TP53BP2

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
TP53BP2
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1YCS, 2UWQ, 4A63, 4IRV

Identifikatori
AliasiTP53BP2
Vanjski ID-jeviOMIM: 602143 MGI: 2138319 HomoloGene: 3959 GeneCards: TP53BP2
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 1 (čovjek)
Hrom.Hromosom 1 (čovjek)[1]
Hromosom 1 (čovjek)
Genomska lokacija za TP53BP2
Genomska lokacija za TP53BP2
Bend1q41Početak223,779,893 bp[1]
Kraj223,845,954 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 1 (miš)
Hrom.Hromosom 1 (miš)[2]
Hromosom 1 (miš)
Genomska lokacija za TP53BP2
Genomska lokacija za TP53BP2
Bend1 H5|1 84.93 cMPočetak182,236,737 bp[2]
Kraj182,289,997 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje identičnih proteina
p53 binding
SH3 domain binding
NF-kappaB binding
Ćelijska komponenta perinuklearno područje citoplazme
jedro
citoplazma
mitohondrija
nukleoplazma
citosol
međućelijske veze
Biološki proces ćelijski ciklus
negative regulation of cell cycle
positive regulation of execution phase of apoptosis
GO:0072468 Transdukcija signala
intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator
GO:0097285 apoptoza
positive regulation of neuron death
regulation of signal transduction by p53 class mediator
regulation of apoptotic process
positive regulation of protein insertion into mitochondrial membrane involved in apoptotic signaling pathway
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001031685
NM_005426

NM_173378

RefSeq (bjelančevina)

NP_001026855
NP_005417

NP_775554

Lokacija (UCSC)Chr 1: 223.78 – 223.85 MbChr 1: 182.24 – 182.29 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Apoptozno-stimulirajući protein 2 p53 (ASPP2), znan i kao Bcl2-vezujući protein (Bbp) i tumor supresorski p53-vezujući protein 2 (p53BP2), jest protein koji je kod ljudi kodiran genom sa hromosoma 1.[5][6][7] Za ovaj gen je pronađeno više varijanti transkripta koje kodiraju različite izoforme.

Nomenklatura[uredi | uredi izvor]

ASPP2 (aminokiselinski ostaci 600 –1128) prvobitno je identifikovan kao 53BP2 (p53-vezujući protein 2) u pregledu dvohibridnog kvasca, koristeći p53 kao mamac.[6] Još jedno ispitivanje dvohibridnog kvasca u kojem je Bcl-2 korišten kao mamac doveo je do otkrića drugog fragmenta ASPP2 (ostaci 123-1128) i nazvan je Bbp.[5][8]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 1. 128 aminokiselina, a molekulska težina 125.616 Da.[9].

1020304050
MMPMFLTVYLSNNEQHFTEVPVTPETICRDVVDLCKEPGESDCHLAEVWC
GSERPVADNERMFDVLQRFGSQRNEVRFFLRHERPPGRDIVSGPRSQDPS
LKRNGVKVPGEYRRKENGVNSPRMDLTLAELQEMASRQQQQIEAQQQLLA
TKEQRLKFLKQQDQRQQQQVAEQEKLKRLKEIAENQEAKLKKVRALKGHV
EQKRLSNGKLVEEIEQMNNLFQQKQRELVLAVSKVEELTRQLEMLKNGRI
DSHHDNQSAVAELDRLYKELQLRNKLNQEQNAKLQQQRECLNKRNSEVAV
MDKRVNELRDRLWKKKAALQQKENLPVSSDGNLPQQAASAPSRVAAVGPY
IQSSTMPRMPSRPELLVKPALPDGSLVIQASEGPMKIQTLPNMRSGAASQ
TKGSKIHPVGPDWSPSNADLFPSQGSASVPQSTGNALDQVDDGEVPLREK
EKKVRPFSMFDAVDQSNAPPSFGTLRKNQSSEDILRDAQVANKNVAKVPP
PVPTKPKQINLPYFGQTNQPPSDIKPDGSSQQLSTVVPSMGTKPKPAGQQ
PRVLLSPSIPSVGQDQTLSPGSKQESPPAAAVRPFTPQPSKDTLLPPFRK
PQTVAASSIYSMYTQQQAPGKNFQQAVQSALTKTHTRGPHFSSVYGKPVI
AAAQNQQQHPENIYSNSQGKPGSPEPETEPVSSVQENHENERIPRPLSPT
KLLPFLSNPYRNQSDADLEALRKKLSNAPRPLKKRSSITEPEGPNGPNIQ
KLLYQRTTIAAMETISVPSYPSKSASVTASSESPVEIQNPYLHVEPEKEV
VSLVPESLSPEDVGNASTENSDMPAPSPGLDYEPEGVPDNSPNLQNNPEE
PNPEAPHVLDVYLEEYPPYPPPPYPSGEPEGPGEDSVSMRPPEITGQVSL
PPGKRTNLRKTGSERIAHGMRVKFNPLALLLDSSLEGEFDLVQRIIYEVD
DPSLPNDEGITALHNAVCAGHTEIVKFLVQFGVNVNAADSDGWTPLHCAA
SCNNVQVCKFLVESGAAVFAMTYSDMQTAADKCEEMEEGYTQCSQFLYGV
QEKMGIMNKGVIYALWDYEPQNDDELPMKEGDCMTIIHREDEDEIEWWWA
RLNDKEGYVPRNLLGLYPRIKPRQRSLA

