CCAT1

CCAT1
Identifikatori
Aliasi	CCAT1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 617705 GeneCards: CCAT1
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	100507056	n/a
Ensembl	n/a	n/a
UniProt	n a	n/a
RefSeq (mRNK)	n/a	n/a
RefSeq (bjelančevina)	n/a	n/a
Lokacija (UCSC)	n/a	n/a
PubMed pretraga		n/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Transkript 1 pridružen raku debelog crijeva je dugolančana nekodirajuća RNK koja kod ljudi kodirana genom CCAT1.

Ovaj gen proizvodi dugolančanu nekodirajuću RNK koja podstiče stvaranje tumora i pojačano je regulirana u raku debelog crijeva i ćelijama drugih tipova raka. Ovaj transkript može regulirati hromosomske interakcije dugog dometa, uključujući i na lokusu Myc onkoproteina. Ova RNK može funkcionirati i kao molekulska spužva za mikroRNK-e.

Vitalne uloge dugolančanihih nekodirajućih RNK (incRNK) uključene su u sve veći broj studija o razvoju tumora. LncRNK CCAT1 prepoznata je kao povezana s razvojem tumora, ali njena veza s kolorektumskim karcinomom (CRC) ostaje nedokučiva. Jedno istraživanje imalo za cilj rasvijetliti funkciju i mehanizme duge nekodirajuće RNK CCAT1 u CRC-u. Iz skupa podataka lncRNK profila od 38 parova podudarnih tkiva debelog crijeva za kontrolu tumora pacijenata sa kolorektumskom terapijom smještenih u Atlasu genoma raka (TCGA), otkriveno je 10 reguliranih i 10 podregulitanih lncRNK u CRC-u. Pedeset slučajeva pacijenata s CRC -om bilo je uključeno radi analize korelacije između ekspresije CCAT1 i kliničke patologije. Inverzna korelacija ekspresije i ciljne veze između CCAT1 i miR181a-5p potvrđena je pomoću qRT-PCR i testa reporterskog gena s dvostrukom luciferazom.

Održivost ćelija, sposobnost formiranja kolonija, agresivnost i apoptoza određivani su MTT-testom, testom formiranja kolonija, Transwell testovima i analizama zacjeljivanja rana, te analizom protočne citometrije. Nadalje, korišten je model ksenotransplantata. za pokazivanje da obaranje CCAT1 inhibira rast tumora in vivo. Ekspresija lncRNK CCAT1 značajno je povećana u tkivima CRC-a. Ekspresija CCAT1 pozitivno je povezana sa stadijem raka (American Joint Committee on Cancer stage, p<0,05). CCAT1 je promovirao ćelijsku proliferaciju, rast i pokretljivost ciljajući miR-181a-5p, a utišanost CCAT1 povećala je učestalost apoptoza. Isti učinak primijećen je u in vivo modelu ksentranplantata, pri čemu su veličina tumora i protivtumorskih proteina značajno smanjeni nokdaunom CCAT1.

Dopunska literatura

• Yang F, Xue X, Bi J, Zheng L, Zhi K, Gu Y, Fang G (2013). "Long noncoding RNA CCAT1, which could be activated by c-Myc, promotes the progression of gastric carcinoma". J. Cancer Res. Clin. Oncol. 139 (3): 437–45. doi:10.1007/s00432-012-1324-x. PMID 23143645. S2CID 667876.
• Alaiyan B, Ilyayev N, Stojadinovic A, Izadjoo M, Roistacher M, Pavlov V, Tzivin V, Halle D, Pan H, Trink B, Gure AO, Nissan A (2013). "Differential expression of colon cancer associated transcript1 (CCAT1) along the colonic adenoma-carcinoma sequence". BMC Cancer. 13: 196. doi:10.1186/1471-2407-13-196. PMC 3639026. PMID 23594791.
• Xiang JF, Yin QF, Chen T, Zhang Y, Zhang XO, Wu Z, Zhang S, Wang HB, Ge J, Lu X, Yang L, Chen LL (2014). "Human colorectal cancer-specific CCAT1-L lncRNA regulates long-range chromatin interactions at the MYC locus". Cell Res. 24 (5): 513–31. doi:10.1038/cr.2014.35. PMC 4011346. PMID 24662484.
• Luo J, Tang L, Zhang J, Ni J, Zhang HP, Zhang L, Xu JF, Zheng D (2014). "Long non-coding RNA CARLo-5 is a negative prognostic factor and exhibits tumor pro-oncogenic activity in non-small cell lung cancer". Tumour Biol. 35 (11): 11541–9. doi:10.1007/s13277-014-2442-7. PMID 25129441. S2CID 17249302.
• Ma MZ, Chu BF, Zhang Y, Weng MZ, Qin YY, Gong W, Quan ZW (2015). "Long non-coding RNA CCAT1 promotes gallbladder cancer development via negative modulation of miRNA-218-5p". Cell Death Dis. 6: e1583. doi:10.1038/cddis.2014.541. PMC 4669740. PMID 25569100.
• Zhang Y, Ma M, Liu W, Ding W, Yu H (2014). "Enhanced expression of long noncoding RNA CARLo-5 is associated with the development of gastric cancer". Int J Clin Exp Pathol. 7 (12): 8471–9. PMC 4314006. PMID 25674211.
• Cabanski CR, White NM, Dang HX, Silva-Fisher JM, Rauck CE, Cicka D, Maher CA (2015). "Pan-cancer transcriptome analysis reveals long noncoding RNAs with conserved function". RNA Biol. 12 (6): 628–42. doi:10.1080/15476286.2015.1038012. PMC 4615893. PMID 25864709.
• Deng L, Yang SB, Xu FF, Zhang JH (2015). "Long noncoding RNA CCAT1 promotes hepatocellular carcinoma progression by functioning as let-7 sponge". J. Exp. Clin. Cancer Res. 34: 18. doi:10.1186/s13046-015-0136-7. PMC 4339002. PMID 25884472.
• Zhu H, Zhou X, Chang H, Li H, Liu F, Ma C, Lu J (2015). "CCAT1 promotes hepatocellular carcinoma cell proliferation and invasion". Int J Clin Exp Pathol. 8 (5): 5427–34. PMC 4503117. PMID 26191246.