Idi na sadržaj

NXPH3

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
NXPH3
Identifikatori
AliasiNXPH3
Vanjski ID-jeviOMIM: 604636 MGI: 1336188 HomoloGene: 5227 GeneCards: NXPH3
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 17 (čovjek)
Hrom.Hromosom 17 (čovjek)[1]
Hromosom 17 (čovjek)
Genomska lokacija za NXPH3
Genomska lokacija za NXPH3
Bend17q21.33Početak49,575,871 bp[1]
Kraj49,583,827 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 11 (miš)
Hrom.Hromosom 11 (miš)[2]
Hromosom 11 (miš)
Genomska lokacija za NXPH3
Genomska lokacija za NXPH3
Bend11|11 DPočetak95,400,671 bp[2]
Kraj95,405,396 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija signaling receptor binding
molekularna funkcija
Ćelijska komponenta extracellular region
Biološki proces neuropeptide signaling pathway
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_007225

NM_130858

RefSeq (bjelančevina)

NP_009156

NP_570928

Lokacija (UCSC)Chr 17: 49.58 – 49.58 MbChr 11: 95.4 – 95.41 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Neureksofilin-3 je protein koji je kod ljudi kodiran genom NXPH3.[5][6]

Dužina polipeptidnog lanca je 252 aminokiseline, sa molekulskom težinom od 28.127[7].

Aminokiselinska sekvenca

Simboli
1020304050
MQLTRCCFVFLVQGSLYLVICGQDDGPPGSEDPERDDHEGQPRPRVPRKR
GHISPKSRPMANSTLLGLLAPPGEAWGILGQPPNRPNHSPPPSAKVKKIF
GWGDFYSNIKTVALNLLVTGKIVDHGNGTFSVHFQHNATGQGNISISLVP
PSKAVEFHQEQQIFIEAKASKIFNCRMEWEKVERGRRTSLCTHDPAKICS
RDHAQSSATWSCSQPFKVVCVYIAFYSTDYRLVQKVCPDYNYHSDTPYYP
SG

Kloniranje i ekspresija

[uredi | uredi izvor]

Neureksofilin sisara otkriven je kao 29-kD neuronski glikoprotein koji se u čvrstom kompleksu prečišćava sa neureksinom I-alfa (Petrenko et al., 1996). Pretražujući baze podataka o sekvencama, koristeći aminokiselinsku sekvencu neureksofilina sisara kao upit, Missler i Sudhof (1998) identificirali su ljudske EST-ove koji odgovaraju neureksofilinima-1 (NXPH1), –2 (NXPH2), –3 (NXPH3) i – 4 (NXPH4). Usporedba aminokiselinskih sekvenci neureksofilina čovjeka, pacova, miša i goveda otkrila je da neureksofilini imaju zajedničku predviđanu strukturu, koja se sastoji od pet domena: N-terminalni signalni peptid, varijabilni N-terminalni domen, visoko konzervirani centralni domen koji je N-glikoziliran, kratka vezana regija i konzervirani C-terminalni domen bogat cisteinom. Northern blot analiza različitih ljudskih tkiva otkrila je ekspresiju NXPH3 gotovo specifičnu za mozak. Zaključili su da neureksofilini tvore porodicu srodnih glikoproteina koji se proteolitski obrađuju nakon sinteze. Sugerirali su da su neureksofilini signalne molekule, koje podsjećaju na neuropeptide djelujuči vezanjem za alfa-neureksine i druge moguće receptore.[8][9]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000182575 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000046719 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Missler M, Sudhof TC (Jun 1998). "Neurexophilins form a conserved family of neuropeptide-like glycoproteins". J Neurosci. 18 (10): 3630–8. doi:10.1523/JNEUROSCI.18-10-03630.1998. PMC 6793134. PMID 9570794.
  6. ^ "Entrez Gene: NXPH3 neurexophilin 3".
  7. ^ "UniProt, O95157". Pristupljeno 12. 9. 2017.
  8. ^ Missler, M., Sudhof, T. C. Neurexophilins form a conserved family of neuropeptide-like glycoproteins. J. Neurosci. 18: 3630-3638, 1998. [PubMed]: 9570794
  9. ^ Petrenko, A. G., Ullrich, B., Missler, M., Krasnoperov, V., Rosahl, T. W., Sudhof, T. C. Structure and evolution of neurexophilin. J. Neurosci. 16: 4360-4369, 1996. [PubMed]: 8699246

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]