RTF2

RTF2
Dostupne strukture
PDB	Pretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova
	2BZE, 2DB9, 3U1U, 4L1P, 4L1U
Identifikatori
Aliasi	15890 RTF1, RTF2
Vanjski ID-jevi	OMIM: 611633 MGI: 1309480 HomoloGene: 133868 9501 GeneCards: RTF2 RTF1, RTF2
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 15 (čovjek)
Kraj	41,483,563 bp
Lokacija gena (miš)
Hrom.	Hromosom 2 (miš)
Kraj	119,735,407 bp
Obrazac RNK ekspresije
	51507/ Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine; • single-stranded DNA binding; • vezivanje sa DNK; • RNA polymerase II C-terminal domain phosphoserine binding; • vezivanje sa RNK; • molekularna funkcija;
Ćelijska komponenta	• Jedarce; • jedro; • Cdc73/Paf1 complex; • nukleoplazma; • ćelijska komponenta; • replication fork; • hromosom;
Biološki proces	• blastocyst growth; • GO:0071110, GO:0036413, GO:0036414 histone modification; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • histone H3-K4 trimethylation; • positive regulation of histone H3-K4 methylation; • transcription, DNA-templated; • Wnt-signalni put; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • stem cell population maintenance; • endodermal cell fate commitment; • transcription by RNA polymerase II; • transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • protein ubiquitination; • mitotic DNA replication termination; • site-specific DNA replication termination at RTS1 barrier; • GO:0022610 biološki proces; • cellular response to hydroxyurea; • regulation of DNA stability;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	23168,51507; 23168,51507
	76246
	ENSG00000137815; ENSG00000022277
	ENSMUSG00000027304
	Q92541; Q9BY42
	A2AQ19
	NM_015138; NM_001283035; NM_001283036; NM_001283037; NM_016407
	NM_030112
	NP_055953; NP_001269964; NP_001269965; NP_001269966; NP_057491
	NP_084388
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek	Pogledaj/uredi – miš

Replikacijski faktor terminacije je protein koji je kod ljudi kodiran genom RTF2 i pripada istoimenoj porodici proteina sa kompletnbom sekvencom DNK. Ovaj unos ima jednu opisanu i tri potencijalne izoforme, koje su računarski preslikane, prema FASTA.

Funkcija[uredi | uredi izvor]

Faktor replikacijske terminacije je komponenta produženog replisoma (vjerovatno). Potreban je za signalizaciju ATR puta, nakon oštećenja DNK i ima pozitivnu aktivnost tokom replikacije DNK. Može funkcionirati kako bi olakšao pauzu replikacijske viljuške na replikacijskim barijerama poput rDNK. Može biti globalno potreban za stimuliranje ATR signalizacije, nakon što se viljuške zaustave ili naiđu na leziju (vjerovatno). Interaktivan je sa DNK u nastajanju^[5]^[6]

Molekulska funkcija

Vezanje DNK

Biološki proces

ćelijski odgovor na hidroksiureu
terminacija replikacije mitotske DNK
regulacija stabilnosti DNK
terminacija replikacije DNK specifične lokacije na barijeri RTS1

Rasprostranjenje[uredi | uredi izvor]

Eukaryota
- Metazoa
  - Chordata
    - Craniata
  - Vertebrata: Euteleostomi > Mammalia > Eutheria

> Euarchontoglires > Primates > Haplorrhini > Catarrhini > Hominidae > Homo

Posttranslacijske modifikacije

Podvrgava se proteasomskoj degradaciji, putem DDI1 i DDI2. Za stabilnost genoma potrebni su uklanjanje zaustavljenih replisoma i razgradnja proteina 1.

Reference[uredi | uredi izvor]

^ ^a ^b ^c ENSG00000022277 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000137815, ENSG00000022277 - Ensembl, maj 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000027304 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ 29290612.
^ https://www.uniprot.org/uniprot/ RTF2 - Replication termination factor 2 - Homo sapiens (Human) - RTF2 gene & protein (uniprot.org)

[refGRCh38Ensembl-1] ENSG00000022277 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000137815, ENSG00000022277 - Ensembl, maj 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000027304 - Ensembl, maj 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[5] 29290612.

[6] ttps://www.uniprot.org/uniprot/ RTF2 - Replication termination factor 2 - Homo sapiens (Human) - RTF2 gene & protein (uniprot.org)

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]