Struktura[uredi | uredi izvor]

ASPP2 sadrži nekoliko strukturnih i funkcionalnih domena. Njegov N-terminal (ostaci 1–83) ima strukturu nabora nalik na β-list ubikvitina.[10][11] Prati ga predviđeni α-helikalni domen koji se nalazi između aa 123 i 323.[5] i domen bogata prolinom (ASPP2 Pro) između aa 674 i 902.[5] C-terminalni dio ASPP2 sadrži četiri ankirinska ponavljanja i domen SH3, uključene u interakcije protein-protein.[11][12] ASPP2 nalazi se u perijedarnoj regiji citoplazme.[13][14]

Funkcija[uredi | uredi izvor]

ASPP2 ima centralnu ulogu u regulaciji apoptoze i ćelijskog rasta, putem svojih interakcija. ASPP2 regulira TP53, tako što poboljšava vezu i funkciju transaktivacije DNK u TP53 na promotorima proapoptoznih gena in vivo.[8] ASPP2 se vezuje zap53, divljeg tipa, ali ne uspijeva da se veže za mutanta p53, što sugeriše da ASPP2 može biti uključen u sposobnost divljeg tipa p53 za suzbijanje transformacija.[6] ASPP2 inducira apoptozu, ali nema zaustavljanja ćelijskog ciklusa.[8]

Članovi porodice[uredi | uredi izvor]

Porodica ASPP uključuje ASPP1, ASPP2 i iASPP. Naziv ASPP je skraćenica za protein p53 koji stimulira apoptozu, naziv naglašava ankirinska ponavljanja, SH3 domena i domena bogateog prolinom koji karakterišu ovu porodicu.[8] Tri člana porodice potiču iz različitih gena, ali ASPP1 i ASPP2 dijele veću sličnost sekvenci nego iASPP jer N-kraj iASPP-a nema homologiju sa ASPP1 i ASPP2. Sličnosti sekvenci među članovima porodice ASPP ukazuju da ASPP1 i ASPP2 i vjeerovatno imaju slične biološke funkcije koje se razlikuju od iASPP.[15] Porodica ima ključnu ulogu u regulaciji apoptoze u unutrašnjim i vanjskim apoptotskim putevima.[8][16] ASPP1 i ASPP2 promovišu, dok iASPP inhibira apoptoze.[17]

Vezujući partneri[uredi | uredi izvor]

ASPP2 je član porodice ASPP sa najpoznatijim vezujućim partnerima. Prvo se znalo da se visoko konzervirani C-terminal vezuje za p53 preko svojih ankirinskih ponavljanja i domena SH3. U 1994., pomoću sistema dvohibridnog kvasca i nazvan je p53 vezujući protein 2 (53BP2).[6] Ostali partneri za vezivanje otkriveni su tokom godina, što ukazuje na važnost ankirinskog ponavljanja i SH3 domena za interakcije protein-protein. Neki od poznatih vezujućih partnera ASPP2 uključuju BCL2, p63, p73, jezgro proteina virusa hepatitisa C, amiloid-b-prekursorski protein koji vezuje protein 1 (APP-BP1) , DA-vezani protein (YAP), adenomsku polipozu coli 2 (APC2), RelA/p65, protein-fosfatauu 1 (PP1)[18] i NFκB (p65)[19]

