VTA1

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
VTA1
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2LXL, 2LXM, 4TXP, 4TXQ, 4TXR, 4U7E

Identifikatori
AliasiVTA1
Vanjski ID-jeviOMIM: 610902 MGI: 1913451 HomoloGene: 6473 GeneCards: VTA1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 6 (čovjek)
Hrom.Hromosom 6 (čovjek)[1]
Hromosom 6 (čovjek)
Genomska lokacija za VTA1
Genomska lokacija za VTA1
Bend6q24.1-q24.2Početak142,147,162 bp[1]
Kraj142,224,685 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 10 (miš)
Hrom.Hromosom 10 (miš)[2]
Hromosom 10 (miš)
Genomska lokacija za VTA1
Genomska lokacija za VTA1
Bend10|10 A2Početak14,530,499 bp[2]
Kraj14,581,304 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija protein C-terminus binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta citoplazma
citosol
endozom
endosome membrane
Egzosom
membrana
nukleoplazma
intracellular membrane-bounded organelle
Biološki proces protein transport
endosomal transport
multivesicular body assembly
GO:0019067 viral life cycle
multivesicular body sorting pathway
ESCRT III complex disassembly
macroautophagy
GO:0015915 transport
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_016485
NM_001286371
NM_001286372

NM_025418

RefSeq (bjelančevina)

NP_001273300
NP_001273301
NP_057569

NP_079694

Lokacija (UCSC)Chr 6: 142.15 – 142.22 MbChr 10: 14.53 – 14.58 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Sortiranjem pridruženi VTA1 homolog vakuolskog proteina jest protein koji je kod ljudi kodiran genom VTA1.[5][6]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 307 aminokiselina, а molekulska težina 33.879 Da.[7]

1020304050
MAALAPLPPLPAQFKSIQHHLRTAQEHDKRDPVVAYYCRLYAMQTGMKID
SKTPECRKFLSKLMDQLEALKKQLGDNEAITQEIVGCAHLENYALKMFLY
ADNEDRAGRFHKNMIKSFYTASLLIDVITVFGELTDENVKHRKYARWKAT
YIHNCLKNGETPQAGPVGIEEDNDIEENEDAGAASLPTQPTQPSSSSTYD
PSNMPSGNYTGIQIPPGAHAPANTPAEVPHSTGVASNTIQPTPQTIPAID
PALFNTISQGDVRLTPEDFARAQKYCKYAGSALQYEDVSTAVQNLQKALK
LLTTGRE

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000009844 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000019868 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Shi J, Cai W, Chen X, Ying K, Zhang K, Xie Y (Aug 2001). "Identification of dopamine responsive mRNAs in glial cells by suppression subtractive hybridization". Brain Res. 910 (1–2): 29–37. doi:10.1016/S0006-8993(01)02393-9. PMID 11489251. S2CID 43814085.
  6. ^ "Entrez Gene: C6orf55 chromosome 6 open reading frame 55".
  7. ^ "UniProt, Q9NP79" (jezik: engleski). Pristupljeno 9. 10. 2021.

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]