TMEM126B

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
TMEM126B
Identifikatori
AliasiTMEM126B
Vanjski ID-jeviOMIM: 615533 MGI: 1915722 HomoloGene: 10222 GeneCards: TMEM126B
Ontologija gena
Molekularna funkcija• GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
• molekularna funkcija
Ćelijska komponenta• integral component of membrane
• mitochondrial inner membrane
• membrana
• mitochondrial membranes
• mitohondrija
• ćelijska komponenta
Biološki proces• mitochondrial respiratory chain complex I assembly
• GO:0022610 biološki proces
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez

55863

68472

Ensembl

ENSG00000171204

n/a

UniProt

Q8IUX1

Q9D1R1

RefSeq (mRNK)

NM_001193537
NM_001193538
NM_001256546
NM_001256547
NM_018480

NM_026734

RefSeq (bjelančevina)
NP_001180466
NP_001180467
NP_001243475
NP_001243476
NP_060950

NP_001337322
NP_001337323
NP_001337324
NP_001337325

NP_081010

Lokacija (UCSC)n/an/a
PubMed pretraga[1][2]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Transmembranski protein 126B je protein koji je kod ljudi kodiran genom TMEM126B.[3][4] MEM126B je mitohondrijski transmembranski protein koji je komponenta sklopa mitohondrijskog kompleksa I. Gen TMEM126B konzerviran je kod sisaraa.[5]

Kodirani protein služi kao sastavni faktor koji je potreban za formiranje membranskog kraka kompleksa. Stupa u interakciju s NADH dehidrogenazama ubikinon 1 alfa potkompleksnog faktora sastavljanja 13. Prirodno prisutne mutacije u ovom genu povezane su s nedostatkom izoliranog kompleksa I. Pseudogen ovog gena je definiran na hromosomu 9.[3]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 230 aminokiselina, а molekulska težina 25.943 Da.[6]

1020304050
MVVFGYEAGTKPRDSGVVPVGTEEAPKVFKMAASMHGQPSPSLEDAKLRR
PMVIEIIEKNFDYLRKEMTQNIYQMATFGTTAGFSGIFSNFLFRRCFKVK
HDALKTYASLATLPFLSTVVTDKLFVIDALYSDNISKENCVFRSSLIGIV
CGVFYPSSLAFTKNGRLATKYHTVPLPPKGRVLIHWMTLCQTQMKLMAIP
LVFQIMFGILNGLYHYAVFEETLEKTIHEE
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

Struktura[uredi | uredi izvor]

TMEM126B se nalazi na q kraku hromosoma 11, na poziciji q14.1 i ima sedamegzona.[3] Gen TMEM126B proizvodi protein od 4,6 kDa, sastavljen od 54 aminokiseline.[7][8] Dio je kompleksa mitohondrija l kompleksa I sklopa (MCIA), sastavljen od NDUFAF1, ECSIT i ACAD9 (po sličnosti). Povezuje se sa međukompleksom od 370 kDa, nepotpuno sastavljenog kompleksa I.[9] Kompleks I sastoji se od 45 evolucijski konzerviranih jezgarnih podjedinica, uključujući i mitohondrijsku DNK i jedarno kodirane podjedinice. Jedan njegov krak je ugrađen u unutrašnju mitohondrijsku membranu, a drugi je u organelu. Dva kraka su raspoređena u obliku slova L. Ukupna molekulska težina kompleksa je 1MDa.[10] Prikaz predviđene orijentacije TMEM126B unutar ćelijske membrane, okvirno zasnovan na fosforilaciji,[11] i podacima o hidrofobnosti, prikazan je ispod.[12]

Funkcija[uredi | uredi izvor]