Ekspresija[uredi | uredi izvor]

Ekspresija ASPP2 je kodirana genom TP53BP2 i nalazi se u dugom kraku hromosoma 1 na q42.1. Northern blot analize su pokazale da je ASPP2/53BP2 iRNK eksprimiran u mnogim ljudskim tkivima kao što su srce, mozak, placenta, pluća, jetra, skeletni mišići, bubrezi, pankreas, ali na različitim nivoima. Najviši nivo ekspresije ASPP2 otkriven je u skeletnom tkivu.[6][15]

Klinički značaj[uredi | uredi izvor]

ASPP2 je prvi put bio povezan sa ljudskim rakom kada se kristalna struktura u p53 vezujućem domenu vezala za C-terminal ankirinsko ponavljanje i SH3 domen od ASP2. Sve aminokiseline p53 koje su važne za vezivanje ASPP2 su mutirane kod ljudskih kancera.[15] Nivoi ekspresije ASPP2 povezani su sa ćelijskom osjetljivošću na apoptozu.[8] Značaj ASPP2 u ljudskim malignostima naglašen je studijama koje pokazuju da se regulacija ASPP2 obično nalazi u tumorskim i karcinomskim ćelijama koje eksprimiraju divlji tip p53, a u manjoj mjeri mutantni p53.[20][21] Naprimjer, otkriveno je da je reguliran u metastatskim i invazivnim ćelijama u poređenju sa normalnim epitelom dojke.[21] Pokazano je da vezivanje ASPP2 za bcl-2 i p53 i ometa progresiju ćelijskog ciklusa na G2-M,[5] kao i činjenicu da vezivanje ASPP2 za p53 mijenja konformaciju p53 i povećava vezivanje p53 za promotore proapoptotskih gena kao što su Bax i PIG-3, ali ne one G1-zadržan geni, kao što je p21waf1.[8][22] Jednonukleotidni polimorfizmi ASPP2 su takođe pokazali da su povezani sa predispozicijom za razvoj karcinoma želuca.[22] Ovo bi moglo biti zbog činjenice da je ASPP2 također tumorski supresor, kao i aktivator p53.[18]

