TECPR1

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
TECPR1
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

4TQ1

Identifikatori
AliasiTECPR1
Vanjski ID-jeviOMIM: 614781 MGI: 1917631 HomoloGene: 9120 GeneCards: TECPR1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 7 (čovjek)
Hrom.Hromosom 7 (čovjek)[1]
Hromosom 7 (čovjek)
Genomska lokacija za TECPR1
Genomska lokacija za TECPR1
Bend7q21.3Početak98,214,624 bp[1]
Kraj98,252,232 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 5 (miš)
Hrom.Hromosom 5 (miš)[2]
Hromosom 5 (miš)
Genomska lokacija za TECPR1
Genomska lokacija za TECPR1
Bend5|5 G2Početak144,131,260 bp[2]
Kraj144,160,433 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
phosphatidylinositol-3-phosphate binding
lipid binding
Ćelijska komponenta integral component of membrane
lysosomal membrane
autophagosome membrane
Lizozom
GO:0016023 citoplazmatska vezikula
membrana
nukleoplazma
intracellular membrane-bounded organelle
Biološki proces Autofagija
GO:0000046 autophagosome maturation
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_015395

NM_027410
NM_001356992
NM_001356993

RefSeq (bjelančevina)

NP_056210

NP_081686
NP_001343921
NP_001343922

Lokacija (UCSC)Chr 7: 98.21 – 98.25 MbChr 5: 144.13 – 144.16 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Tektonin sa beta-propelerskim ponavljanjem 1 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom TECPR1.[5]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 1.165 aminokiselina, а molekulska težina 129.696 Da.[6]

1020304050
MPNSVLWAVDLFGRVYTLSTAGQYWEMCKDSQLEFKRVSATTQCCWGIAC
DNQVYVYVCASDVPIRRREEAYENQRWNPMGGFCEKLLLSDRWGWSDVSG
LQHRPLDRVALPSPHWEWESDWYVDENFGGEPTEKGGWTYAIDFPATYTK
DKKWNSCVRRRKWIRYRRYKSRDIWAKIPSKDDPKELPDPFNDLSVGGWE
ITEEPVGRLSVWAVSLQGKVWYREDVSHSNPEGSSWSLLDTPGEVVQISC
GPHDLLWATLWEGQALVREGINRSNPKGSSWSIVEPPGSENGVMHISVGV
SVVWAVTKDWKVWFRRGVNSHNPCGTSWIEMVGEMTMVNVGMNDQVWGIG
CEDRAVYFRQGVTPSELSGKTWKAIIAARECDRSHSGSSSSLLSAGCFFG
DEVRGSGESAPSDTDASSEVERPGPGQILPAEPLDDSKNATGNSASGLGA
GRTAEDTVEDACPAEGSREARPNTHPGPAPTPAELPWTNIDLKEAKKVPS
HSAAGFPETTSLSSLGLLPLGLEEPYGVDDHPLWAWVSGGGCVVEACAMP
RWFTVQAGLSSSVHMLSLSITPAQTAAWRKQIFQQLTERTKRELENFRHY
EQAVEQSVWVKTGALQWWCDWKPHKWVDVRLALEQFTGHDGVRDSILFIY
YVVHEEKKYIHIFLNEVVALVPVLNETKHSFALYTPERTRQRWPVRLAAA
TEQDMNDWLALLSLSCCESRKVQGRPSPQAIWSITCKGDIFVSEPSPDLE
AHEHPLPCDQMFWRQMGGHLRMVEANSRGVVWGIGYDHTAWVYTGGYGGG
CFQGLASSTSNIYTQSDVKCVHIYENQRWNPVTGYTSRGLPTDRYMWSDA
SGLQECTKAGTKPPSLQWAWVSDWFVDFSVPGGTDQEGWQYASDFPASYH
GSKTMKDFVRRRCWARKCKLVTSGPWLEVPPIALRDVSIIPESPGAEGSG
HSIALWAVSDKGDVLCRLGVSELNPAGSSWLHVGTDQPFASISIGACYQV
WAVARDGSAFYRGSVYPSQPAGDCWYHIPSPPRQRLKQVSAGQTSVYALD
ENGNLWYRQGITPSYPQGSSWEHVSNNVCRVSVGPLDQVWVIANKVQGSH
SLSRGTVCHRTGVQPHEPKGHGWDYGIGGGWDHISVRANATRAPRSSSQE
QEPSAPPEAHGPVCC

Funkcija[uredi | uredi izvor]

Ovaj gen kodira faktor vezivanja uključen u autofagiju. Kodirani protein nalazi se na autolizosomima i uključen je u ciljanje proteinskih agregata, oštećenih mitohondrija i bakterijskih patogena za autofagiju.

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000205356 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000066621 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: Tectonin beta-propeller repeat containing 1". Pristupljeno 3. 1. 2017.
  6. ^ "UniProt, Q7Z6L1" (jezik: engleski). Pristupljeno 29. 9. 2021.