PHAX

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
PHAX
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2XC7

Identifikatori
AliasiPHAX
Vanjski ID-jeviOMIM: 604924 MGI: 1891839 HomoloGene: 10558 GeneCards: PHAX
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 5 (čovjek)
Hrom.Hromosom 5 (čovjek)[1]
Hromosom 5 (čovjek)
Genomska lokacija za PHAX
Genomska lokacija za PHAX
Bend5q23.2Početak126,600,925 bp[1]
Kraj126,627,252 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 18 (miš)
Hrom.Hromosom 18 (miš)[2]
Hromosom 18 (miš)
Genomska lokacija za PHAX
Genomska lokacija za PHAX
Bend18 D3|18 30.63 cMPočetak56,695,515 bp[2]
Kraj56,720,784 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
toxic substance binding
vezivanje sa RNK
Ćelijska komponenta nukleoplazma
Cajal body
jedro
citosol
neuronal cell body
citoplazma
centrosom
Biološki proces protein transport
snRNA export from nucleus
snRNA transcription by RNA polymerase II
nuclear export
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_032177

NM_001162989
NM_019996

RefSeq (bjelančevina)

NP_115553

NP_001156461
NP_064380

Lokacija (UCSC)Chr 5: 126.6 – 126.63 MbChr 18: 56.7 – 56.72 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Eksportni protein fosforiliziranog adaptera RNK jest protein koji je kod ljudi kodiran genom PHAX sa hromosoma 5.[5][6]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 394 aminokiseline, а molekulska težina 44.403 Da.[7]

1020304050
MALEVGDMEDGQLSDSDSDMTVAPSDRPLQLPKVLGGDSAMRAFQNTATA
CAPVSHYRAVESVDSSEESFSDSDDDSCLWKRKRQKCFNPPPKPEPFQFG
QSSQKPPVAGGKKINNIWGAVLQEQNQDAVATELGILGMEGTIDRSRQSE
TYNYLLAKKLRKESQEHTKDLDKELDEYMHGGKKMGSKEEENGQGHLKRK
RPVKDRLGNRPEMNYKGRYEITAEDSQEKVADEISFRLQEPKKDLIARVV
RIIGNKKAIELLMETAEVEQNGGLFIMNGSRRRTPGGVFLNLLKNTPSIS
EEQIKDIFYIENQKEYENKKAARKRRTQVLGKKMKQAIKSLNFQEDDDTS
RETFASDTNEALASLDESQEGHAEAKLEAEEAIEVDHSHDLDIF

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000164902 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000008301 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Ohno M, Segref A, Bachi A, Wilm M, Mattaj IW (maj 2000). "PHAX, a mediator of U snRNA nuclear export whose activity is regulated by phosphorylation". Cell. 101 (2): 187–98. doi:10.1016/S0092-8674(00)80829-6. PMID 10786834. S2CID 8938256.
  6. ^ "Entrez Gene: RNUXA RNA U, small nuclear RNA export adaptor (phosphorylation regulated)".
  7. ^ "UniProt, Q9H814" (jezik: engleski). Pristupljeno 18. 10. 2021.

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]