Idi na sadržaj

GLOD4

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
GLOD4
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

3ZI1

Identifikatori
AliasiGLOD4
Vanjski ID-jeviMGI: 1914451 HomoloGene: 9376 GeneCards: GLOD4
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 17 (čovjek)
Hrom.Hromosom 17 (čovjek)[1]
Hromosom 17 (čovjek)
Genomska lokacija za GLOD4
Genomska lokacija za GLOD4
Bend17p13.3Početak757,097 bp[1]
Kraj783,390 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 11 (miš)
Hrom.Hromosom 11 (miš)[2]
Hromosom 11 (miš)
Genomska lokacija za GLOD4
Genomska lokacija za GLOD4
Bend11|11 B5Početak76,011,813 bp[2]
Kraj76,134,551 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija cadherin binding
Ćelijska komponenta Egzosom
mitohondrija
Biološki proces cell-cell adhesion
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_016080
NM_001366247
NM_001366248
NM_001366249
NM_001366250

NM_026029
NM_001362901

RefSeq (bjelančevina)

NP_057164
NP_001353176
NP_001353177
NP_001353178
NP_001353179

NP_080305
NP_001349830

Lokacija (UCSC)Chr 17: 0.76 – 0.78 MbChr 11: 76.01 – 76.13 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Protein 4 glioksalaznog domna je enzim koji je kod ljudi kodiran genom GLOD4.[5][6][7]

Alternativnom preradom transkripta mastaju tri izoforme kodiranog protreina.

  • Izoforma 1 (identifikator: Q9HC38-1) [UniParc] FASTA izabrana je kao kanonička sekvenca. Sve pozicijske informacije u ovom unosu odnose se na njih. Ovo je ujedno i sekvenca koja se pojavljuje u verzijama unosa za preuzimanje.
  • Izoforma 2 (identifikator: Q9HC38-2) [UniParc] FASTA razlikuje se od kanonske sekvence po nizu aminokiselina u rasponu 32-62.
  • Izoforma 3 (identifikator: Q9HC38-3) ima sekvencu koja razlikuje se od kanonskog slijeda na sljedeći način:
32-62:
197-203
204-313

Dužina polipeptidnog lanca je 313 aminokiselina, a molekulska težina 34.793 Da.[8]

1020304050
MAARRALHFVFKVGNRFQTARFYRDVLGMKVESCSVARLECSGAISAHCS
DYTRITEDSFSKPYDGKWSKTMVGFGPEDDHFVAELTYNYGVGDYKLGND
FMGITLASSQAVSNARKLEWPLTEVAEGVFETEAPGGYKFYLQNRSLPQS
DPVLKVTLAVSDLQKSLNYWCNLLGMKIYEKDEEKQRALLGYADNQCKLE
LQGVKGGVDHAAAFGRIAFSCPQKELPDLEDLMKRENQKILTPLVSLDTP
GKATVQVVILADPDGHEICFVGDEAFRELSKMDPEGSKLLDDAMAADKSD
EWFAKHNKPKASG

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000167699 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000017286 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Qin WX, Wan F, Sun FY, Zhang PP, Han LW, Huang Y, Jiang HQ, Zhao XT, He M, Ye Y, Cong WM, Wu MC, Zhang LS, Yang NW, Gu JR (Oct 2001). "Cloning and characterization of a novel gene (C17orf25) from the deletion region on chromosome 17p13.3 in hepatocelular carcinoma". Cell Res. 11 (3): 209–16. doi:10.1038/sj.cr.7290088. PMID 11642406.
  6. ^ Guo JY, Xu J, Mao Q, Fu LL, Gu JR, De Zhu J (Jan 2003). "The promoter analysis of the human C17orf25 gene, a novel chromosome 17p13.3 gene". Cell Res. 12 (5–6): 339–52. doi:10.1038/sj.cr.7290136. PMID 12528892.
  7. ^ "Entrez Gene: C17orf25 chromosome 17 open reading frame 25".
  8. ^ "UniProt, Q9HC38". Pristupljeno 21. 6. 2021.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]