CNOT4

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
CNOT4
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1E4U, 1UR6

Identifikatori
AliasiCNOT4
Vanjski ID-jeviOMIM: 604911 MGI: 1859026 HomoloGene: 40870 GeneCards: CNOT4
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 7 (čovjek)
Hrom.Hromosom 7 (čovjek)[1]
Hromosom 7 (čovjek)
Genomska lokacija za CNOT4
Genomska lokacija za CNOT4
Bend7q33Početak135,361,795 bp[1]
Kraj135,510,127 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 6 (miš)
Hrom.Hromosom 6 (miš)[2]
Hromosom 6 (miš)
Genomska lokacija za CNOT4
Genomska lokacija za CNOT4
Bend6|6 B1Početak34,999,000 bp[2]
Kraj35,110,659 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0050372 aktivnost sa transferazom ubikvitina
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
nucleic acid binding
vezivanje iona metala
aktivnost sa transferazom
vezivanje sa RNK
Ćelijska komponenta citosol
citoplazma
CCR4-NOT complex
jedro
Biološki proces protein ubiquitination
nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
protein autoubiquitination
DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest
nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
ubiquitin-dependent protein catabolic process
regulation of megakaryocyte differentiation
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)
NM_001008225
NM_001190847
NM_001190848
NM_001190849
NM_001190850

NM_013316
NM_001393370
NM_001393371
NM_001393372
NM_001393373
NM_001393374
NM_001393375

NM_001164411
NM_001164412
NM_001164413
NM_001164414
NM_016877

RefSeq (bjelančevina)
NP_001008226
NP_001177776
NP_001177777
NP_001177778
NP_001177779

NP_037448

NP_001157883
NP_001157884
NP_001157885
NP_001157886
NP_058573

Lokacija (UCSC)Chr 7: 135.36 – 135.51 MbChr 6: 35 – 35.11 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Podjedinica 4 CCR4-NOT transkripcijskog kompleksa je protein koji je kod ljudi kodiran genom CNOT4.[5]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 575 aminokiselina, а molekulska težina 63.510 Da.[6]

1020304050
MSRSPDAKEDPVECPLCMEPLEIDDINFFPCTCGYQICRFCWHRIRTDEN
GLCPACRKPYPEDPAVYKPLSQEELQRIKNEKKQKQNERKQKISENRKHL
ASVRVVQKNLVFVVGLSQRLADPEVLKRPEYFGKFGKIHKVVINNSTSYA
GSQGPSASAYVTYIRSEDALRAIQCVNNVVVDGRTLKASLGTTKYCSYFL
KNMQCPKPDCMYLHELGDEAASFTKEEMQAGKHQEYEQKLLQELYKLNPN
FLQLSTGSVDKNKNKVTPLQRYDTPIDKPSDSLSIGNGDNSQQISNSDTP
SPPPGLSKSNPVIPISSSNHSARSPFEGAVTESQSLFSDNFRHPNPIPSG
LPPFPSSPQTSSDWPTAPEPQSLFTSETIPVSSSTDWQAAFGFGSSKQPE
DDLGFDPFDVTRKALADLIEKELSVQDQPSLSPTSLQNSSSHTTTAKGPG
SGFLHPAAATNANSLNSTFSVLPQRFPQFQQHRAVYNSFSFPGQAARYPW
MAFPRNSIMHLNHTANPTSNSNFLDLNLPPQHNTGLGGIPVAGEEEVKVS
TMPLSTSSHSLQQGQQPTSLHTTVA

Funkcija[uredi | uredi izvor]

Protein kodiran ovim genom podjedinica je kompleksa CCR4-NOT, globalnog transkripcijskog regulatora i deadenilazatora. Kodirani protein stupa u interakciju s CNOT1 i ima aktivnost ubikvitin-ligaza. Za ovaj gen pronađeno je nekoliko varijanti transkripta, koje kodiraju različite izoforme. (prema bRefSeq, juli 2010). Bolesti povezane sa CNOT4 uključuju adenoiditis.[7]

Reference[uredi | uredi izvor]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000080802 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038784 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: CCR4-NOT transcription complex, subunit 4".
  6. ^ "UniProt, O95628" (jezik: engleski). Pristupljeno 23. 9. 2021.
  7. ^ "CNOT4 Gene - GeneCards | CNOT4 Protein | CNOT4 Antibody". www.genecards.org. Pristupljeno 21. 6. 2019.

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]