NXPH3
| NXPH3 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | NXPH3 | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | OMIM: 604636 MGI: 1336188 HomoloGene: 5227 GeneCards: NXPH3 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 17: 49.58 – 49.58 Mb | Chr 11: 95.4 – 95.41 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Neureksofilin-3 je protein koji je kod ljudi kodiran genom NXPH3.[5][6]
Dužina polipeptidnog lanca je 252 aminokiseline, sa molekulskom težinom od 28.127[7].
Aminokiselinska sekvenca
- Simboli
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MQLTRCCFVF | LVQGSLYLVI | CGQDDGPPGS | EDPERDDHEG | QPRPRVPRKR | ||||
| GHISPKSRPM | ANSTLLGLLA | PPGEAWGILG | QPPNRPNHSP | PPSAKVKKIF | ||||
| GWGDFYSNIK | TVALNLLVTG | KIVDHGNGTF | SVHFQHNATG | QGNISISLVP | ||||
| PSKAVEFHQE | QQIFIEAKAS | KIFNCRMEWE | KVERGRRTSL | CTHDPAKICS | ||||
| RDHAQSSATW | SCSQPFKVVC | VYIAFYSTDY | RLVQKVCPDY | NYHSDTPYYP | ||||
| SG |
Kloniranje i ekspresija
[uredi | uredi izvor]Neureksofilin sisara otkriven je kao 29-kD neuronski glikoprotein koji se u čvrstom kompleksu prečišćava sa neureksinom I-alfa (Petrenko et al., 1996). Pretražujući baze podataka o sekvencama, koristeći aminokiselinsku sekvencu neureksofilina sisara kao upit, Missler i Sudhof (1998) identificirali su ljudske EST-ove koji odgovaraju neureksofilinima-1 (NXPH1), –2 (NXPH2), –3 (NXPH3) i – 4 (NXPH4). Usporedba aminokiselinskih sekvenci neureksofilina čovjeka, pacova, miša i goveda otkrila je da neureksofilini imaju zajedničku predviđanu strukturu, koja se sastoji od pet domena: N-terminalni signalni peptid, varijabilni N-terminalni domen, visoko konzervirani centralni domen koji je N-glikoziliran, kratka vezana regija i konzervirani C-terminalni domen bogat cisteinom. Northern blot analiza različitih ljudskih tkiva otkrila je ekspresiju NXPH3 gotovo specifičnu za mozak. Zaključili su da neureksofilini tvore porodicu srodnih glikoproteina koji se proteolitski obrađuju nakon sinteze. Sugerirali su da su neureksofilini signalne molekule, koje podsjećaju na neuropeptide djelujuči vezanjem za alfa-neureksine i druge moguće receptore.[8][9]
Reference
[uredi | uredi izvor]- 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000182575 - Ensembl, maj 2017
- 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000046719 - Ensembl, maj 2017
- ↑ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ↑ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ↑ Missler M, Sudhof TC (Jun 1998). "Neurexophilins form a conserved family of neuropeptide-like glycoproteins". J Neurosci. 18 (10): 3630–8. doi:10.1523/JNEUROSCI.18-10-03630.1998. PMC 6793134. PMID 9570794.
- ↑ "Entrez Gene: NXPH3 neurexophilin 3".
- ↑ "UniProt, O95157". Pristupljeno 12. 9. 2017.
- ↑ Missler, M., Sudhof, T. C. Neurexophilins form a conserved family of neuropeptide-like glycoproteins. J. Neurosci. 18: 3630-3638, 1998. [PubMed]: 9570794
- ↑ Petrenko, A. G., Ullrich, B., Missler, M., Krasnoperov, V., Rosahl, T. W., Sudhof, T. C. Structure and evolution of neurexophilin. J. Neurosci. 16: 4360-4369, 1996. [PubMed]: 8699246
Dopunska literatura
[uredi | uredi izvor]- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Zhang Z, Henzel WJ (2005). "Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites". Protein Sci. 13 (10): 2819–24. doi:10.1110/ps.04682504. PMC 2286551. PMID 15340161.
- Clark HF, Gurney AL, Abaya E, et al. (2003). "The secreted protein discovery initiative (SPDI), a large-scale effort to identify novel human secreted and transmembrane proteins: a bioinformatics assessment". Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Hirosawa M, Nagase T, Ishikawa K, et al. (2000). "Characterization of cDNA clones selected by the GeneMark analysis from size-fractionated cDNA libraries from human brain". DNA Res. 6 (5): 329–36. doi:10.1093/dnares/6.5.329. PMID 10574461.
- Missler M, Hammer RE, Südhof TC (1999). "Neurexophilin binding to alpha-neurexins. A single LNS domain functions as an independently folding ligand-binding unit". J. Biol. Chem. 273 (52): 34716–23. doi:10.1074/jbc.273.52.34716. PMID 9856994.
- Petrenko AG, Ullrich B, Missler M, et al. (1996). "Structure and evolution of neurexophilin". J. Neurosci. 16 (14): 4360–9. doi:10.1523/JNEUROSCI.16-14-04360.1996. PMC 6578849. PMID 8699246.