Gen TMEM126B kodira mitohondrijski transmembranski protein koji je komponenta kompleksa sklopa mitohondrijskog kompleksa I. Kodirani protein služi kao sklopni faktor koji je potreban za formiranje membranskog kraka kompleksa.[3] TMEM126B se kombinira s drugim faktorima sastavljanja uključujući ACAD9, CIA30 i ECSIT. U nedostatku TMEM126B, takvi faktori sastavljanja nisu regrutirani u mitohondrijsku membranu i nisu sudjelovali u sastavljanju kompleksa I. Poznato je da disfunkcija TMEM126B uzrokuje nekoliko komplikacija u kompleksu I, koje karakteriziraju ozbiljne poteškoće u mitohondrijskom disanju i potpuni neuspjeh sklopa kompleksa I. Međutim, nije poznato da ima značajan uticaj na sklopove mitohondrijskih kompleksa III, IV i V.[13]

Otkriće[uredi | uredi izvor]

TMEM126B je prvi put otkriven u istraživanju ekspresije proteina u tkivima hipotalamusno-hipofizno-nadbubrežne osovine, pomoću potpunog kloniranja cDNK.[4] Od tada je otkriven u drugim tkivima.[14]

Gen[uredi | uredi izvor]

Kod ljudi, TMEM126B se nalazi na hromosomu 11, uz bok sledećih gena:[15]

Translacija[uredi | uredi izvor]

Konceptna translacija proteina TMEM126B, uključujući projekciju sekundarne strukture,[18] predviđanja transmembranskih regija,[12] i fosforilacije[11] i glikacijskih mjesta[19] nalaze se ispod:

Tkivna distribucija[uredi | uredi izvor]

TMEM126B se eksprimira u većini tipova tkiva, sa značajnim izuzecima, kao što su masno tkivo, uho, tkivo grkljana, limfa, nervno tkivo, hipofiza, slezena, timus, štitnjača, dušnik i pupčana vrpca.[20] Također je visoko eksprimirann u tkivu paratiroideje, koštane srži i mokraćnog mjehura.[20] Također postoje dokazi da je jedna od izoformi TMEM126B eksprimirana u ćelijskoj membrani u memorijskim B-ćelijama adaptivnom imunskom sistemu.[21]

Predviđena svojstva[uredi | uredi izvor]

Sljedća svojstva TMEM126B predviđena su pomoću bioinformatičke analize:

Interakcije[uredi | uredi izvor]

Osim kopodjedinica za kompleks I, TMEM126B ima interakcije protein-protein sa ECSIT, NDUFAF1, NDUFC2, NDUFA13 i drugima.[9]

Klinički značaj[uredi | uredi izvor]