Nivoi ekspresije ASPP2 su važni; visoki nivoi ekspresije imaju važnu ulogu u izazivanju apoptoza, nezavisno od p53, posredovane putem p63 i p73. Ekspresija je pojačana kao odgovor na oštećenje DNK.[23][24] S druge strane, utišavanje ekspresije ASPP2 metilacijom uočeno je u nekoliko ćelija ljudskog karcinoma.[20]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000143514 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026510 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b c d e Naumovski L, Cleary ML (Aug 1996). "The p53-binding protein 53BP2 also interacts with Bc12 and impedes cell cycle progression at G2/M". Mol Cell Biol. 16 (7): 3884–92. doi:10.1128/MCB.16.7.3884. PMC 231385. PMID 8668206.
  6. ^ a b c d e Iwabuchi K, Bartel PL, Li B, Marraccino R, Fields S (Jul 1994). "Two cellular proteins that bind to wild-type but not mutant p53". Proc Natl Acad Sci U S A. 91 (13): 6098–102. doi:10.1073/pnas.91.13.6098. PMC 44145. PMID 8016121.
  7. ^ "Entrez Gene: TP53BP2 tumor protein p53 binding protein, 2".
  8. ^ a b c d e f g Samuels-Lev Y, O'Connor DJ, Bergamaschi D, Trigiante G, Hsieh JK, Zhong S, Campargue I, Naumovski L, Crook T, Lu X (oktobar 2001). "ASPP proteins specifically stimulate the apoptotic function of p53". Mol Cell. 8 (4): 781–94. doi:10.1016/S1097-2765(01)00367-7. PMID 11684014.
  9. ^ "UniProt, Q13625" (jezik: engleski). Pristupljeno 15. 12. 2021.
  10. ^ Tidow H, Andreeva A, Rutherford TJ, Fersht AR (august 2007). "Solution structure of ASPP2 N-terminal domain (N-ASPP2) reveals a ubiquitin-like fold". J Mol Biol. 371 (4): 948–58. CiteSeerX 10.1.1.334.9857. doi:10.1016/j.jmb.2007.05.024. PMID 17594908.
  11. ^ a b Rotem S, Katz C, Benyamini H, Lebendiker M, Veprintsev D, Rüdiger S, Danieli T, Friedler A (april 2008). "The structure and interactions of the proline-rich domain of ASPP2". J Biol Chem. 283 (27): 18990–9. doi:10.1074/jbc.M708717200. PMID 18448430.
  12. ^ Gorina S, Pavletich NP (novembar 1996). "Structure of the p53 tumor suppressor bound to the ankyrin and SH3 domains of 53BP2". Science. 274 (5289): 1001–5. doi:10.1126/science.274.5289.1001. PMID 8875926. S2CID 29527713.
  13. ^ Nakagawa H, Koyama K, Murata Y, Morito M, Akiyama T, Nakamura Y (Jan 2000). "APCL, a central nervous system-specific homologue of adenomatous polyposis coli tumor suppressor, binds to p53-binding protein 2 and translocates it to the perinucleus". Cancer Res. 60 (1): 101–5. PMID 10646860.
  14. ^ Uhlmann-Schiffler H, Kiermayer S, Stahl H (maj 2009). "The DEAD box protein Ddx42p modulates the function of ASPP2, a stimulator of apoptosis". Oncogene. 28 (20): 2065–73. doi:10.1038/onc.2009.75. PMID 19377511.
  15. ^ a b c Trigiante G, Lu X (mart 2006). "ASPP [corrected] and cancer". Nature Reviews Cancer. 6 (3): 217–26. doi:10.1038/nrc1818. PMID 16498444.
  16. ^ Kobayashi S, Kajino S, Takahashi N, Kanazawa S, Imai K, Hibi Y, Ohara H, Itoh M, Okamoto T (mart 2005). "53BP2 induces apoptosis through the mitochondrial death pathway". Genes Cells. 10 (3): 253–60. doi:10.1111/j.1365-2443.2005.00835.x. PMID 15743414.
  17. ^ Benyamini H, Friedler A (March–April 2011). "The ASPP interaction network: electrostatic differentiation between pro- and anti-apoptotic proteins". J Mol Recognit. 24 (2): 266–74. doi:10.1002/jmr.1048. PMID 20623514. S2CID 23343851.
  18. ^ a b Vives V, Slee EA, Lu X (oktobar 2006). "ASPP2: a gene that controls life and death in vivo". Cell Cycle. 5 (19): 2187–90. doi:10.4161/cc.5.19.3266. PMID 16969108.
  19. ^ Yang JP, Hori M, Takahashi N, Kawabe T, Kato H, Okamoto T (septembar 1999). "NF-kappaB subunit p65 binds to 53BP2 and inhibits cell death induced by 53BP2". Oncogene. 18 (37): 5177–86. doi:10.1038/sj.onc.1202904. PMID 10498867.
  20. ^ a b Liu ZJ, Lu X, Zhang Y, Zhong S, Gu SZ, Zhang XB, Yang X, Xin HM (mart 2005). "Downregulated mRNA expression of ASPP and the hypermethylation of the 5'-untranslated region in cancer cell lines retaining wild-type p53". FEBS Lett. 579 (7): 1587–90. doi:10.1016/j.febslet.2005.01.069. PMID 15757645.
  21. ^ a b Sgroi DC, Teng S, Robinson G, LeVangie R, Hudson JR Jr, Elkahloun AG (novembar 1999). "In vivo gene expression profile analysis of human breast cancer progression". Cancer Res. 59 (22): 5656–61. PMID 10582678.
  22. ^ a b Ju H, Lee KA, Yang M, Kim HJ, Kang CP, Sohn TS, Rhee JC, Kang C, Kim JW (decembar 2005). "TP53BP2 locus is associated with gastric cancer susceptibility". Int J Cancer. 117 (6): 957–60. doi:10.1002/ijc.21281. PMID 15986435.
  23. ^ Bergamaschi D, Samuels Y, Jin B, Duraisingham S, Crook T, Lu X (februar 2004). "ASPP1 and ASPP2: common activators of p53 family members". Mol Cell Biol. 24 (3): 1341–50. doi:10.1128/MCB.24.3.1341-1350.2004. PMC 321425. PMID 14729977.
  24. ^ Slee EA, O'Connor DJ, Lu X (april 2004). "To die or not to die: how does p53 decide?". Oncogene. 23 (16): 2809–18. doi:10.1038/sj.onc.1207516. PMID 15077144.

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi[uredi | uredi izvor]