ESF1

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
Idi na navigaciju Idi na pretragu
ESF1
Identifikatori
AliasiESF1
Vanjski ID-jeviMGI: 1913830 HomoloGene: 5717 GeneCards: ESF1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 20 (čovjek)
Hrom.Hromosom 20 (čovjek)[1]
Hromosom 20 (čovjek)
Genomska lokacija za ESF1
Genomska lokacija za ESF1
Bend20p12.1Početak13,714,322 bp[1]
Kraj13,784,919 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 2 (miš)
Hrom.Hromosom 2 (miš)[2]
Hromosom 2 (miš)
Genomska lokacija za ESF1
Genomska lokacija za ESF1
Bend2|2 F3Početak140,119,883 bp[2]
Kraj140,170,564 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
PBB GE ESF1 218859 s at fs.png
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija RNA binding
Ćelijska komponenta Jedarce
Jedro
Nukleoplazma
Vanćelijsko
Biološki proces regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
rRNA processing
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_016649
NM_001276380

NM_001081090

RefSeq (bjelančevina)

NP_001263309
NP_057733

NP_001074559

Lokacija (UCSC)Chr 20: 13.71 – 13.78 MbChr 2: 140.12 – 140.17 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Homolog ESF1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom ESF1.[5]

Funkcija[uredi | uredi izvor]

Oda et al. (2004) otkrili su da je pacovski Abtap komunicirao s Abt1 miša (618750) i potiskivao transkripciju induciranu Abt1 inhibiranjem vezanja između Abt1 i Tbp (600075) na način koji ovisi o dozi.[6] Pacov Abtap i miš Abt1 gotovo su se potpuno kolokalizirali kada su kotransticirani u ćelijama COS7. Međutim, subjedarna lokalizacija kompleksa Abt1 / Abtap regulirana je relativnom količinom svakog proteina u ćelijama. Kada je Abtap bio dominantan, oba proteina su bila lokalizirana u jedatnim tijelima, gdje je bio lokaliziran samo Abtap. Kada je Abt1 bio dominantan, oba proteina su se lokalizirala u nukleolusu i nukleoplazmi, gdje je bio samo Abt1. Koristeći analizu osiromašenja, Peng et al (2004) otkrili su da je Esf1 potreban za sintezu 18S rRNK i za obradu pre-rRNK u S. cerevisiae. Analiza čišćenja pokazala je da se Esf1 fizički povezuje sa ribosomnim proteinima, proteinima potrebnim za biogenezu malih podjedinica i snoRNK U3 (180710) i U14. Iscrpljivanje Esf1 nije utjecalo na biogenezu ili stabilnost snoRNK.[7]

Životinjski model[uredi | uredi izvor]

Koristeći fluorescentnu in situ hibridizaciju, Chen et al. (2018) [8] pokazali su da je mRNK ESF1-a eksprimirana u ždrijelnim lukovima i neuroepitelu zebrica. Homozigotne zebrice za krnji protein esf1 imale su oštećene hrskavice ždrijelnih lukova, uslijed povećane apoptoze ćelija nervnog grebena (NCC) u kranijskom živčanom grebenu i umrli su oko šest dana nakon oplodnje. Ekspresija divljeg tipa ESFN1 pune dužine održala je fenotip i obnovila formiranje hrskavica ždrijelnog luka. Povećana apoptozna oštećenja i hrskavice u mutiranih riba djelimično su posredovana preko regulirane signalizacije p53 (TP53; 191170). Esf1 je imao ulogu u migraciji, preživljavanju i diferencijaciji nervnog grebena, djelujući u NCC-ima na ćelijski-autonomni način. Ribe sa mutiranim esf1 također su pokazale nedostatke u biogenezi 18S rRNK i biogenezi ribosoma.

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000089048 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000045624 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: ESF1 ESF1, nucleolar pre-rRNA processing protein, homolog (S. cerevisiae)".
  6. ^ Oda, T., Fukuda, A., Hagiwara, H., Masuho, Y., Muramatsu, M., Hisatake, K.k, Yamashita, T. ABT1-associated protein (ABTAP), a novel nuclear protein conserved from yeast to mammals, represses transcriptional activation by ABT1. J. Cell. Biochem. 93: 788-806, 2004. PubMed: 15660422
  7. ^ Peng, W.-T., Krogan, N. J., Richards, D. P., Greenblatt, J. F., Hughes, T. R. ESF1 is required for 18S rRNA synthesis in Saccharomyces cerevisiae. Nucleic Acids Res. 32: 1993-1999, 2004. PubMed: 15056729
  8. ^ Chen, J.-Y., Tan, X., Wang, Z.-H., Liu, Y.-Z., Zhou, J.-F., Rong, X.-Z., Lu, L., Li, Y. The ribosome biogenesis protein Esf1 is essential for pharyngeal cartilage formation in zebrafish. FEBS J. 285: 3464-3484, 2018. PubMed: 30073783

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]