Domen hladnog šoka

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
CSD
Struktura rastvora jednolančane DNK-vezujućeg domena hladnog šoka (csd) ljudskog y-kutijskog proteina 1 (yb1) određene nmr (10 struktura s najnižom energijom)
Identifikatori
SimbolCSD

Domen hladnog šoka (CSD) – u molekulskoj vbiologiji – je proteinski domen od oko 70 aminokiselina, koji je pronađen i u prokariotkim i u eukariotskim DNK-vezanim proteinima.[1][2][3] Dio ovog domena vrlo je sličan RNP-1 RNK-vezanom motivu.[4]

Kada je Escherichia coli izložena padu temperature sa 37 na 10 stepeni Celzijusa, dolazi do faze kašnjenja od 4–5 sati, nakon čega se rast nastavlja sa smanjenim stopama.[5] Tokom lag faze (usporenog rasta), ekspresija oko 13 proteina, koji sadrže domene hladnog šoka, povećana je 2-10 puta.[6] Smatra se da ovi takozvani hladni šokovi proteina pomažu ćeliji da preživi na temperaturama nižim od optimalne temperature rasta, za razliku od proteina toplotnog šoka, koji pomažu ćeliji da preživi na temperaturama većim od optimalne, vjerovatno kondenzacijom hromosoma i organizacijom prokariotskog nukleoida.[5]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ Doniger J, Landsman D, Gonda MA, Wistow G (april 1992). "The product of unr, the highly conserved gene upstream of N-ras, contains multiple repeats similar to the cold-shock domain (CSD), a putative DNA-binding motif". New Biol. 4 (4): 389–95. PMID 1622933.
  2. ^ Wistow G (april 1990). "Cold shock and DNA binding". Nature. 344 (6269): 823–4. doi:10.1038/344823c0. PMID 2184368. S2CID 4307500.
  3. ^ Jones PG, Inouye M (mart 1994). "The cold-shock response--a hot topic". Mol. Microbiol. 11 (5): 811–8. doi:10.1111/j.1365-2958.1994.tb00359.x. PMID 8022259.
  4. ^ Landsman D (juni 1992). "RNP-1, an RNA-binding motif is conserved in the DNA-binding cold shock domain". Nucleic Acids Res. 20 (11): 2861–4. doi:10.1093/nar/20.11.2861. PMC 336933. PMID 1614871.
  5. ^ a b Obokata J, Ohme M, Hayashida N (oktobar 1991). "Nucleotide sequence of a cDNA clone encoding a putative glycine-rich protein of 19.7 kDa in Nicotiana sylvestris". Plant Mol. Biol. 17 (4): 953–5. doi:10.1007/bf00037080. PMID 1912512. S2CID 11927654.
  6. ^ Tafuri SR, Wolffe AP (novembar 1990). "Xenopus Y-box transcription factors: molecular cloning, functional analysis and developmental regulation". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87 (22): 9028–32. doi:10.1073/pnas.87.22.9028. PMC 55094. PMID 2247479.

Vanjski linkovi[uredi | uredi izvor]

Ovaj članak uključuje tekst iz javnog domena Pfam i InterPro: IPR002059