GSDMB

GSDMB
Identifikatori
Aliasi	GSDMB
Vanjski ID-jevi	OMIM: 611221 HomoloGene: 88856 GeneCards: GSDMB
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 17 (čovjek)
Kraj	39,919,854 bp
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• molekularna funkcija; • phosphatidylserine binding; • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding; • phosphatidylinositol-4-phosphate binding;
Ćelijska komponenta	• citoplazma; • citosol; • ćelijska membrana; • membrana; • ćelijska komponenta;
Biološki proces	• GO:0010703, GO:0010702 programirana ćelijska smrt; • GO:0022610 biološki proces; • Piroptoza;
	Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
	55876
	n/a
	ENSG00000073605
	n/a
	Q8TAX9
	n/a
	NM_001042471; NM_001165958; NM_001165959; NM_018530; NM_001369402
	n/a
	NP_001035936; NP_001159430; NP_001159431; NP_061000; NP_001356331
	n/a
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Gasdermin B jest protein koji je kod ljudi kodiran genom GSDMB sa hromosoma 17.^[3]

Aminokiselinska sekvenca[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 411 aminokiselina, a molekulska težina 46.786 Da.^[3]

C: Cistein

D: Asparaginska kiselina

E: Glutaminska kiselina

F: Fenilalanin

G: Glicin

H: Histidin

I: Izoleucin

K: Lizin

L: Leucin

M: Metionin

N: Asparagin

P: Prolin

Q: Glutamin

R: Arginin

S: Serin

T: Treonin

V: Valin

W: Triptofan

Y: Tirozin

10	20	30	40	50
MFSVFEEITR	IVVKEMDAGG	DMIAVRSLVD	ADRFRCFHLV	GEKRTFFGCR
HYTTGLTLMD	ILDTDGDKWL	DELDSGLQGQ	KAEFQILDNV	DSTGELIVRL
PKEITISGSF	QGFHHQKIKI	SENRISQQYL	ATLENRKLKR	ELPFSFRSIN
TRENLYLVTE	TLETVKEETL	KSDRQYKFWS	QISQGHLSYK	HKGQREVTIP
PNRVLSYRVK	QLVFPNKETM	SAGLDIHFRG	KTKSFPEGKS	LGSEDSRNMK
EKLEDMESVL	KDLTEEKRKD	VLNSLAKCLG	KEDIRQDLEQ	RVSEVLISGE
LHMEDPDKPL	LSSLFNAAGV	LVEARAKAIL	DFLDALLELS	EEQQFVAEAL
EKGTLPLLKD	QVKSVMEQNW	DELASSPPDM	DYDPEARILC	ALYVVVSILL
ELAEGPTSVS	S

Funkcija[uredi | uredi izvor]

Ovaj gen kodira člana porodice proteina koji sadrži gasderminski domen. Drugi geni iz porodice gasdermina uključeni su u regulaciju apoptoze u epitelnim ćelijama i povezani su sa rakom. Za ovaj gen je pronađeno više varijanti transkripta koje kodiraju različite izoforme. Opisane su dodatne varijante, ali one su kandidati za besmisleno posredovano raspadanje iRNK (NMD) i malo je vjerovatno da će kodirati proteine.

Reference[uredi | uredi izvor]

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000073605 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ ^a ^b "Entrez Gene: Gasdermin B". Pristupljeno 26. 8. 2016.

Dopunska literatura[uredi | uredi izvor]

Katoh M, Katoh M (2004). "Evolutionary recombination hotspot around GSDML-GSDM locus is closely linked to the oncogenomic recombination hotspot around the PPP1R1B-ERBB2-GRB7 amplicon". Int. J. Oncol. 24 (4): 757–63. doi:10.3892/ijo.24.4.757. PMID 15010812.

Ovaj članak uključuje tekst iz Nacionalne medicinske biblioteke Sjedinjenih Država, koji je u javnom vlasništvu.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000073605 - Ensembl, maj 2017

[2] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-3] "Entrez Gene: Gasdermin B". Pristupljeno 26. 8. 2016.

[1]

[2]

[3]