Poznato je da mutacije u "TMEM126B" rezultiraju mitohondrijskim bolestima i povezanim poremećajima. Uglavnom su povezane s nedostatkom kompleksa I, nedostatkom u prvom kompleksu mitohondrijskog respiratornog lanca.[3] Nedostatak kompleksa I koji uključuje disfunkciju mitohondrijskog respiratornog lanca može uzrokovati širok raspon kliničkih manifestacija, od smrtonosne neonatusne bolesti, do neurodegenerativnih poremećaja u odraslih. Fenotipovi uključuju makrocefaliju s progresivnom leukodistrofijom, nespecifičnu encefalopatiju, kardiomiopatiju, Leighov sindrom, miopatiju, bolest jetre, Leberovu nasljednu optičku neuropatiju i neke oblike Parkinsonova bolesti.[9] Osim nedostatka kompleksa I, mutacije "TMEM126B" pokazuju povezanost s teškim višesistemskim poremećajima u djetinjstvu, kao što su hronični zatajenje bubrega i kardiomiopatija i miopatija u djetinjstvu ili odrasloj dobi.[13]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  2. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ a b c d e "Entrez Gene: transmembrane protein 126B".
  4. ^ a b Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, et al. (august 2000). "Gene expression profiling in the human hypothalamus-pituitary-adrenal axis and full-length cDNA cloning". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 97 (17): 9543–8. Bibcode:2000PNAS...97.9543H. doi:10.1073/pnas.160270997. PMC 16901. PMID 10931946.
  5. ^ "HomoloGene Results: TMEM126B transmembrane protein 126B".
  6. ^ "UniProt, Q8IUX1". Pristupljeno 28. 8. 2021.
  7. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, et al. (oktobar 2013). "Integration of cardiac proteome biology and medicine by a specialized knowledgebase". Circulation Research. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
  8. ^ Yao, Daniel. "Cardiac Organellar Protein Atlas Knowledgebase (COPaKB) —— Protein Information". amino.heartproteome.org. Arhivirano s originala, 28. 7. 2018. Pristupljeno 27. 7. 2018.
  9. ^ a b c "Complex I assembly factor TMEM126B, mitochondrial". www.uniprot.org (jezik: engleski). Pristupljeno 27. 7. 2018.
  10. ^ Rhein VF, Carroll J, Ding S, Fearnley IM, Walker JE (juli 2016). "NDUFAF5 Hydroxylates NDUFS7 at an Early Stage in the Assembly of Human Complex I". The Journal of Biological Chemistry. 291 (28): 14851–60. doi:10.1074/jbc.M116.734970. PMC 4938201. PMID 27226634.
  11. ^ a b c "NetPhos 2.0 predictions for TMEM126B". Arhivirano s originala, 6. 3. 2012. Pristupljeno 28. 8. 2021.
  12. ^ a b Persson B, Argos P (mart 1994). "Prediction of transmembrane segments in proteins utilising multiple sequence alignments". Journal of Molecular Biology. 237 (2): 182–92. doi:10.1006/jmbi.1994.1220. PMID 8126732.
  13. ^ a b Alston CL, Compton AG, Formosa LE, Strecker V, Oláhová M, Haack TB, et al. (juli 2016). "Biallelic Mutations in TMEM126B Cause Severe Complex I Deficiency with a Variable Clinical Phenotype". American Journal of Human Genetics. 99 (1): 217–27. doi:10.1016/j.ajhg.2016.05.021. PMC 5005451. PMID 27374774.
  14. ^ Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, et al. (decembar 2002). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
  15. ^ "TMEM126B in Map Viewer".
  16. ^ "Entrez Gene: TMEM126A transmembrane protein 126A".
  17. ^ "OMIM Zhangfei protein".
  18. ^ Burgess AW, Ponnuswamy PK, Sheraga HA (1974). "Analysis of conformations of amino acid residues and prediction of backbone topography in proteins". Israel Journal of Chemistry. 12 (1–2): 239–286. doi:10.1002/ijch.197400022.
  19. ^ a b "NetGlycate 1.0 predictions for TMEM126B". Arhivirano s originala, 6. 3. 2012. Pristupljeno 28. 8. 2021.
  20. ^ a b "EST profile - Hs.525063".
  21. ^ "CELLS BELONGING TO THE ADAPTIVE IMMUNE SYSTEM THAT EXPRESS PAQ ISOFORM OF TMEM126B".[mrtav link]
  22. ^ Brendel V, Bucher P, Nourbakhsh IR, Blaisdell BE, Karlin S (mart 1992). "Methods and algorithms for statistical analysis of protein sequences". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 89 (6): 2002–6. Bibcode:1992PNAS...89.2002B. doi:10.1073/pnas.89.6.2002. PMC 48584. PMID 1549558.
  23. ^ a b "PI Program (Isoelectric Point Prediction)". Arhivirano s originala, 26. 10. 2008.
  24. ^ Bendtsen JD, Nielsen H, von Heijne G, Brunak S (juli 2004). "Improved prediction of signal peptides: SignalP 3.0". Journal of Molecular Biology. 340 (4): 783–95. CiteSeerX 10.1.1.165.2784. doi:10.1016/j.jmb.2004.05.028. PMID 15223320.

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]

Preuzeto iz "https://bs.wikipedia.org/w/index.php?title=TMEM126B&oldid=3511246"