECIKQ	MSFELNQMRA	NGNTTSNKNS	AAMDAEIVLR	SLMDFLDKTL
SLSAKICEKT	VLKRVLKELW	KLVLNKIEKQ	IVLPPLTDQT	GPQMIFIAAK
DLGQLSKLKE	HMIREDARGL	TPRQCAIMEV	VLATIKQYFH	AGGNGLKKNF
LEKSPDLQSL	RYALSLYTQT	TDALIKKFID	TQTSQSRSSK	DAVGQISVHV
DITATPGTGD	HKVTVKVIAI	NDLNWQTTAM	FRPFVEVCIL	GPNLGDKKRK
QGTKTKSNTW	SPKYNETFQF	ILGKENRPGA	YELHLSVKDY	CFAREDRIIG
MTVIQLQNIA	EKGSYGAWYP	LLKNISMDET	GLTILRILSQ	RTSDDVAKEF
VRLKSETRST	EESA

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

Kloniranje i ekspresija

Augustin et al. (2001) klonirali su mišji Unc13c, kojeg su nazvali Munc13-3. Hibridizacija in situ otkrila je istaknutu ekspresiju Unc13c samo u malom mozgu, sa najvećom obiljem u sloju zrnastih ćelija. Imunohistohemijska analiza otkrila je protein Unc13c gotovo isključivo u molekulskom sloju, u kojem paralelna aksonaka vlakana granulastih ćelija završavaju na dendritima neurona Purkinjeovih ćelija. Western blot analizom mišjeg mozga, otkriven je Unc13c pri prividnoj molekulskoj masi od preko 200 kD

Životinjski model

Augustin i dr. (2001) dobili su Munc13-3 miševe genotipa – /– u očekivanom mendelovskom omjeru. Miševi M unc13-3 – /– nisu pokazivali očite fizičke abnormalnosti ili poremećaje u ponašanju, bili su plodni i imali su normalan životni vijek. Anatomske, morfološke i ultrastrukturne analize cerebeluma Munc13-3 – /– otkrile su normalnu raspodjelu i gustinu nervnih ćelija, sa ukupnom strukturom koja se ne razlikuje od kontrola divljeg tipa. Snimke spojnog sloja otkrile su samo značajan porast olakšavanja uparenih impulsa na Munc13-3 –/– paralelnim sinapsama vlakno-Purkinjeova ćelija, sa normalnom amplitudom, vremenom porasta i učestalošću spontanih inhibitornih postsinapsnih odgovora. Detaljna analiza motornog učenja otkrila je značajan deficit motoričkog kod Munc13-3 –/– miševa, u poređenju sa divljim tipom, tek kada je zadatak postajao sve teži. Zaključili su da je MUNC13-3 regulator paralelnih sinapsi Purkinjeovih ćelija.^[8]

Reference

1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000137766 - Ensembl, maj 2017
1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000062151 - Ensembl, maj 2017
↑ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ "Entrez Gene: Unc-13 homolog C (C. elegans)". Pristupljeno 11. 4. 2016.
↑ Iris Augustin, Stefan Korte, Michael Rickmann, Hans A. Kretzschmar, Thomas C. Südhof, Jochen W. Herms, Nils Brose (2001): The Cerebellum-Specific Munc13 Isoform Munc13-3 Regulates Cerebellar Synaptic Transmission and Motor Learning in Mice. Journal of Neuroscience 1 January 2001, 21 (1) 10-17; DOI: https://doi.org/10.1523/JNEUROSCI.21-01-00010.2001
↑ "UniProt, Q8NB66". Pristupljeno 17. 7. 2021.
↑ Augustin, I., Korte, S., Rickmann, M., Kretzschmar, H. A., Sudhof, T. C., Herms, J. W., Brose, N. The cerebellum-specific Munc13 isoform Munc13-3 regulates cerebellar synaptic transmission and motor learning in mice. J. Neurosci. 21: 10-17, 2001. PubMed: 11150314

Dopunska literatura

Uhl GR, Liu QR, Drgon T, Johnson C, Walther D, Rose JE, David SP, Niaura R, Lerman C (2008). "Molecular genetics of successful smoking cessation: convergent genome-wide association study results". Arch. Gen. Psychiatry. 65 (6): 683–93. doi:10.1001/archpsyc.65.6.683. PMC 2430596. PMID 18519826.

[refGRCh38Ensembl-1] 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000137766 - Ensembl, maj 2017

[refGRCm38Ensembl-2] 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000062151 - Ensembl, maj 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-5] "Entrez Gene: Unc-13 homolog C (C. elegans)". Pristupljeno 11. 4. 2016.

[6] Iris Augustin, Stefan Korte, Michael Rickmann, Hans A. Kretzschmar, Thomas C. Südhof, Jochen W. Herms, Nils Brose (2001): The Cerebellum-Specific Munc13 Isoform Munc13-3 Regulates Cerebellar Synaptic Transmission and Motor Learning in Mice. Journal of Neuroscience 1 January 2001, 21 (1) 10-17; DOI: https://doi.org/10.1523/JNEUROSCI.21-01-00010.2001

[UniProt-7] "UniProt, Q8NB66". Pristupljeno 17. 7. 2021.

[8] Augustin, I., Korte, S., Rickmann, M., Kretzschmar, H. A., Sudhof, T. C., Herms, J. W., Brose, N. The cerebellum-specific Munc13 isoform Munc13-3 regulates cerebellar synaptic transmission and motor learning in mice. J. Neurosci. 21: 10-17, 2001. PubMed: 11150314

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]